|
|
Proteomová charakterizace hostitelské buňky po interakci s intracelulárním pathogenem Francisella tularensis
Římalová, Pavla ; Šimůnek, Tomáš (vedoucí práce) ; Klimentová, Jana (oponent)
Diplomová práce Proteomová charakterizace hostitelské buňky po interakci s intracelulárním patogenem Francisella tularensis. Pavla Římalová Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd 2009 Francisella tularensis (F. tularensis) je intracelulární gram-negativní bakterie navozující u člověka závažné onemocnění tularémii. Je příkladem bakterie, jejíž mechanismy patogeneze nebyly doposud zcela popsány. K jejich objasnění by mohla významně přispět proteomová charakterizace interakce mezi hostitelem a patogenem. Cílem diplomové práce bylo odhalit změny proteinové výbavy u buněk myší makrofágové linie J774.2, vystavených působení bakterie F. tularensis za použití kvantitativní "shotgun" proteomové technologie. Proteom buněk infikovaných F. tularensis ve třech různých časových intervalech (6, 12 a 24 hodin) byl porovnán s proteomem buněk neiinfikovaných. Pomocí komerčního kitu ProteoExtract Subcellular Extraction Kit (S-PEK, Calbiochem) byly připraveny čtyři subcelulární frakce. Frakce obohacená o cytosolové proteiny byla dále analyzována a kvantifikována prostřednictvím iTRAQ-HPLC- MS/MS techniky. Tímto přístupem se podařilo identifikovat celkem 248 proteinů, z toho u 37 z nich byly pozorovány změny v produkci proteinů v infikovaných buňkách oproti buňkám...
|
|
|
Sledování vybraných markerů poškození tlustého střeva po indukci zánětu
Římalová, Pavla ; Nachtigal, Petr (vedoucí práce) ; Štaud, František (oponent)
Sledování vybraných markerů poškození tlustého střeva po indukci zánětu Pavla Římalová 2010 Karlova univerzita v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Crohnova nemoc a ulcerózní kolitida patří do idiopatických střevních zánětů. Aryl hydrocarbon receptor (AHR) je cytoplazmatický protein, u něhož se předpokládá jistá role v ovlivnění imunitního systému. Bilirubin je endogenní substance, u které jsou popisovány antioxidační a protizánětlivé účinky, které by mohly hrát roli v protekci idiopatických střevních onemocnění. Tato rigorózní práce se zabývala pilotní studií sledující expresi AHR u normobilirubinemických a hyperbilirubinemických potkanů v tlustém střevě po indukci chronického zánětu simulujícího idiopatická zánětlivá onemocnění střev. Ve studii bylo použito 8 potkanů kmene Gunn (G+) a 8 potkanů kmene Wistar (K+), kterým byl dlouhodobě podáván dextran sulfát (DSS). Sedm dnů po sobě byl do pitné vody přidáván DSS (koncentrace 2% w/v) s následným podáváním pouze pitné vody bez DSS po dobu 14 dnů. Popsaný třítýdenní cyklus se 2x zopakoval (proběhly tedy 3 cykly). Jako kontroly byli opět použiti potkani kmene Gunn (n=6) a Wistar (n=6) kteří nebyly vystaveni vlivu DSS. Výsledky imunohistochemické analýzy prokázaly přítomnost AHR receptoru ve stěně tlustého...
|
|
|
Proteomová charakterizace hostitelské buňky po interakci s intracelulárním pathogenem Francisella tularensis
Římalová, Pavla ; Klimentová, Jana (oponent) ; Šimůnek, Tomáš (vedoucí práce)
Diplomová práce Proteomová charakterizace hostitelské buňky po interakci s intracelulárním patogenem Francisella tularensis. Pavla Římalová Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd 2009 Francisella tularensis (F. tularensis) je intracelulární gram-negativní bakterie navozující u člověka závažné onemocnění tularémii. Je příkladem bakterie, jejíž mechanismy patogeneze nebyly doposud zcela popsány. K jejich objasnění by mohla významně přispět proteomová charakterizace interakce mezi hostitelem a patogenem. Cílem diplomové práce bylo odhalit změny proteinové výbavy u buněk myší makrofágové linie J774.2, vystavených působení bakterie F. tularensis za použití kvantitativní "shotgun" proteomové technologie. Proteom buněk infikovaných F. tularensis ve třech různých časových intervalech (6, 12 a 24 hodin) byl porovnán s proteomem buněk neiinfikovaných. Pomocí komerčního kitu ProteoExtract Subcellular Extraction Kit (S-PEK, Calbiochem) byly připraveny čtyři subcelulární frakce. Frakce obohacená o cytosolové proteiny byla dále analyzována a kvantifikována prostřednictvím iTRAQ-HPLC- MS/MS techniky. Tímto přístupem se podařilo identifikovat celkem 248 proteinů, z toho u 37 z nich byly pozorovány změny v produkci proteinů v infikovaných buňkách oproti buňkám...
|
|
|
Sledování vybraných markerů poškození tlustého střeva po indukci zánětu
Římalová, Pavla ; Štaud, František (oponent) ; Nachtigal, Petr (vedoucí práce)
Sledování vybraných markerů poškození tlustého střeva po indukci zánětu Pavla Římalová 2010 Karlova univerzita v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Crohnova nemoc a ulcerózní kolitida patří do idiopatických střevních zánětů. Aryl hydrocarbon receptor (AHR) je cytoplazmatický protein, u něhož se předpokládá jistá role v ovlivnění imunitního systému. Bilirubin je endogenní substance, u které jsou popisovány antioxidační a protizánětlivé účinky, které by mohly hrát roli v protekci idiopatických střevních onemocnění. Tato rigorózní práce se zabývala pilotní studií sledující expresi AHR u normobilirubinemických a hyperbilirubinemických potkanů v tlustém střevě po indukci chronického zánětu simulujícího idiopatická zánětlivá onemocnění střev. Ve studii bylo použito 8 potkanů kmene Gunn (G+) a 8 potkanů kmene Wistar (K+), kterým byl dlouhodobě podáván dextran sulfát (DSS). Sedm dnů po sobě byl do pitné vody přidáván DSS (koncentrace 2% w/v) s následným podáváním pouze pitné vody bez DSS po dobu 14 dnů. Popsaný třítýdenní cyklus se 2x zopakoval (proběhly tedy 3 cykly). Jako kontroly byli opět použiti potkani kmene Gunn (n=6) a Wistar (n=6) kteří nebyly vystaveni vlivu DSS. Výsledky imunohistochemické analýzy prokázaly přítomnost AHR receptoru ve stěně tlustého...
|
host ::
RSS.