Hlavní stránka > Výsledky hledání: Sanchez Rocha, Alma Carolina
Hledej:
Tipy pro vyhledávaní :: Rozšířené hledání
Hledej ve sbírkách:
Seřadit podle: Zobrazit výsledky: Výstupní formát:
Národní úložiště šedé literatury Nalezeno 2 záznamů.  Hledání trvalo 0.00 vteřin. 
Difference in amino acid distribution in sequences of structured and unstructured proteins
 Sotáková, Patrícia ; Vondrášek, Jiří (vedoucí práce) ; Sanchez Rocha, Alma Carolina (oponent)
Nestrukturované proteiny jsou v dnešní době předmětem rostoucího zájmu. Vzhledem k probíhajícímu výzkumu, jež se snaží o popis vztahů mezi sekvencí a strukturou, je cílem této práce prozkoumat vlastnosti sekvencí aminoky- selin, které by mohly indikovat fingerprinty strukturovaných nebo neuspořá- daných proteinů. Identifikace těchto fingerprintů by mohla prohloubit naše pochopení nestrukturovaných oblastí či skládání proteinů. Kromě toho by tyto získané poznatky mohly pomoci při navrhování nových prediktorů hlu- bokého učení pro rozpoznávání nestrukturovanosti proteinů a proteinových domén. Statistická analýza byla provedena na sekvencích získaných z databází Protein Data Bank a DisProt. Součástí analýzy bylo porovnání proteinových sekvencí se sekvencemi uměle vygenerovanými s předpokladem aminokyseli- nové párové nezávislosti. Následně jsme identifikovali triplety dvou aminoky- selin a jejich vzdálenosti, jejichž výskyt se významně liší od vygenerovaného datasetu. Na základě této analýzy jsme triplety roztřídili do následujících kategorií: nadhodnocené, standardní a podhodnocené. Pozorované dvo- jice s mimořádnou frekvencí v dané vzdálenosti lze interpretovat jako fin- gerprint sekundární struktury, motivu, domény nebo jiné neznámé identi- fikace nestrukturovaných proteinů v závislosti na...
Úplný záznam
Framework for retrieval and analysis of proteins apo and holo forms from PDB
 Král, Adam ; Hoksza, David (vedoucí práce) ; Sanchez Rocha, Alma Carolina (oponent)
Vyvinuli jsme softwarový framework, který umožňuje analyzovat a porovnávat apo (bez ligandu) a holo (s ligandem) strukturní formy proteinů přístupných v PDB. Software stáhne aktuální verzi PDB, rozdělí struktury do skupin stejných molekul a rozliší zda se jedná o apo či holo strukturní formu. Nakonec je možné analyzovat dvojice apo a holo struktur s ohledem na jejich odlišné strukturální charakteristiky. Kromě samotné softwarové práce prezentujeme výsledky na datasetu z výchozí výzkumu a ověřujeme je. Získáváme výsledky na aktuální verzi PDB. Klíčová slova: protein; strukturní bioinformatika; PDB
Úplný záznam

Chcete být upozorněni, pokud se objeví nové záznamy odpovídající tomuto dotazu?
Přihlásit se k odběru RSS.
Digitální repozitář :: Hledej :: Nový záznam :: Personalizace :: Nápověda
Powered by Invenio v1.1.2
Spravuje admin.invenio@techlib.cz
Tato stránka je dostupná také v následujících jazycích:
Česky  English