|
|
Vizualizace 3D dat v biomedicínských aplikacích
Karzel, Michal ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Štohanzlová, Petra (vedoucí práce)
Tato práce popisuje základní princip optické koherentní tomografie a předzpracování na- měřených surových dat. Předzpracování je zaměřeno zejména na filtraci šumu, odstranění artefaktů, normalizaci, konverzi a kompresi surových dat. Takto předzpracovaná data jsou uložena do souboru *.PFRG jako ”preprocessed fringe data”. Tato předzpracovaná data je možno vizualizovat pomocí jednoduchého programu, který umožňuje zobrazení dat třemi způsoby. Objemová data reprezentována voxely. Rekonstrukce objemu algoritmem pochodující kostky. Řezy objektem podél os X, Y, a Z.
|
|
|
Detekce mikroaneurizmat a hemoragií ve snímcích sítnice
Tobiášová, Nela ; Štohanzlová, Petra (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Diabetická retinopatie je vážnou oční komplikací diabetu mellitus a jedním z hlavních důvodů slepoty na světě. Mikroaneuryzmata a hemoragie jsou patologie diabetické retinopatie. Jejich včasná detekce může zpomalit průběh nemoci a zabránit možnému oslepnutí. Algoritmy detekcí by zároveň usnadnili práci oftalmologů. Tato bakalářská práce se zabývá detekcí mikroaneuryzmat a hemoragií ve snímcích sítnice. V úvodní části je popsána diabetická retinopatie, typy lézí a možnosti léčby. Následuje uvedení několika již existujících detekcí. Praktická část se věnuje návrhu a řešení detekce červených lézí. Skládá se z několika kroků, vhodného výběru kanálu RGB snímku, lokální metody zvýraznění kontrastu snímku, zvýraznění hran, prahování, vytvoření trénovací množiny z vektoru příznaků a klasifikace pomocí neuronové sítě.
|
|
|
Fundus image processing in LabVIEW
Spišiaková, Lucia ; Štohanzlová, Petra (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
The bachelor work deals with methods of diagnosis of retina of the eye with a more detailed focus on digital fundus camera. It describes the theory of image processing. It also covers the topic of formatting images for processing. A program suitable for image processing like brightness adjusment, equalization and resampling is designed and implemented in LabVIEW. Software allows user to see and to save a processed image. A user guide is attached to the program.
|
|
|
Měření tloušťky kůže a podkožní tkáně v ultrazvukovém snímku v B-módu
Moldříková, Zuzana ; Štohanzlová, Petra (oponent) ; Šrámek, Jaromír (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se v první části zabývá teoretickým rozborem pojmů, které jsou potřebné k porozumění a navrhnutí algoritmu pro přímé měření tloušťky kůže a podkoží. Implementací algoritmu se zabývá druhá část práce. V šesti kapitolách jsou rozebrány pojmy jako kůže a podkožní tkáň, obezita, Body Composition Analysis, ultrazvuk, B-mód a základy zpracování obrazu, které jsou potřebné pro zpracování ultrazvukového obrazu a vytvoření samotného algoritmu. Sedmá kapitola obsahuje popis vlastní implementace algoritmu a popis jeho struktury. Rozebráno je také klinické ověření funkčnosti algoritmu na fantomu a několika dobrovolnících. Kapitola je uzavřena vyhodnocením a diskuzí získaných výsledků.
|
|
|
Generátor EKG signálu
Štohanzlová, Petra ; Sekora, Jiří (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá vznikem EKG signálu a možnostmi, jak jej generovat pomocí prostředí programu LabVIEW. Na základě prostudovaných metod popisu signálu byla vybrána metoda využívající podobnosti jednotlivých úseků EKG křivky se sinusovým resp. trojúhelníkovým vzorem. Tato metoda byla následně implementována do prostředí LabVIEW. Vytvořený virtuální přístroj generuje EKG signál se zadanou tepovou frekvencí a nastavitelnou výchylkou jednotlivých vln a kmitů. Také je možné zvolit jeden z 12-ti standardních svodů, realizovat několik druhů poruch srdeční činnosti a k signálu mohou být přidána různá rušení. Generovaný signál lze v reálném čase vysílat na výstup měřicí karty nebo ukládat do textového souboru v zadaném formátu.
|
|
|
Analýza speklí pro segmentaci obrazů z optické koherentní tomografie
Gallo, Vladimír ; Kolář, Radim (oponent) ; Štohanzlová, Petra (vedoucí práce)
tejto práci sa nachádza základný popis princípu optickej koherentnej tomografie, prehľad jej aplikácií a základné rozdelenie týchto systémov. Ďalej sa práca zaoberá charakterom obrazov optickej koherentnej tomografie, pre ktoré je typický šum zvaný spekle. V práci je uvedený princíp vzniku tohto šumu a využitie jeho závislosti na mikroštruktúre zobrazovaných tkanív pomocou textúrnej analýzy pre účely klasifikácie. Praktická časť tejto diplomovej práce pozostáva z prípravy fantómov, namerania testovacej sady dát na systéme OCT, implementovania metódy analýzy speklov v MATLABe a otestovania funkčnosti implementovaných algoritmov na štandardnom texturálnom datasete a tiež na nameraných fantómových obrazových dátach. Metódy analýzy sú použité pre segmentáciu fantómových obrazových dát.
|
|
|
Detekce průtoku pomocí optických interferenčních metod
Hoštáková, Nina ; Štohanzlová, Petra (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Práca sa zaoberá optickou metódou LSCI využívajúcou kontrast laserových speklí pre odhad zmien prietoku krvi. Jedná o neinvazíny a technicky pomerne nenáročný prístup, ktorého možnosti pre medicínu zatiaľ neboli plne využité. Literárna rešerš obsahuje podrobný popis tejto metódy zahŕňajúci princíp fungovania, techniky zobrazovania, potenciál pre medicínske aplikácie a tiež limitujúce faktory. Cieľom práce je navrhnúť a zostrojiť kompletný LSCI systém, vrátane vhodných fantómov pre simuláciu tkanivového prietoku krvi. Implementácia zobrazovacích algoritmov pre spracovanie získaných dát bola uskutočnená v prostredí Matlab®. Systém bol podrobený rozsiahlemu testovaniu rôznych parametrov akvizície i spracovania. Výsledky v podobe kvalitívnych prietokových obrazov boli diskutované a konfrontované s teoretickými predpokladmi.
|
|
|
Eliminace zkreslení obrazů duhovky
Jalůvková, Lenka ; Štohanzlová, Petra (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato diplomová práce je zaměřena na eliminaci zkreslení obrazů duhovky. Cílem bylo prostudovat a popsat metody zkreslení obrazu (1D rozmazání, uniformní 2D rozmazání, Gaussovo rozmazání, atmosferické rozmazání a rozmazání vlivem rozostření), tyto metody implementovat a aplikovat na testovací obrazy. Poté byly navrženy metody pro eliminaci těchto typů zkreslení u~snímků duhovky, jako inverzní a Wienerova filtrace a iterativní přístup k dekonvoluci. Všechny metody byly otestovány a vyhodnoceny. Experimentální testy ukázaly, že Wienerova filtrace restauruje snímky nejlépe, ať už v normálním či iterativním přístupu.
|
|
|
Speckle noise reduction in images from optical coherence tomography
Sokol, Kamil ; Štohanzlová, Petra (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
The thesis deals with speckle suppression in images acquired by optical coherence tomograph. It is divided into four parts. The first part describes basic information about the medical imaging method. It also deals with principle of measurement. The second section discusses the formation of image speckle and selected methods to reduce them. Next part is practical and consists of data acquisition, determination of the evaluation methodology and the implementation of speckle reduction methods. The last part is focused on testing and reviews of algorithms and discussion about their results.
|
|
|
Multimodální registrace obrazů sítnice
Štohanzlová, Petra ; CSc, Tomáš Suk, (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá možnostmi registrace retinálních snímků z různých modalit, konkrétně optické koherentní tomografie (OCT), skenovací laserové oftalmoskopie (SLO) a fundus kamery. V první fázi práce je zájem soustředěn na registraci obrazu SLO na fundus snímek, což slouží k vymezení oblasti zájmu pro následnou registraci dat z OCT. Závěrečná fáze slouží k nalezení správné pozice B-skenů ve fundus snímku. Na základě prostudování různých registračních metod byl pro registraci v obou případech použit postup využívající výpočet korelačního koeficientu. Pro nalezení optimálních parametrů registrace je použito prohledávání celého prostoru parametrů. V dílčích částech práce pak je vytvořen algoritmus pro vyrovnání OCT B-skenů s následnou detekcí cév a také jednoduchý algoritmus pro detekci cév z fundus snímku. Pro zpřehlednění registrace bylo vytvořeno grafické uživatelské rozhraní, které umožňuje načtení vstupních obrazů a přehledné zobrazení výsledku v několika možných formách.
|
host ::
RSS.