|
|
Bacterial interactions and secondary metabolites in plant and soil environment
Rapoport, Daria ; Marečková, Markéta (vedoucí práce) ; Lovecká, Petra (oponent) ; Brabcová, Vendula (oponent)
Actinobacteriota představují jeden z nejvýznamnějších bakteriálních kmenů v rostlinném a půdním prostředí. Actinobacteriota jsou známá svou schopností produkovat sekundární metabolity, a proto mohou různými způsoby ovlivňovat jiné bakterie a rostliny. Táto práce byla zaměřena na posouzení souvislostí mezi produkcí sekundárních metabolitů a interakcemi aktinobakterií. V první části jsme hodnotili, jak aktinobakterie z kyselé půdy ovlivňují kultivovatelné půdní bakterie. Získali jsme sbírku kmenů aktinobakterií z kyselé půdy, ve které dominuje dříve nekultivovatelná skupina. Izolovali jsme zástupce této skupiny a popsali jsme novou čeleď Treboniaceae, ale také několik dalších potenciálně nových druhů známých rodů. Analýza genomu a metabolomu nového druhu Trebonia kvetii, sp.nov. gen.nov., prokázala jeho schopnost produkovat neobvyklé a potenciálně nové bioaktivní metabolity. Navrhli jsme pokus, ve kterém byl vždy jeden aktinobakteriální kmen pěstován společně s celým půdním bakteriálním společenstvem tak, aby byla umožněna volná výměna metabolitů. Pro tuto interakci byly vybrány tři kmeny pocházející z různých linií. Každý kmen významně a specificky ovlivňoval kultivovatelné bakterie a také produkci metabolitů, z nichž byla také část indukovana společnou kultivací. Ve druhé části práce jsme zkoumali...
|
|
|
Development of a tool for digital terrain analysis
Rapoport, Daria ; Barták, Vojtěch (vedoucí práce) ; Bašta, Petr (oponent)
Component of many hydrological applications using digital terrain models is the calculation of flow accumulation and specific catchment area, which are broadly used conceptions in hydrological modelling.
The goal of this diploma thesis was a proposal of tools for calculation of flow accumulation and specific catchment area by Multiple Flow Direction (MFD) algorithm as more appropriate for many hydrological applications then Single Flow Direction algorithm built-in in ArcGIS. The toolset should serve as an educational and research tool at the Faculty of Environmental Sciences, CULS, but not only there.
The theoretical part of the thesis gives examples of digital terrain models applications in general and in hydrology, summarizes basic methods that define flow direction and flow accumulation of surface runoff in grid-based terrain models and their significance for hydrological modelling. Selected methods and their implementations are described in details in methodological part of the thesis. The tools were created in Python language and may be used in ArcGIS interface.
The functionality of the toolset was tested on a coarse-resolution hydrologically correct digital terrain model of basin Moravian Dyje and simulation results has been extensively compared to those produced by Single Flow direction algorithm.
It is suggested that created toolset would be developed further in direction of calculation of additional related terrain attributes (e.g.Topographic Wetness Index), river network extraction with MFD, dealing with flat and sink areas in input DEM, and other flow direction algorithms implementation.
|
host ::
RSS.