|
|
Molekulárně biologické metody v laboratorní diagnostice patogenních leptospir
Kučerová, Petra ; Čermáková, Zuzana (vedoucí práce) ; Marešová, Vilma (oponent) ; Treml, František (oponent)
SOUHRN V rámci studia doktorského studijního programu byla navržena, vypracována a do klinického provozu laboratorní diagnostiky akutní formy leptospirózy zavedena real-time PCR metoda založená na detekci genu kódujícího povrchový lipoprotein LipL32. Metoda vykázala velmi dobrou analytickou pozitivní i negativní specificitu, kdy se obě hodnoty rovnaly 100 %. Na 230 laboratorních kmenech leptospir ze sbírkových kultur Royal Tropical Institute v Holandsku byla real-time PCR odzkoušena. Mez detekce byla stanovena na 1 - 5 kopií genomu / ml tekutého biologického materiálu. V praxi byla metoda ověřena na biologických materiálech 295 pacientů se suspektní leptospirózou, vyšetřených v období duben 2010 - duben 2013. Devět osob (3,1 %) a jim přináležejících 15 (3,2 %) biologických materiálů bylo vyhodnoceno jako LipL32 pozitivní. Real-time PCR byla použita při analýze vzorků z vnějšího prostředí na přítomnost leptospir. Z celkového počtu 680 vzorků (povrchové vody, čistírny odpadních vod, vlhké substráty) bylo 5 real-time PCR reakcí (0,7 %) vyhodnoceno jako hraniční, ovšem výsledek jejich sekvenační analýzy byl opakovaně "nekultivovatelné bakterie". Všechny vzorky byly vyhodnoceny jako negativní. Z uvedené skutečnosti je zřejmé, že metoda není vhodná pro testování takto náročných materiálů Multilokusová sekvenační...
|
|
|
Sledování aktivity tularemického ohniska na jižní Moravě
Treml, F. ; Hubálek, Zdeněk ; Halouzka, Jiří ; Pikula, J. ; Juřicová, Zina ; Janík, V.
Vyšetření ulovených zajíců (Lepus europaeus) na tularemii na okrese Břeclav v letech 1971-2001 ukázalo incidenci tularemie do 1% kusů až do roku 1993 včetně, avšak v roce 1994 incidence vzrostla na téměř 6%. V letech 1995-2001 bylo odchyceno a na tularemii vyšetřeno 479 drobných savců, Francisella tularensis byla izolována ze dvou jedinců hraboše polního (Microtus arvalis) roku 1997 a 2001. V tomtéž období bylo vyšetřeno také 3030 klíšťat Dermacentor reticulatus, 626 Ixodes ricinus a 60 Haemaphysalis concinna, a 9092 komárů Aedes spp. F. tularensis byla izolována pouze z klíšťat D. reticulatus (32 kmenů) a I. ricinus (1 kmen).
|
host ::
RSS.