|
|
Porovnávání významných bodů pro detekci objektů v obraze
Trávníček, Vojtěch ; Macíček, Ondřej (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato práce se týká oboru počítačového vidění. Konkrétně se věnuje extrakci významných bodů z obrazu jako prostředek pro srovnání obrazů a vyhledávání objektů. Jsou zde zmíněny 4 metody, které jsou porovnávány z hlediska účinnosti a využití. Jako hlavní algoritmy jsou zde zmíněny SIFT a SURF, které jsou v poslední době nejčastěji využívané. Jsou zde popsány taky metody popisu významných bodů a jejich porovnávání. Jsou zde vloženy testovací obrazy pro primární testování implementovaného algoritmu. Nakonec je popsána implementace metody SURF a je otestována z hlediska několika nejvýznamnějších parametrů.
|
|
|
Dávkové zpracování perfusometrických MRI dat
Filipová, Petra ; Macíček, Ondřej (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá metodou DCE-MRI (Dynamic contrast enhanced magnetic resonance imaging). Je popsán základní princip magnetické rezonance a pulzní sekvence. Práce se věnuje metodě DCE, hlavně popisu postupu zpracování touto metodou. Součástí této práce je i popis vybraných farmakokinetických modelů. Dále je v práci uveden návrh pro dávkové zpracování pomocí systému PerfLab a je zde popsána i realizace tohoto návrhu. Pro účely ověření funkčnosti dávkového zpracování byla reálna data naměřena podle vytvořeného akvizičního protokolu, který je taktéž součástí práce.
|
|
|
Perfuzní analýza s využitím metody DSC-MRI
Minsterová, Alžběta ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Macíček, Ondřej (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá metodou DSC (Dynamic Susceptibility Contrast), založenou na susceptibilním váhování. Tato metoda je jedna z používaných perfuzních metod kontrastního vyšetření pomocí magnetické rezonance zejména mozku. Je popsán princip magnetické rezonance, krátce jsou zmíněny také jiné metody kontrastního vyšetření MR. Dále se práce věnuje výhradně metodě DSC-MRI, používaným akvizičním sekvencím a popisu postupu zobrazování touto metodou. Práce se dále realizací grafické aplikace v prostředí MATLAB, která umožňuje provedení perfuzní analýzy a vizualizaci perfuzních map.
|
|
|
Zvýraznění kontrastu pro rozlišení tkání a detekci kontrastních nanočástic metodami magnetickorezonančního zobrazování
Bačovský, Jaromír ; Macíček, Ondřej (oponent) ; Starčuk, Zenon (vedoucí práce)
Předložená diplomová práce se zabývá mechanismy vzniku kontrastu a jeho modifikací v magneticko-rezonančních obrazech molekulárními a nanočásticovými kontrastními činidly. V teoretické části shrnuje principy vzniku kontrastu a funkce kontrastních látek se speciálním důrazem na paramagnetické gadoliniové kontrastní látky a superparamegnetické nanočástice. Na základě analýzy typických MRI sekvencí si diplomová práce kladla za cíl vytvořit softwarovou aplikaci nazvanou MRICalc umožňující zjistit vhodné nastavení parametrů pulzní sekvence pro dosažení maximálního kontrastu. Program byl včetně grafického uživatelského prostředí vyvíjen v programovacím jazyce Python. V základní nabídce obsahuje pulsní sekvence spinové echo, FLASH, SSFP-Echo, TrueFISP, Dual - echo SSFP, Dual - echo GRE a FISP. Program umožňuje výpočet parametrů pulsní sekvence (opakovací čas, echo čas, sklápěcí úhel), kde nastává maximum kontrastu a vykreslení grafu průběhu kontrastu v závislosti na zvoleném proměnném parametru. Uživatel vybírá z předem definovaných látek, mezi kterými má být optimalizován kontrast. Korektní funkce aplikace MRICalc byla experimentálně ověřena pomocí fantomu připraveného z roztoků síranu měďnatého a destilované vody. Síran měďnatý plní ve fantomu funkci kontrastního činidla. Měření probíhalo na preklinickém MR systému Bruker Avance III 94/30 instalovaném v ÚPT AV ČR, v.v.i. Byla proměřena křivka kontrastu pro sekvenci FLASH, která je typickou variantou gradientního echa. Výsledek měření byl následně srovnán s teoretickým modelem spočteným aplikací MRICalc.
|
|
|
Development of parallel visualisation of subdermal regeneration by tomographic and hystological methods
Ruszová, Kristína ; Macíček, Ondřej (oponent) ; Skopalík, Josef (vedoucí práce)
The aim of the thesis is to review suitable methods for quantifying the regeneration of subcutaneous layers and collagen structures in tissue defect, especially MRI methods and histological techniques. The theoretical chapters contains basic overview of skin anatomy and healing process, brief overview of histological methods and description of MRI as well. The practical part contains a description of data acquisition and optimization of methods for obtaining these MRI images with the best possible visualization of the condition of the skin layers. It also describes the designed software for comparing the acquired MRI images and the classical histological image from the tissue post-mortem. Finally, the evaluation of suitable modifications of gels and coatings that would affect the contrast characteristic of these planar medication layers is summarized.
|
|
|
Pokročilé metody perfuzní analýzy v MRI
Macíček, Ondřej ; Frollo, Ivan (oponent) ; Mikl, Michal (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato doktorská práce se zabývá problematikou kvantitativní analýzy pomocí MRI a použití exogenní kontrastní látky. Jedná se o dvě metody, Dynamic contrast-enhanced MRI (DCE-MRI) a Dynamic susceptibility contrast MRI (DSC-MRI), které jsou většinou zpracovávány samostatně. Jedná se o unikátní metody, které poskytují cenné informace, avšak nejsou odbornou veřejností dostatečně přijímány kvůli nespolehlivosti odhadů parametrů a nejsou tak běžně používány ve vyšetřovacích protokolech. Tato dizertační práce si klade za cíl zlepšit spolehlivost metody DCE a odhady parametrů DSC. Práce se zejména zaměřuje na řešení problému kvantifikace při extravazaci kontrastní látky v DSC analýze a dále na nestabilitu DCE odhadů v případě použití pokročilých DCE farmakokinetických modelů s větším počtem parametrů. S použitím nových přístupů zpracování z literatury pro zpracování simultánně měřených DCE a DSC dat je možno odhadnout nové parametry vyšetřované tkáně - relaxivitu vaskulárního a intersticiálního prostoru. Pro tuto metodiku byl původně použit 2CXM model. V této práci je tato metodika testována s dalšími typy modelů, přičemž je kladen důraz na jejich spolehlivost v rámci spojení DCE a DSC. Bylo zjištěno, že model ATH je pro tento účel vhodnější než 2CXM. Metoda byla rozšířena o alternující dekonvoluci a dále na plně simultánní DCE-DSC odhad. Algoritmus byl testován na umělých a reálných datech. Výsledky analýz ukazují, že navržený dekonvoluční postup zlepšuje přesnost odhadu jak DCE, tak i DSC parametrů v porovnání se sekvenčním odhadem a zvyšuje tak významně potenciál a spolehlivost DCE a DSC metod.
|
|
|
Přenos informací po síti Ethernet
Kutílek, Miloš ; Macíček, Ondřej (oponent) ; Sekora, Jiří (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá přenosem informací po síti Ethernet. V této práci byl vybrán vhodný mikrokontrolér a komunikační modul, který zajištuje přenos dat z Ethernetu na SPI sběrnici, dále bylo zvoleno optimální digitální teplotní čidlo DS1820. Teoreticky popisuje model TCP/IP a síť typu Ethernet. V práci je vytvořeno blokové schéma zapojení, dále bylo vytvořeno elektrické schéma zapojení a deska plošných spojů. V prostředí BascomAVR je naprogramován program, který slouží pro přenos informací z mikrokontroléru přes Ethernet na webové stránky.
|
|
|
Laboratorní úlohy z RTG zobrazovacích systémů
Kuchař, Otakar ; Macíček, Ondřej (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Bakalářská práce se zabývá studií rentgenového záření a výpočetní tomografie. První část této práce obsahuje vysvětlení základních fyzikálních principů, je věnována elementárním částicím, atomu a ionizujícímu záření. Následující části objasňují témata od vzniku a druhu rentgenového záření, přes interakce záření s tkání, po detekci RTG záření. U výpočetní tomografie práce objasňuje sběr dat, rekonstrukci obrazu pomocí metod prosté zpětné projekce, filtrované zpětné projekce a algebraické rekonstrukce. V praktické části je popsáno několik provedených měření na rentgenové komoře pro výukové účely od firmy Leybold. Témata řeší útlum rentgenového záření v závislosti na druhu a tloušťce materiálu a spektrum RTG záření. V oblasti výpočetní tomografie jsou zařazeny úlohy řešící změnu kontrastu, akvizičních parametrů a metody pro rekonstrukci. Práce zahrnuje vypracovaná ukázková řešení k laboratorním úlohám.
|
|
| |
|
|
Perfuzní analýza s využitím metody DSC-MRI
Minsterová, Alžběta ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Macíček, Ondřej (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá metodou DSC (Dynamic Susceptibility Contrast), založenou na susceptibilním váhování. Tato metoda je jedna z používaných perfuzních metod kontrastního vyšetření pomocí magnetické rezonance zejména mozku. Je popsán princip magnetické rezonance, krátce jsou zmíněny také jiné metody kontrastního vyšetření MR. Dále se práce věnuje výhradně metodě DSC-MRI, používaným akvizičním sekvencím a popisu postupu zobrazování touto metodou. Práce se dále realizací grafické aplikace v prostředí MATLAB, která umožňuje provedení perfuzní analýzy a vizualizaci perfuzních map.
|
host ::
RSS.