|
| |
|
| |
|
|
Sdílené kroky biosyntetických drah linkomycinu a pyrrolo-benzodiazepinů
Jiráčková, Petra ; Fišer, Radovan (oponent) ; Janata, Jiří (vedoucí práce)
Linkomycin a jeho polosyntetický derivát klindamycin jsou terapeuticky využívaná antibiotika inhibující proteosyntézu v citlivých bakteriích. Jejich struktura se skládá z aminocukerné a aminokyselinové části, které jsou spojeny amidovou vazbou. Před časem byla zjištěna sekvence genového shluku pro biosyntézu linkomycinu a navrženy funkce pro většinu proteinů kódovaných geny shluku na základě porovnání se známými proteiny a inaktivací genů. Již dlouho bylo jasné, že aminokyselinové části linkomycinu (propylprolinu) je příbuzná dihydropyrrolová část pyrrolo[1,4]benzodiazepinů (PBD). Obě tyto části jsou odvozené od L-tyrosinu a prochází z počátku stejnou biosyntetickou dráhou. Další biosyntetické kroky se však rozcházejí. Věří se, že přenos genů z genového shluku pro produkci PBD do biosyntetického genového shluku pro linkomycin by mohl modifikovat strukturu propylprolinu a vylepšit tak vlastnosti linkomycinu, např. zvýšit antimalarické účinky. Nejúčinnějšími antibiotiky jsou alkylované deriváty, jejichž chemická syntéza je velmi složitá, ale mohly by být připraveny pomocí genového inženýrství jako tzv. hybridní antibiotika.
|
|
| |
|
| |
|
| |
|
|
Pojišťovnictví ve fázi strukturálních změn vyžadující nové vnitřní uspořádání pojišťoven
Štěpánek, Lukáš ; Daňhel, Jaroslav (vedoucí práce) ; Majtánová, Anna (oponent) ; Janata, Jiří (oponent)
Evropské pojišťovnictví v současnosti stojí před fází strukturálních změn. Transformace v doposud konzervativním a silně regulovaném pojišťovacím oboru bude odlišná od transformací provedených v jiných odvětvích. Pro pojišťovnictví 21. století bude typická změna doposud harmonického pojišťovacího trhu v silně konkurenční prostředí, které bude vyžadovat významné změny v organizační struktuře pojišťoven. Snahou celé práce je napomoci vrcholovému vedení pojišťoven ve tvorbě složitých modelů organizačních zaměření společností a zároveň vytvoření jednoduché teoretické struktury vysvětlující změny v organizační struktuře pojišťoven. Zvláštní důraz je kladen na outsourcing hodnotového řetězce v likvidaci pojištění motorových vozidel. Motivací managementu pojišťoven pro zavedení těchto změn je především cenový boj pojišťoven, který klade významné požadavky na efektivitu těchto finančních institucí. Právě optimalizace hodnotového řetězce pojišťovny může umožnit zvýšenou profitabilitu technického výsledku pojištění oproti konkurenci. Výběr praktického příkladu v dizertační práci záměrně padl na pojištění motorových vozidel, protože: 1. vykazuje velmi často hraniční profitabilitu - combined ratio okolo 100%, 2. v odvětví pojištění motorových vozidel je velmi vysoká cenová konkurence, 3. škody mohou být standartizovány a v důsledku mobility vozidel jednodušeji řízeny.
|
|
|
Geny kodující acetyhydroxy syntázu u Streptomyces cinnamonensis a jejich regulační oblast:Mutace v katalytické podjednotce zjią»ující necitlivost k inhibici konečného produktu
Kyselková, Martina ; Kopecký, Jan ; Šigutová, Lucie ; Pospíšil, Stanislav ; Felsberg, Jürgen ; Spížek, Jaroslav ; Janata, Jiří
Geny ilvB kódující katalytickou podjednotku AHAS u rodičovského kmene S. cinnamonensis a čtyř mutantů s deregulovanou biosyntetickou drahou valinu byly sekvenovány. Mutace byly nalezeny u dvou kmenů, jejichž AHAS byla v hrubém buněčném extraktu zdánlivě aktivována valinem. U kmene BVR-18 byla nalezena mutace C574A vedoucí v proteinu k substituci E139A. U kmene ACB-NLR-2 došlo k deleci tripletu AGC v pozici 805-807, což v proteinu vedlo k deleci Q217. Podle homologního modelu katalytické podjednotky, vytvořeného na základě krystalové struktury dimeru katalytických podjednotek AHAS u Saccharomyces cerevisiae, se substituce E139A vyskytla ve smyčce na rozhraní podjednotek poblíž TPP vazebného místa, zatímco ?Q217 v helixu odlehlém od aktivního místa. Jednotlivé podjednotky byly exprimovány v E. coli za účelem rekonstituce enzymů in vitro, jejichž aktivita v přítomnosti a nepřítomnosti 10 mM valinu byla měřena. Podařilo se prokázat, že substituce E139A je zodpovědná za zdánlivou aktivaci AHAS valinem pozorovanou u kmene BVR-18. U kmenů ACBR-2 a NLR-3 se zvýšenou hladinou aktivity AHAS nebyla zjištěna žádná mutace v katalytické podjednotce. Regulační oblast před genem ilvB těchto dvou kmenů a kmene rodičovského byla sekvenována. V rámci této oblasti byly nalezeny některé prvky atenuátoru, ale sekvence se u kmenů ACBR-2 a NLR-3 shodovala se sekvencí rodičovského kmene. Zdá se tedy, že regulace exprese AHAS je zajištěna ještě jiným mechanismem, než je atenuace.
|
|
|
Analýza genového clusteru anthramycinových a lincosamidových antibiotik
Jelínková, Markéta ; Koběrská, Markéta ; Čermák, Lukáš ; Kopecký, Jan ; Janata, Jiří ; Spížek, Jaroslav
Ve shluku genů kódujících biosyntézu linkomycinu bylo zjištěno 27 otevřených čtecích rámců s biosyntetickou či regulační funkcí a 3 rezistenční geny. Ze srovnání chemické struktury linkomycinu a celesticetinu vyplývá, že v biosyntetické dráze chybí dráha vedoucí k propylprolinu a prolin je přímo substrátem kondenzační reakce. Část biosyntetické dráhy zahrnující přeměnu L-tyrosinu na propyl-L-prolin by měla být přítomna v biosyntetické dráze funkčně odlišných antramycinových antibiotik. Byla zjišťováno rozvržení genu linkomycinového biosyntetického shluku do transkripčních jednotek. Dále byla na základě sekvence tohoto shluku navržena sada sond, pomocí nichž byly vyhlédávány analogy genů v producentech celesticetinu Streptomyces caelestis a antramycinů Streptomyces refuineus, Streptomyces albus and Streptosporangium sibiricum.
|
|
| |
host ::
RSS.