Národní úložiště šedé literatury Nalezeno 3 záznamů.  Hledání trvalo 0.01 vteřin. 
Dynamické vlastnosti stromů
Němeček, Viktor ; Mareš, Martin (vedoucí práce) ; Mička, Ondřej (oponent)
V této práci jsme srovnali několik variant binárního vyhledávacího stromu, které se blíží dynamické optimalitě: tango stromy, multisplay stromy a splay stromy. Experimen- tálně jsme prozkoumali chování těchto tří typů stromů a červenočerných stromů. Měřili jsme počet navštívených vrcholů na operaci a také čas běhu na reálném hardwaru. Ukázali jsme, že tango strom a multisplay strom jsou ve většině případů méně efektivní než červe- nočerný a splay strom. V chování splay stromu a červenočerného stromu hrály nečekaně velkou roli efekty cache. 1
Applications of Gray codes in cache-oblivious algorithms
Mička, Ondřej ; Fink, Jiří (vedoucí práce) ; Gregor, Petr (oponent)
Moderní počítače využívají sofistikovanou hierarchii keší, aby snížily latenci přístupů k paměti. Tento fakt vedl ke vzniku cache-oblivious algoritmů, jejichž cílem je dosáhnout co nejlepšího výkonu na takovýchto paměťových hierarchiích, a to s pouze minimální znalostí přesných parametrů dané hierarchie. Při návrhu cache-oblivious algoritmů je velmi často využívána metoda rozděl a panuj, založená na rekurzi. V této práci předvedeme alternativní techniku návrhu cache- oblivious algoritmů, založenou na Grayových kódech. Ukážeme, jak pomocí binárního reflektovaného Grayova kódu procházet pole způsobem, který je přívětivý ke keším. To nám umožní vytvořit alternativní algoritmy pro problémy jako transpozice matice, naivní násobení matic či naivní konvoluce, jež mají stejnou asymptotickou složitost jako je jejich na rekurzi založené protějšky. Výhodou našeho přístupu je, že umožňuje implementovat algoritmy bez rekurze (či rekurzi simulujícího zásobníku) pomocí loopless algoritmu. Taktéž v navrhneme variantu binárního reflektovaného Grayova kódu, upravenou speciálně pro použití v naší technice a téměř loopless algoritmus pro generování tohoto kódu. Kromě teoretické analýzy naší techniky zkoumáme její chování na reálných počítačích, a to konkrétně na problému transpozice matice.
Využití nekorelovaných vícebodových farmakoforových otisků při virtuálním screeningu
Mička, Ondřej ; Hoksza, David (vedoucí práce) ; Škoda, Petr (oponent)
Nedávno byla publikována nová metoda pro virtuální screening. Tato me- toda používá farmakoforové otisky a statistické metody pro vytvoření farma- koforového modelu, který je následně použit k predikci aktivity ligandů. Tato práce se zabývá dvěmi možnými vylepšeními této metody. Prvním z nich je odstranění korelovaných farmakoforů, druhé je použití větších farmakoforů (původně byly použity jen tříbodové farmakofory). Obě úpravy byly im- plementovány spolu s nutným rozšířením chemoinformatického softwarového balíku RDKit. Nakonec byly obě metody experimentálně vyhodnoceny a po- rovnány s původní metodou. Na základě těchto výsledků byla navržena a vyhodnocena další modifikace - kombinace farmakoforového modelu s po- dobností otisků. 1

Chcete být upozorněni, pokud se objeví nové záznamy odpovídající tomuto dotazu?
Přihlásit se k odběru RSS.