|
|
NMR struktura N-terminální domény kapsidového proteinu Mason-Pfizerova opičího viru nesoucí mutaci narušující skládání kapsidy.
Obr, Martin ; Rumlová, Michaela (vedoucí práce) ; Ulbrich, Pavel (oponent)
Během procesu zrání retrovirových částic je polyproteinový prekurzor Gag rozštěpen virovou proteasou na jednotlivé funkční komponenty - matrixový protein (MA), kapsidový protein (CA) a nukleokapsidový protein (NC). Kapsidový protein se skládá ze dvou domén N-terminální (NTD) a C-terminální (CTD) a vytváří multimerní proteinovou síť. Konformační změna po uvolnění CA umožňuje rozpustit nezralou síť a vytvořit zralou virovou kapsidu. Trojrozměrná struktura CA NTD M-PMV obsahuje 6 -helixů a N-terminální -smyčku. -smyčka se vytváří po uvolnění N-konce CA z prekurzoru interakcí mezi Pro1 a Asp57 a dalším nespecifikovaným rozhraním mezi Arg14 a helixem 5. Tvorba -smyčky je nezbytným předpokladem pro vznik zralé sítě CA. Tato diplomová práce analyzuje vliv bodových mutací D111N (helix 5) a R14K (-smyčka) na strukturu CANTD pomocí NMR spektroskopie.V případě obou mutací nebyl pozorován vliv na celkové sbalení proteinu. Porovnáním NOE kontaktů CANTD D111N s divokým typem byla prokázána strukturní identita těchto proteinů. CANTD R14K se od divokého typu odlišoval výraznějším způsobem, především v oblastech -smyčky a helixu 5. Výsledky této strukturní studie potvrzují existenci stabilizačního rozhraní mezi -smyčkou a helixem 5, s Arg14 jako klíčovým prvkem této stabilizace. Kontakt mezi Arg14 a Asp111 byl vyloučen a...
|
|
|
NMR struktura N-terminální domény kapsidového proteinu Mason-Pfizerova opičího viru nesoucí mutaci narušující skládání kapsidy.
Obr, Martin ; Rumlová, Michaela (vedoucí práce) ; Ulbrich, Pavel (oponent)
Během procesu zrání retrovirových částic je polyproteinový prekurzor Gag rozštěpen virovou proteasou na jednotlivé funkční komponenty - matrixový protein (MA), kapsidový protein (CA) a nukleokapsidový protein (NC). Kapsidový protein se skládá ze dvou domén N-terminální (NTD) a C-terminální (CTD) a vytváří multimerní proteinovou síť. Konformační změna po uvolnění CA umožňuje rozpustit nezralou síť a vytvořit zralou virovou kapsidu. Trojrozměrná struktura CA NTD M-PMV obsahuje 6 -helixů a N-terminální -smyčku. -smyčka se vytváří po uvolnění N-konce CA z prekurzoru interakcí mezi Pro1 a Asp57 a dalším nespecifikovaným rozhraním mezi Arg14 a helixem 5. Tvorba -smyčky je nezbytným předpokladem pro vznik zralé sítě CA. Tato diplomová práce analyzuje vliv bodových mutací D111N (helix 5) a R14K (-smyčka) na strukturu CANTD pomocí NMR spektroskopie.V případě obou mutací nebyl pozorován vliv na celkové sbalení proteinu. Porovnáním NOE kontaktů CANTD D111N s divokým typem byla prokázána strukturní identita těchto proteinů. CANTD R14K se od divokého typu odlišoval výraznějším způsobem, především v oblastech -smyčky a helixu 5. Výsledky této strukturní studie potvrzují existenci stabilizačního rozhraní mezi -smyčkou a helixem 5, s Arg14 jako klíčovým prvkem této stabilizace. Kontakt mezi Arg14 a Asp111 byl vyloučen a...
|
|
|
Výběr ubytování pro mimopražského studenta
Obr, Martin ; Brožová, Helena (vedoucí práce) ; Andrea, Andrea (oponent)
Souhrn
Bakalářská práce na téma Výběr ubytování pro mimopražského studenta se skládá ze dvou částí. První část tvoří literární rešerše a druhou část tvoří analytická část. Literární rešerše
i analytická část jsou dále rozděleny na kapitoly a podkapitoly.
Literární rešerše byla využita k vysvětlení základních pojmů a metod, týkajících
se vícekriteriálního rozhodování. Na začátku literární rešerše je kladen důraz na vymezení
a vysvětlení základních komponent vícekriteriální analýzy. Jedná se především o vysvětlení pojmů kritéria a varianty. Na konci literární rešerše je důkladně vysvětlena metoda AHP, která je dále použita v analytické části. Na začátku analytické části jsou představeny kritéria a varianty výběru ubytování, se kterými se dále pracovalo za pomoci metody AHP, která má určit jaká varianta je nejvýhodnější pro daného modelového studenta České zemědělské univerzity. V následujících kapitolách jsou představeni dva modeloví studenti a jejich nároky na ubytování. Další kapitoly obsahují podrobné výpočty kompromisních variant pro oba studenty s konečným porovnáním výsledků. V závěru jsou shrnuty výsledky aplikované metody a jsou stanoveny závěry plynoucí z výsledků.
|
host ::
RSS.