|
|
Vliv deadenylázy Ccr4 na regulaci buněčného cyklu v kvasinkových koloniích
Daumová, Lenka ; Čáp, Michal (vedoucí práce) ; Převorovský, Martin (oponent)
Regulace buněčných procesů je pro přežívání kvasinkových buněk naprosto klíčová. Na mnohých regulacích se účastní CCR4-Not komplex, což je vysoce konzervovaný proteinový komplex nacházející se v eukaryotických buňkách od kvasinek až po savce. V této práci se zabývám především vlivem podjednotky Ccr4 na přežívání buněk ve stárnoucí kolonii kvasinek Saccharomyces cerevisiae zejména v souvislosti s regulací buněčného cyklu. Ccr4 je deadenyláza, jejíž funkcí je štěpení poly(A) konce mRNA, a tím zkracování životnosti mRNA. To je důležité během přísně regulovaných buněčných procesů, kdy je nutné, aby k expresi určitých genů docházelo jen v určitém čase. Kvasinka Saccharomyces cerevisiae BY 4742 je haploidní kmen, na němž je možné jednoduše vytvořit delece vybraných genů. V této diplomové práci jsem se zaměřila na výzkum kmene s delecí CCR4 a zároveň delecemi dalších genů ovlivňujících buněčný cyklus. Porovnáním fenotypu těchto klonů s rodičovským kmenem je možné určit změny ve fenotypu způsobené těmito delecemi a jejich vliv na přežívání buněk. Klíčová slova: regulace buněčných procesů, CCR4-Not komplex, Ccr4 podjednotka, buněčný cyklus, kvasinka, Saccharomyces cerevisiae, delece genů
|
|
|
Kodónové složení a exprese isoakceptorových tRNA jako mechanismus regulace genové exprese
Daumová, Lenka ; Čáp, Michal (vedoucí práce) ; Štěpánek, Luděk (oponent)
Genetický kód je definován jako klíč, podle kterého jsou k jednotlivým kodonům přiřazovány aminokyseliny. Genetický kód je degenerovaný, což znamená, že pro většinu aminokyselin existuje více synonymních kodonů. Po dlouhou dobu se myslelo, že takzvané tiché mutace, kdy nedojde k záměně aminokyseliny, ale pouze ke vzniku synonymního kodonu, nemají na genovou expresi vliv. Později se však podrobnějším výzkumem na molekulární úrovni zjistilo, že frekvence využití synonymních kodonů je jedním z faktorů ovlivňujících rychlost či efektivitu translace, stabilitu mRNA či schopnost proteinu zaujmout správnou konformaci. V celé řadě studií tak byl prokázán vliv použití určitých kodonů na genovou expresi. Tato bakalářská práce je rešerší dostupné literatury týkající se výše zmíněných objevů. Nejprve jsou shrnuty základní informace ohledně tRNA, její struktury a modifikací v antikodonové smyčce. Dále je popsáno párování mezi kodonem a antikodonem a nekanonické párování wobble. Následně se soustředím na samotnou rozdílnou frekvencí používání synonymních kodonů, jejich preferencí (v anglicky psané literatuře označované termínem "codon bias"). Jsou rozebrány její možné příčiny, souvislost s obsahem GC párů v genomu, dohady o výzkumu či výběru optimálního kodonu a jaký je vliv používání synonymních kodonů na...
|
host ::
RSS.