|
|
Current view on phylogeny within the genus Flabellula Schaeffer, 1926 (Amoebozoa: Leptomyxida)
LISNEROVÁ, Martina
The present study deals with the molecular phylogeny of the genus Flabellula Schaeffer, 1926 that has been updated by determining SSU rRNA and actin gene sequences of 19 new strains. The descriptions of two novel species, F. schaefferi n. sp. and F. sawyeri n. sp., are provided based on the congruence of morphological data with SSU rRNA and actin gene sequence phylogenies, in-silico secondary structure prediction of the V2 region in the SSU rRNA, and by recognition of species-specific sequential motifs within this region.
|
|
|
Biodiversity of Myxozoa based on extensive screening of fish and environmental samples
LISNEROVÁ, Martina
Myxozoans represent a group of morphologically simplified endoparasites infecting mainly fish, annelid and bryozoan hosts including more than 2,600 nominal species. However, the diversity seems to be unexplored and undervalued. Host searching and invasive dissection is a commonly used method for the identification of myxozoan species diversity. Metabarcoding and amplicon analyses of environmental DNA from sediment, water and soil is developing approach for biodiversity assessment and have been performed in many biological areas to identify the diversity of organisms, communities and populations. Using classical morphological and molecular approaches, we explored the myxozoan diversity in selected areas and host groups. In addition, we propose a new methodological approach for the studying of myxozoan diversity based on environmental DNA from sediment and amplicon sequencing. Illumina Mi-Seq with metabarcoding and newly designed primer sets is suitable for analyzing myxozoan communities without the need to find and capture intermediate or final hosts.
|
|
|
Lokalizace a kvantifikace rybomorky \kur{Sphaerospora molnari} (Myxozoa) u kapra obecného
LISNEROVÁ, Martina
Tato diplomová práce je zaměřena na ekonomicky významný druh Sphaerospora molnari, který napadá plůdek kaprovitých ryb. Tato rybomorka je druhem histozoickým, infikuje zejména tkáně a různé mezibuněčné prostory a má výrazné patogenní projevy. V rámci této studie jsme se zabývali lokalizací a kvantifikací jednotlivých stádií rybomorky druhu Sphaerospora molnari u kapra obecného (Cyprinus carpio) v průběhu devítitýdenního infekčního pokusu. Pro kvantifikaci byla využívána kvantitativní PCR (qPCR). Míra infekce byla sledována u vybraných orgánů (kůže, krev, žábry, játra, ledviny a svalovina).
|
|
|
Fylogeneze améb čeledi Flabellulidae
LISNEROVÁ, Martina
Práce se zabývá fylogenezí améb Flabellulidae z kmenu Amoebozoa (Lobosa, Tubulinea). Skupina Flabellulidae jsou jednojaderné organismy s jedním, nebo mnoha jádry. Tělo není kryto skořápkou ani šupinami, pouze glykokalyxem. Pohybují se pomocí lobopodií (na základě aktin-myosinového komplexu). Čeleď Flabellulidae zahrnuje rody Flabellula a Paraflabellula, historicky Flamella. Nejsou jasné představy o fylogenezi této skupiny. V této práci jsou předkládány nově získané sekvence genu pro aktin, SSU rRNA a COX1 a jsou diskutovány vztahy v rámci čeledi Flabellulidae.
|
host ::
RSS.