|
|
Bonding and non-bonding interaction potentials for simulations of coarse-grained protein models
Pavlíková, Markéta ; Nová, Lucie (vedoucí práce) ; Bačová, Petra (oponent)
Skládáníproteinůje proces transformace aminokyselinového řetězce do unikátní 3D struktury. Struktura proteinu je dána jeho aminokyselinovou sekvencí. Porozuměníprocesu skládáníproteinůa proteinové dynamiky je klíčové, protože funkce proteinu je úzce spjata s jeho strukturou a dynamikou. Tyto procesy lze zkoumat pomocí molekulárních simulací. Zhrubené modely, které se používají v molekulárních simulacích, nabízejí výhodný kompromis mezi výpočetní efektiv- itou a přesností. Pro použití těchto modelů je nezbytný dobře nastavený force field neboli silové pole. Silové pole zahrnuje jak vazebné, tak nevazebné inter- akčnípotenciály, které jsou odvozeny z atomistických simulacínebo ze známých, experimentálně určených proteinových struktur. V rámci této bakalářské práce byly takové potenciály získány z více než 4500 struktur z databáze PDB. 1
|
|
|
Influence of aminoacid side-chain ionization on protein structure
Tomanová, Ema ; Nová, Lucie (vedoucí práce) ; Muzdalo, Anja (oponent)
Protein folding je ovliňován různými typy interakcí. Krom hydrofobních sil a vodíkových vazeb při něm hrají důležitou roli také Coulombické síly. Jejich důležitost vyvstává hlavně v částečně rozvinutých stavech a regionů citlivých na změny v pH, tam může ionizace postranních řetězců aminokyselin způsobovat konformační změny. Lepší porozumění funkci ionizovatelných postranních řetězců v protein foldingu otevírá nové příležitosti v designu proteinů a modifikacích zlepšujících jejich vlastnosti.
|
|
|
Studium samoskladby a stupně ionizace blokových kopolymerů pomocí transmisní elektronové mikroskopie a molekulových simulací
Illés, Peter ; Nová, Lucie (vedoucí práce) ; Štěpánek, Miroslav (oponent)
Responzivní systémy blokových kopolymerů, kterých bloky mají různou afinitu ke zkoumanému rozpouštědlu mohou vytvářet struktury jako micely nebo vezikuly. Tyhle struktury jsou senzitivní ke změnám vnějších podmínek jakými jsou pH a teplota. Tyto změny často vedou k formaci nebo rozkladu micel. Pokud je jedním z bloků slabý polyelektrolyt, stupeň ionizace závisí nejenom na vnějších podmínkách, ale taktéž na konformaci řetězců. Táto práce zahrnuje studium velikosti a stupně ionizace micelárních struktur a linearních řetězců kopolymeru obsahujícího termosenzitivní a pH responzivní bloky pomocí vysokorozlišovací transmisní elektronové mikroskopie a hamiltonianských Monte Carlo simulací. 1
|
|
|
Počítačové simulace struktury proteinů pomocí zhrubených modelů
Halda, Miloš ; Nová, Lucie (vedoucí práce) ; Limpouchová, Zuzana (oponent)
Hlavní částí této bakalářské práce je funkční program pro simulace zhrubených modelů proteinů, vhodný pro testování funkcí potenciálu. Program využívá návrh stavu pomocí pivota a vyhodnocení nových stavů metodou Monte Carlo. Program také umožňuje využít metodu simulovaného žíhání s lineárním poklesem teploty a má zabudované základní nástroje pro vyhodnocení simulací (počítání průměrů a chyb blokovou metodou). Program byl otestován simulací několika reálných proteinů. Pro kratší proteiny (88 a méně aminokyselin) program fungoval podle očekávání, delší proteiny (111 a více aminokyselin) poukázaly na limity přístupu návrhu stavů pomocí pivota. Pro další vývoj bylo navrženo rozšíření možností návrhu nového stavu pro vylepšení simulací dlouhých řetězců. 1
|
|
|
Právní, daňové a účetní aspekty péče o zaměstnance
NOVÁ, Lucie
Cílem této bakalářské práce je analyzovat vliv právních, daňových a účetních faktorů, které působí na péči o zaměstnance v podniku. Jsou hodnoceny vlivy, které působí jak na straně zaměstnavatelů, tak na straně zaměstnanců. Péče o zaměstnance je rozdělena do tří kategorií - zákonná, smluvní a dobrovolná péče o zaměstnance. Praktická část věnuje pozornost hlavně dobrovolné péči o zaměstnance. Pro vlastní výzkum bylo využito dvou dotazníků a dvou řízených rozhovorů s vybranými zaměstnavateli. Na straně zaměstnanců byly zkoumány hlavně sociální a demografické aspekty, které ovlivňují preferenci určitých benefitů. Na straně zaměstnavatelů byla pozornost zaměřena zejména na účetní a daňové faktory. Součástí výzkumu bylo i srovnání systémů péče o zaměstnance ve dvou podnicích. Přestože tyto podniky se velmi lišily svou velikostí i odvětvím, ve kterém podnikají, rozdíly v péči o zaměstnance byly minimální.
|
|
|
Sušice, Brána Šumavy. Rozvoj a propagace turistiky na Sušicku v letech 1918-1938
NOVÁ, Lucie
Tato práce se zabývá tématem rozvoje a propagace turistiky na Sušicku mezi lety 1918 - 1938 a rozšiřuje téma autorčiny bakalářské práce Činnost Klubu českých turistů v Sušici v letech 1890 - 1914. Text sleduje tři velké projekty Klubu: stavbu Klostermannovy chaty na Modravě, chaty v Prášilech a znovuvystavění svatoborské rozhledny. Dalším tématem je rozvoj možností cestování a dopravy v regionu; železnice, linkových autobusů, speciálních zájezdových autobusů i autodopravy. Zřetel je brán také na značkování turistických cest. Dále je ověřováno, jestli centrum regionu - město Sušice - odpovídalo obrazu typického letoviska. Zkoumány jsou hlavní kroky, které byly podnikány za účelem turistického zatraktivnění lokality. Je nastíněn vývoj počtu návštěvníků Sušice od 2. poloviny 20. let a provedena sociálně profesní analýza letních hostů v sezóně 1930. V poslední části jsou porovnávány turistické průvodce a další propagační materiály a na jejich základě je zjišťováno, zda se prezentace Sušice v meziválečném období lišila od konce 19. století. Celou prací se prolíná téma nacionalizmu a vztahů českého a německého etnika.
|
|
|
Podoba a funkce chodského kroje v minulosti a současnosti
Nová, Lucie ; Štěpánová, Irena (vedoucí práce) ; Krupková, Jaroslava (oponent)
V práci jsem popsala vývoj kroje od poloviny 19. až do 21. stolet'. Snažila jsem se o to, aby tato studie neměla jen deskriptivn' charakter, typický pro mnoho prac' předchoz'ch, ale vedle jeho popisu jsem uvedla i př'ležitosti, kam jej lidé nos', z jakých materiálřu se v 21. stolet' šije, proč jej stále ještě lidé oblékaj' a jaké tedy dnes pln' funkce. Kromě historického vývoje kroje jsem chtěla podat dřuraz zejména na současnost. Některé součásti kroje již ze života lid' vymizely (mužský kroj, svatebn' kroj), ale udržuj' se nadále d'ky m'stn'mu národopisnému souboru, jehož členky a členové si ho oblékaj' rády a zřustávaj' v něm i po vystoupen', nevn'maj' jej jen jako kostým. Jiné typy kroje si oblékaj' nejen členky souboru, ale i obyvatelky obou vs'. Mladš' generace většinou ke slavnostn'm př'ležitostem, na bály a masopust, starš' generace také do kostela a v několika př'padech jej nos' i jako všedn' oděv.
|
|
| |
|
|
Činnost Klubu českých turistů v Sušici v letech 1890-1914
NOVÁ, Lucie
Předkládaná práce se zabývá činností Klubu českých turistů v Sušici mezi lety 1890 až 1914. Za použití literatury shrnuje problematiku vzniku turistického spolku včetně legislativních, kulturněhistorických a socioekonomických předpokladů. Z pramenného výzkumu vychází tři jádra práce. Prvním je socioprofesní analýza členské základny a různých trendů týkajících se délky členství. Dalšími jsou dva nejvýznamnější počiny spolku; stavba rozhledny na Svatoboru a vydání tištěného Průvodce po Šumavě, přičemž se práce zajímá jak o technické okolnosti těchto projektů, tak o jejich ohlas a vliv na veřejnost. Poslední doplňující část zasazuje tyto dva velké počiny do kontextu drobnější činnosti spolku a stručně srovnává aktivitu sušického odboru Klubu českých turistů s ostatními odbory.
|
|
|
Podoba a funkce chodského kroje v minulosti a současnosti
Nová, Lucie ; Krupková, Jaroslava (oponent) ; Štěpánová, Irena (vedoucí práce)
V práci jsem popsala vývoj kroje od poloviny 19. až do 21. stolet'. Snažila jsem se o to, aby tato studie neměla jen deskriptivn' charakter, typický pro mnoho prac' předchoz'ch, ale vedle jeho popisu jsem uvedla i př'ležitosti, kam jej lidé nos', z jakých materiálřu se v 21. stolet' šije, proč jej stále ještě lidé oblékaj' a jaké tedy dnes pln' funkce. Kromě historického vývoje kroje jsem chtěla podat dřuraz zejména na současnost. Některé součásti kroje již ze života lid' vymizely (mužský kroj, svatebn' kroj), ale udržuj' se nadále d'ky m'stn'mu národopisnému souboru, jehož členky a členové si ho oblékaj' rády a zřustávaj' v něm i po vystoupen', nevn'maj' jej jen jako kostým. Jiné typy kroje si oblékaj' nejen členky souboru, ale i obyvatelky obou vs'. Mladš' generace většinou ke slavnostn'm př'ležitostem, na bály a masopust, starš' generace také do kostela a v několika př'padech jej nos' i jako všedn' oděv.
|
host ::
RSS.