|
|
Fully Automated Method for the Design of Ancestral Proteins
Štěpánek, Martin ; Martínek, Tomáš (oponent) ; Musil, Miloš (vedoucí práce)
Protein stability is a crucial feature for the industrial applications of proteins. This thesis focuses on the enhancements of FireProtASR, an automated tool for the design of stable proteins via ancestral sequence reconstruction. A novel technique of the successor prediction was developed and implemented into FireProtASR. Successors represent the evolutionary future of protein sequences and are supposed to have higher activity than current day proteins. They are also expected to have higher ability to target specific molecules. Furthermore, a new web user interface of FireProtASR was developed. It provides a fast and intuitive way to control the tool.
|
|
|
Podpora deskové hry Nemesis na mobilním telefonu s OS Android
Štěpánek, Miroslav ; Švec, Tomáš (oponent) ; Smrž, Pavel (vedoucí práce)
Cílem této práce je vytvořit mobilní aplikaci k deskové hře Nemesis určenou na systém Android, která umožní uživateli zjistit informace o herních komponentech při hře. Práce se skládá ze dvou hlavních částí, první je model vytvořený za pomoci knihovny Tensorflow, který zajišťuje detekci těchto komponent. Druhou je pak samotná aplikace, která dostává výsledky od dříve zmíněného modelu a zobrazuje výsledné informace uživateli. Toto usnadňuje uživateli hru a pomáhá ji i urychlit. Výsledný systém je možné modifikovat, tak aby byla aplikace využitelná i pro jiné hry.
|
|
|
Dům na Obilním trhu
Hynšt, Lukáš ; Štěpánek, Martin (oponent) ; Kratochvíl, Jan (vedoucí práce)
Současná podoba okolí Obilního trhu, náměstí s parkem situovaného v blízkosti brněnského centra, není bezproblémová. Především se na ulici Údolní, mezi tramvajovou zastávkou a budovou Kanceláře veřejného ochránce práv, nachází nevyhovující parkoviště a torzo řadové zástavby v nevyhovujícím stavu. To vše je vadou na kráse, již reprezentuje park na Obilním trhu a lesopark přiléhající k hradu Špilberk. Tato práce místo parkoviště a zanedbaných budov do proluky při ulici Údolní zasazuje budovu Kanceláře ochránce práv dětí – instituce, která má být v České republice brzo zřízena ke kontrole postupu úřadů, ale i jiných institucí, jež svou činností mohou zasahovat do sociálního a právního postavení dítěte. Řešení je koncipováno jako moderní, otevřené a udržitelné. Svou ideou i konkrétní podobou naznačuje, že s otevřenou náručí vítá děti, jejich rodiče, ale je zároveň příjemným místem pro zaměstnance, kteří každodenně realizují pravomoci instituce. Mimo samotného „úřadu“ budova a její okolí nabízí parkovací možnosti, prostory pro komerční využití i pro dočasné ubytování. Její vizuální stránka vhodně dokresluje okolí plné zeleně a ruchu společenského života.
|
|
|
Dům na Obilním trhu
Daňová, Barbora ; Štěpánek, Martin (oponent) ; Kratochvíl, Jan (vedoucí práce)
Proluka naproti Obilnímu trhu je dlouhodobě zanedbávanou oblastí a působí neesteticky. Poloha místa je ideální pro vystavbu objektu veřejného zájmu, jelikož se nachází v blízkosti centra a zároveň je obklopena přírodou, zejména pak parkem Špilberk. Návrh řeší situaci vystavbou multifunkční budovy, ve které sídlí zejména Úřad městské části Brno střed, Kancelář architekta města Brna a Urban Centrum. Prostory lákají svym variabilním využitím a také vzájemnou komunikací budovy s venkovními prostory. Urbanismus návrhu respektuje a doplňuje okolní veřejné prostranství, a zároveň nenarušuje aktuální stav veřejné infrastruktury a života ve městě. Návrh naopak podporuje atraktivitu místa i města Brna jako takového.
|
|
|
Příprava a charakterizace nanočástic tvořených komplexy polymer-surfaktant
Dvořák, Filip ; Štěpánek, Miroslav (vedoucí práce) ; Netopilík, Miloš (oponent)
V této práci byly pomocí statického a dynamického rozptylu světla, transmisní elektronové mikroskopie a mikroskopie atomárních sil charakterizovány hustě roubované kopolymery celulosa-g-polystyren (cel-PS) a celulosa-g-poly(methylmethakrylát) (cel- PMMA). Dále byl studován postup přípravy nanočástic těchto hydrofobních kopolymerů ve vodných roztocích srážením z roztoků v dioxanu vodou obsahující nizkomolekulární surfaktanty dodecylsulfát sodný (SDS) a dodecyltrimethylammonium bromid (DTMAB). Ukázalo se, že schopnost surfaktantů stabilizovat polymerní nanočástice není dána jen hydrofobním efektem, ale závisí i na specifických interakcích polární skupiny surfaktantu na povrchu nanočástice. Na základě zjištění, že účinnost stabilizace kopolymerů cel-PS je mnohem větší, než je tomu u lineárního PS, lze konstatovat, že větvená struktura polymeru je pro tvorbu hydrofobně stabilizovaných komplexů polymer-surfaktant výhodná.
|
|
| |
|
| |
|
|
Interactions in solutions and gels of stimuli-responsive polymer systems investigated by NMR spectroscopy
Konefał, Rafał ; Spěváček, Jiří (vedoucí práce) ; Hrabal, Richard (oponent) ; Štěpánek, Miroslav (oponent)
Na podněty reagující (na podněty citlivé nebo inteligentní) polymery jsou polymerní materiály, které na malé vnější podněty očividně mění své fyzikální nebo chemické vlastnosti. Inteligentní polymery lze klasifikovat podle podnětů, na které reagují, jako jsou změny teploty, mechanické namáhání, ozáření světlem, aplikace ultrazvuku, aplikace vnějšího magnetického či elektrického pole, změny pH, iontové síly, přidání chemických činidel a přítomnost biomolekul či bioaktivních molekul. Na podněty reagující systémy syntetických polymerů přitahují značnou pozornost díky širokému spektru aplikací, jako jsou systémy pro řízené dodávání a uvolňování léčiv, diagnostiku, tkáňové inženýrství a "inteligentní" optické systémy, stejně jako biosenzory, mikroelektromechanické systémy, nátěry a textilie. V této disertaci byly studovány polymerní systémy reagující na teplotu, pH a reaktivní kyslík (ROS). V případě termoresponsivních polymerů, kdy jsou v dobrém rozpouštědle polymerní řetězce molekulárně rozpuštěny, se změnami teploty (zvýšení nebo pokles) dochází k teplotou- indukované fázové separaci a tvorbě globulárních nanočástic. Polymery reagující na pH mění své vlastnosti, jako jsou rozpustnost, objem (gely), konformace řetězce, jakož i vazby, které se mohou při změnách pH štěpit. ROS-responzivita může vést ke...
|
|
| |
|
| |
host ::
RSS.