|
|
Od trusu k prostřenému ubrusu. Molekulární analýza potravy raka signálního
ŠKRABÁNEK, Jan
Tato bakalářská práce měla za cíl analyzovat potravu raka signálního v Křesánovském potoce během roku 2020, v měsících od dubna do října. Dalším cílem bylo najít a otestovat vhodné markery pro analýzu potravy. Tyto markery jsou podrobněji popsány v textu této práce. Analyzovali jsme potravu raka signálního pomocí izolované DNA ze vzorků fekálních pelet odebíraných každý měsíc. Pomocí skupinově specifických DNA markerů jsme se zaměřili na klíčové potravní skupiny makrozoobenthosu. Tyto skupiny jsou Heptageniidae (markery Hpt28Sf + Hpt28Sr), Ephemeroptera (Epa28Sf + Epa28Sr), Integripalpia a Spicipalpia (Inspi18Sf + Inspi18Sr), Plecoptera (Ple-gen A269 + Ple-gen S268), Chironomidae (Chiro18Sf + Chiro18Sr) a Gammaridae (Gamae28Sf + Gamae28Sr). V potravě byla také analyzována makrofyta Characeae (CHA677 + CHA1681R) a dvouděložné rostliny (MYR152F + MYR1696R).Výsledky ukázaly, že potrava raka signálního se v průběhu sezóny měnila. Během celé sezóny byly nejčastější potravní skupinou Gammaridae, nalezené v 54,1 % vzorků fekálních pelet. Skupiny Heptageniidae, Integripalpia/Spicipalpia byly také hojně zastoupené (detekovány ve 31,3 % vzorků). Skupina Plecoptera se objevila ve 20,8 % vzorků fekálních pelet, zatímco Chironomidae a Characeae byly nalezeny v 10,4 %. Dvouděložné rostliny byly zastoupeny v 8,3 % vzorků. Nejméně početnou skupinou byly Ephemeroptera, které byla detekována pouze v jednom vzorku fekálních pelet (2,1 %).V dubnu byly Gammaridae nejvýznamnější složkou potravy, a Heptageniidae byli drouhou nejzastoupěnější skupinou.V květnu byla strava pestřejší, ale Gammaridae zůstaly hlavním zdrojem potravy (nalezeny v 6 vzorcích) následované Integripalpia/Spicipalpia (v 5 vzorcích). V červnu byly Gammaridae přítomny ve všech vzorcích, zatímco Heptageniidae a Integripalpia/Spicipalpia byly významné. V červenci byly Heptageniidae nejčastější potravní skupinou (v 5 vzorcích), druhou byly Gammaridae (nalezeny ve 4 vzorcích). V srpnu a říjnu nebyly ve vzorcích nalezeny žádné potravní skupiny, a v září byly Gammaridae přítomni pouze v jednom vzorku fekálních pelet. Celkově tato studie poskytuje přehled o sezónních změnách v potravě raka signálního a markerech určených pro její analýzu.
|
|
| |
|
| |
|
|
Identifikace alel pro zásobní proteiny obilky tritikale pomocí DNA markerů
Svojsíková, Nikola
Tritikale se řadí mezi amfiploidní druh obilnin a vzniklo křížením pšenice a žita. Jeho pekařská kvalita je podstatně horší, než je tomu u pšenice. Pekařská kvalita je určována jednotlivým složením a obsahem zásobních proteinů. Velký vliv na výslednou kvalitu těsta mají vysokomolekulární a nízkomolekulární gluteninové podjednotky. Mezi zásobní bílkoviny tritikale také patří žitné sekaliny, které působí na pekařskou jakost negativně. Proto byly vytvořeny linie, u kterých je translokován chromozom 1R a obsahují podjednotku Glu-D1d, která má pozitivní vliv na pekařskou jakost. Práce se věnuje identifikaci alelického složení lokusů vysokomolekulárních gluteninových podjednotek (HMW-GS), nízkomolekulárních gluteninových podjednotek (LMW-GS), lokusů Pina a Pinb a nulových alel Waxy genů. Pomocí DNA markerů založených na polymerázové řetězové reakci (PCR) bylo analyzováno celkem 23 vybraných genotypů tritikale. V jednotlivých lokusech HMW-GS (Glu-A1, Glu-B1, Glu-D1), LMW-GS (Glu-A3) a Pina-D1, Pinb-D1 bylo popsáno jejich alelické složení a byly detekovány nulové alely v lokusech Wx-A1 a Wx-B1.
|
|
|
Využití molekulárních markerů k rekonstrukci rodokmene polosesterských potomstev třešně ptačí
Jirková, Michaela ; Korecký, Jiří (vedoucí práce) ; Sedlák, Petr (oponent)
Cílem práce bylo s využitím mikrosatelitových markerů provést rekonstrukci rodokmene jedinců třešně ptačí (Prunus avium L.) pěstovaných pro potřeby založení výsadby polosesterských potomstev, tj. ověřit evidenční příslušnost matky a dohledat otce mezi klony zastoupenými v semenném sadu, případně odhalit paternální gametickou kontaminaci. Technicky došlo k převodu jedinců polosesterského potomstva na potomstvo plnosesterské. V rešeršní části byl proveden literární rozbor zaměřený na problematiku rekonstrukce rodokmene pomocí molekulárních markerů a rozebrána teorie šlechtitelského cyklu se zaměřením na testy potomstev, společně s popisem třešně ptačí jako druhu např. její morfologií, rozšíření či ekologií. Studie byla provedena na materiálu ze semenného sadu Obrovice, vlastník VLS s. p. (rodičovská populace) a sazenic vypěstovaných z těchto jedinců pro potřeby založení polosesterského testu potomstev v lesní školce Lhota. V rámci vlastní výzkumné části byl proveden sběr vzorků, a to všech klonů rodičovské populace a 268 jedinců z potomstva evidenčně rovnoměrně příslušných mateřským klonům. Následně byla izolována DNA, provedena mikrosatelitová analýza na 16 polymorfních lokusech a realizována genotypizace pomocí softwaru GeneMarker a následná rekonstrukce rodokmene v softwaru Cervus. Rekonstrukce rodokmene byla úspěšně realizována a získaná informace o otcovském gametickém příspěvku umožnila faktické převedení sazenic rozpěstovaných ve formě polosesterského potomstva tj. s evidencí mateřského jedince do plnosesterského potomstva, což je interpretováno v závěru. Znalost rodokmene bude v bu založeného potomstva a umožní významné urychlení celého šlechtitelského cyklu, protože zde byla využita metoda Breeding with Breeding.
|
|
|
Exogenní a endogenní faktory tvorby cibule u česneku kuchyňského v podmínkách in vitro
Staňková, Zuzana
V diplomové práci byl sledován vliv exogenních a endogenních faktorů na rostliny česneku kuchyňského (Allium sativum L.) v podmínkách in vitro. Byly sledovány odrůdy nepaličáku 'Lukan' a paličáku 'Lan', 'Bjetin', 'Slavin' a 'Havran' a jejich reakce na regulátory růstu přidané do MS média s 0,5 mg.l-1 2iP, 0,2 mg.l-1 NAA - varianty s PP 333, ABA, CEPA a zvýšený obsah sacharózy. V průběhu růstu rostlin byly stanoveny koncentrace etylenu, etanu a CO2 v kultivačních nádobách a byl sledován růst rostlin - tvorba cibulí a nárůst hmoty. V závěru tohoto pokusu byla ověřena stabilita donorové a explantátové rostliny pomocí DNA markerů u odrůd 'Lan' a 'Lukan'.
|
|
|
Studium polymorfizmu DNA u tritikale
Svojsíková, Nikola
Současné odrůdy tritikale nesplňují mlynářské ani pekařské požadavky. Příčinou je přítomnost chromozomu R, který zhoršuje viskoelastické vlastnosti těsta a přítomnost sekalinů zapříčiňuje horší technologické vlastnosti zrna. Bakalářská práce se věnuje detekci alelického složení lokusů vysokomolekulárních gluteninových podjednotek (HMW-GS) a nízkomolekulárních gluteninových podjednotek (LMW-GS). V práci bylo analyzováno celkem 14 vybraných genotypů tritikale. DNA markery založené na polymerázové řetězové reakci (PCR) byly použity k identifikaci alelického složení v lokusech Glu-A1, Glu-B1 a Glu-D1, které kódují vysokomolekulární gluteninové podjednotky, a sekalinového lokusu. V lokusu Glu-A1 byly detekovány alely Glu-A1a, Glu-A1b, Glu-A1c. Celkem 4 alelické kombinace gluteninových podjednotek Bx7+By18*, Bx7*+By8, Bx7+By8*, Bx7+By8 byly detekovány v lokusu Glu-B1. U dvou linií byla detekována alela Glu-D1d. Sec-1 lokus byl detekován u 12-ti šlechtitelských linií. DNA markery byly také využity při zjištění alelického složení lokusu Glu-A3, který kóduje nízkomolekulární gluteninové podjednotky. Alely Glu-A3a, Glu-A3d a Glu-A3f nebyly u analyzovaných linií detekovány.
|
|
| |
|
| |
|
| |
host ::
RSS.