|
|
Identifikace proteinů z bakteriálních acetonitrilových extraktů hmotnostní spektrometrii
Dušková, Hana ; Jílek, Petr (vedoucí práce) ; Pávková, Ivona (oponent)
SOUHRN V diplomové práci nazvané "Identifikace proteinů acetonitrilových extraktů hmotnostní spektrometrií" byla provedena detekce a identifikace biologického agens, intracelulární bakterie Coxiella burnetii. Detekce a identifikace proteinů byla provedena pomocí různých proteomických přístupů založených na kombinaci separačních technik (2D elektoforéza nebo HPLC) s hmotnostní spektrometrií. Pro rychlou detekci bakterie Coxilla burnetii byla nejvhodnější analýza bakteriálního acetonitrilového extraktu měřená na hmotnostním spektrometru MALDI-TOF v lineárním módu. Ostatní proteomické přístupy poskytly reprodukovatelné výsledky vedoucí k identifikaci 6 proteinů: chaperonový DnaK (heat shock 70 K protein), chaperoninový 60 K (GroEL protein, heat shock protein B), DnaJ protein (mucoidy activation protein muc Z), elongační faktor Ts (EF-Ts), ribozomální protein L7/L12 a chaperoninový 10 K (GroES protein, heat shock protein A).
|
|
|
Identifikace membránově lokalizovaných nativních peptidů intracelulární bakterie Francisella tularensis
Hrebíková, Hana ; Konečná, Klára (vedoucí práce) ; Pávková, Ivona (oponent)
Bc. Hana Hrebíková Identifikace membránově lokalizovaných peptidů nativních proteinů bakterie Francisella tularensis Diplomová práce Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Odborný pracovník v laboratorních metodách Cíl práce: Cílem diplomové práce bylo vyvinout novou metodu vhodnou pro stanovení koncentrace peptidů v biologickém vzorku a identifikace membránově asociovaných proteinů bakterie Francisella tularensis (F. tularensis). Metody: Odzkoušení metod bylo nejprve provedeno na standardních proteinech alfa kasein a BSA. Proteiny o známé koncentraci byly štěpeny trypsinem a koncentrace získaných peptidů byla měřena modifikovanou a nemodifikovanou metodou mikro BCA (bicinchoninic acid protein assay). Metoda pak byla aplikována na reálný bakteriální vzorek F. tularensis kmen FSC200. Bakteriální peptidy byly získány kultivací celých bakterií v různých časových intervalech v roztoku, který obsahoval trypsin. Tato metoda je v literatuře popisována jako "shaving". Výsledky: Pomocí nemodifikované mikro BCA byla stanovena koncentrace peptidů. Peptidy pak byly separovány HPLC a identifikovány pomocí hmotnostní spektrometrie. Správnost celého postupu dokazuje identifikace dvou bakteriálních peptidů z proteinu s názvem 17 kDa major membrane protein (ZP_0227498). Závěry: Další...
|
|
|
Identifikace proteinů z bakteriálních acetonitrilových extraktů hmotnostní spektrometrii
Dušková, Hana ; Jílek, Petr (vedoucí práce) ; Pávková, Ivona (oponent)
SOUHRN V diplomové práci nazvané "Identifikace proteinů acetonitrilových extraktů hmotnostní spektrometrií" byla provedena detekce a identifikace biologického agens, intracelulární bakterie Coxiella burnetii. Detekce a identifikace proteinů byla provedena pomocí různých proteomických přístupů založených na kombinaci separačních technik (2D elektoforéza nebo HPLC) s hmotnostní spektrometrií. Pro rychlou detekci bakterie Coxilla burnetii byla nejvhodnější analýza bakteriálního acetonitrilového extraktu měřená na hmotnostním spektrometru MALDI-TOF v lineárním módu. Ostatní proteomické přístupy poskytly reprodukovatelné výsledky vedoucí k identifikaci 6 proteinů: chaperonový DnaK (heat shock 70 K protein), chaperoninový 60 K (GroEL protein, heat shock protein B), DnaJ protein (mucoidy activation protein muc Z), elongační faktor Ts (EF-Ts), ribozomální protein L7/L12 a chaperoninový 10 K (GroES protein, heat shock protein A).
|
host ::
RSS.