|
|
Identifikace spánkových poruch z dat aktigrafie a spánkových deníků
Molík, Miroslav ; Mekyska, Jiří (oponent) ; Mikulec, Marek (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá predikcí Parkinsonovy choroby pomocí spánkových parametrů získaných z aktigrafie a spánkových deníků. Cílem je navrhnout model strojového učení, který bude schopen poznat pacienty trpící Parkinsonovou chorobou. K trénování byla použita datová množina dodaná Fakultní nemocnicí u sv. Anny, která byla za dosažením lepších výsledků různě upravována. Následně byly tyto úpravy podle výsledků modelů zhodnoceny a na jejich bázi byly vybrány dva modely, které dosahují testovací přesnosti 85 a 82%.
|
|
|
Zvýrazňování degradované řeči pomocí odstranění disonantních složek
Studený, Radim ; Mekyska, Jiří (oponent) ; Smékal, Zdeněk (vedoucí práce)
Tato práce si klade za cíl odstranit rušivé vlivy z řečového signálu a tím zvýšit srozumitelnost, kvalitu degradovaného signálu a odstup od šumu. Nejčastější typy rušení mohou být hluk ulice, vítr přicházející na mikrofon, cizí rozhovory na pozadí nebo puštěná hudba. Metoda popsaná v téhle práci filtruje frekvenční pásma signálu, která jsou vzhledem k základnímu tónu řeči disonantní. Konkrétně pro referenční tón C to jsou tóny F#, B a C#.
|
|
|
Functional connectivity and brain structure assessment in patients at risk of synucleinopathies
Klobušiaková, Patrícia ; Gajdoš, Martin (oponent) ; Mekyska, Jiří (vedoucí práce)
Synucleinopathy is a neurodegenerative disorder characterized by the presence of pathological protein -synuclein in neurons. So far, treatment that could heal or permanently stop this disease is not known. The aim of this work is to identify prodromal stages of synucleinopathies using functional connectivity processed applying graph metrics and assessing cortical thickness and subcortical structures volumes from magnetic resonance imaging data, and to verify specificity and sensitivity of combinations of parameters that sufficiently differentiate patients in risk of synucleinopathies. To accomplish this goal, we collected data from patients in the risk of synucleinopathy (preDLB, n = 27) and healthy controls (HC, n = 28). We found reduced volume of right pallidum and increased hippocampal volume to cortical volume ratio, increased normalised clustering coefficient and higher modularity in the preDLB group in comparison to HC. These four parameters were modeled using machine learning. The resulting model differentiated preDLB and HC with balanced accuracy of 88 %, specificity of 89 % and sensitivity of 86 %. The findings of this thesis can serve as the basis for further studies searching for specific MRI markers of prodromal stage of synucleinopathy that could be targeted with therapy in the future.
|
|
|
Automatizovaná diagnóza poruch spánku využívající nositelná zařízení
Sigmund, Jan ; Mekyska, Jiří (oponent) ; Mikulec, Marek (vedoucí práce)
Spánkové poruchy způsobují mnoho negativních následků a stále více se zkoumá jejich spojitost s kognitivním zdravím člověka. Tato práce se zabývá detekcí nízké spánkové kvality pomocí aktigrafického měření. Zvolila se existující metoda pro určení spánkových oken a její výkonnost se ověřila na datech polysomnografie, čítajících 27 pacientů. Algoritmus prostřednictvím změn úhlu, vypočtených z časových řad akcelerometru, určil binární stavy spánek/bdění. Dosáhlo se odlišného výsledku oproti původní studii, průměrně 81 % citlivosti, 62 % specificity a 78 % správnosti. Provedl se rozbor spánkových parametrů, a ozkoušely se dva způsoby jak s jejich pomocí rozhodnout o nízké kvalitě spánku – na základě porovnání s doporučeními organizace National Sleep Foundation a na základě porovnání s daty kontrolní skupiny bez poruch spánku (poč. 7). Cílem bylo označit zbylých 19 pacientů s diagnózou. Doporučení mezí parametrů SOL, WASO, NA>5 a SE vycházelo s větší citlivostí (75 %), menší specificitou (71 %) a identickou správností (74 %). Na závěr se metoda použila na 7denním měření aktigrafie, o 27 pacientech s podezřením na prodromální fázi demence s Lewyho tělísky. Stejným postupem se zhodnotil pokus o zachycení tohoto podezření a prohloubení možné souvislosti neurodegenerace s nekvalitním spánkem. Způsob řešení se prokázal citlivostí 86 %, specificitou 38 % a správností 63 %. Vzhledem k dosažení solidní citlivosti ve všech případech a dobré správnosti by se dalo uvažovat o indikátoru spánkové kvality.
|
|
|
Diferenční analýza multilingválního řečového korpusu pacientů s neurodegenerativními onemocněními
Kováč, Daniel ; Zvončák, Vojtěch (oponent) ; Mekyska, Jiří (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá automatizovanou diagnózou hypokinetické dysartrie v multilingválním řečovém korpusu. Jedná se o poruchu motorické realizace řeči vyskytující se u pacientů s neurodegenerativními onemocněními jako je například Parkinsonova nemoc. Automatizovaná diagnóza probíhá na základě akustické analýzy řeči a následným použitím matematických modelů. Tato metoda je na vzestupu díky její objektivitě a možné nezávislosti na národnosti. Cílem práce je zjistit, které akustické parametry mají vysokou diskriminační sílu a které jsou závislé na konkrétním jazyku mluvčího. K tom je využita statistická analýza parametrizovaných řečových úloh a následné modelování metodami strojového učení. Analýzy proběhly pro češtinu, americkou angličtinu, maďarštinu a všechny jazyky dohromady. Bylo zjištěno, že pouze některé parametry podporující diagnózu hypokinetické disartrie a jsou nezávislé na jazyku mluvčího. Nejlepší výsledky vykazuje parametr relF2SD a po něm parametr NST. Při klasifikaci mluvčích všech jazyků dohromady model dosauje přesnosti 59 % a senzitivity 72 %.
|
|
| |
|
|
Aplikace akustické analýzy hovoru pro systém Android
Hejda, Jakub ; Mucha, Ján (oponent) ; Mekyska, Jiří (vedoucí práce)
V současné době se stále více rozvíjí možnosti telemedicíny díky technologickému po- kroku v oblasti smartphonů. Cílem práce bylo navrhnout architekturu a design systému umožňující akvizici, zpracování a poskytování dat z řeči pacientů trpících Parkinsono- vou nemocí a provést jeho implementaci. Návrh se zdařil, sestává z mobilní aplikace pro nahrávání hovorů, serverové aplikace pro synchronizaci a poskytnutí dat webové apli- kaci umožňující správu dat a analýzu pro lékaře. Implementace serverové části proběhla v pořádku v souladu s požadavky na bezpečnost a robustnost aplikace, stejně tak byla implementována aplikace webová. Doplněním funkcí již existující mobilní aplikace vzniklo souhrnné řešení pro analýzu tohoto onemocnění.
|
|
|
Analýza a modelování medicínských obrazů
Vrba, Jan ; Mekyska, Jiří (oponent) ; Smékal, Zdeněk (vedoucí práce)
Hlavním cílem diplomové práce je rozbor technik hodnocení obličeje, kefalometrické hodnocení a metody, které jsou vhodné pro úpravu postavení čelistí a návrh metody pro úpravu čelistí. Zároveň je kladen důraz na prostudování používané metody java advance imaging, která slouží k zakřivení obrazu a měla by být schopna splnit cíle zadání. Tyto úpravy je možné provádět pomocí metody Warp. Výsledkem práce je aplikace, vytvořená v programovém jazyku JAVA, která demonstruje nejvhodnější metodu pro modifikaci obrazu. Tato metoda je WarpGrid. Aplikace byla vytvořena ve vývojovém prostředí eclipse. Pomocí této aplikace v závislosti na akci myši dochází k úpravám obrazu.
|
|
|
Akustická analýza vět složitých na artikulaci u pacientů s Parkinsonovou nemocí
Kiska, Tomáš ; Smékal, Zdeněk (oponent) ; Mekyska, Jiří (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá návrhem systému analýzy hypokinetické dysartrie, jakožto poruchy motorické realizace řeči, která se vyskytuje u přibližně 90 % pacientů s Parkinsonovou nemocí. Dále je popsána Parkinsonova nemoc a změna řečového signálu při tomto postižení. V následující části jsou popsány příznaky, které se používají pro diagnózu Parkinsonovy nemoci (FCR, VSA, VAI atd.). Pozornost je zde věnována především parametrizačním technikám, pomocí kterých je možné toto onemocnění diagnostikovat, monitorovat a odhadnout jeho progresi. V práci je rovněž popsán protokol akvizice dysartrické řeči, který lze v kombinaci s akustickou analýzou použít k odhadu zatížení hypokinetickou dysartrií v oblasti faciokineze, fonorespirace a fonetiky (korelace s 3F testem). Z hlediska parametrizace jsou pak v práci uvedeny zcela nové parametry založené na metodě RASTA. Analýza je založena na parametrizaci vět složitých na artikulaci. Experimentální soubor dat obsahuje celkem 101 pacientů s PN s různým stádiem progrese a 53 zdravých řečníků. Pro klasifikaci s výběrem parametrů, byla vybrána metoda mRMR.
|
|
|
Aplikace pro výpočet řečových příznaků popisující hypokinetickou dysartrii
Hynšt, Miroslav ; Mekyska, Jiří (oponent) ; Kiska, Tomáš (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá návrhem a zhotovením aplikace pro výpočet řečových parametrů u lidí trpící Parkinsonovou nemocí. Na začátku je obecně popsána Parkinsonova nemoc a Hypokinetická dysartrie a jak ovlivňuje řeč a parametry řeči při jejím postižení. Rozebrány jsou hlavně oblasti jako fonace, prozodie, artikulace a plynulost řeči. Dále práce popisuje parametry s velkým významem při diagnostice této nemoci a jejím postupu. Zmíněny a popsány jsou i některé významné studie ve světě popisující průběh vyšetření řeči účastníků a výpočet některých řečových parametrů za účelem analýzy řeči lidí postižených Parkinsonovou nemocí. Součástí práce je navržená a implementovaná aplikace pro výpočet, export a vizualizaci řečových parametrů z vybraných zdrojových zvukových nahrávek.
|
host ::
RSS.