|
|
Modelování a analýza signálů v zobrazování perfúze magnetickou rezonancí
Kratochvíla, Jiří ; Šroubek,, Filip (oponent) ; Tintěra,, Jaroslav (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Práce ve své teoretické části popisuje perfúzní analýzu pomocí dynamického zobrazování s kontrastní látkou magnetickou rezonancí od akvizice dat až po stanovení odhadů perfúzních parametrů. Metoda je používána převážně v onkologii, kardiologii a neurologii. Práce se zaměřuje na kvantitativní stanovení odhadů perfúzních parametrů, konkrétně přispívá k řešení základního nedostatku této metody – korektnímu odhadu průběhu koncentrace kontrastní látky arteriálního vstupu analyzované oblasti (arteriální vstupní funkce). Z rešerše publikovaných prací a zaměření naší skupiny pak vychází formulace cílů dizertační práce. Zvoleným řešením je metoda slepé dekonvoluce. V praktické části je navržena nová metoda odhadu arteriální vstupní funkce slepou dekonvolucí. Metoda je navržena pro preklinické a klinické aplikace. Validace byla provedena na syntetických, preklinických a klinických datech. Dále byly analyzovány možnosti zvýšení časového intervalu vzorkování dat, které užití slepé dekonvoluce pro odhad AIF poskytuje. To může být využito pro zlepšení prostorového rozlišení, případně SNR. Pro snadnější rozšíření navržených metod do klinické a preklinické praxe byl vytvořen software na zpracování perfúzních dat
|
|
|
Měření a zpracování difuzních dat pomocí magnetické rezonance
Vankó, Bence ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Kolářová, Jana (vedoucí práce)
Táto bakalárska práca sa zaoberá DTI vyšetrením. Difúzny tenzorový model zobrazovania pomocou magnetickej rezonancie je moderná diagnostická metóda využívaná hlavne pre zobrazenie priestorového vzťahu určitej neurónovej dráhy mozgu. Práca je rozdelená na tri hlavné časti. Prvá časť obsahuje teoretický úvod MRI, DTI a literárne rešerše z jednotlivých vedeckých článkov, ktoré sa zaoberajú DTI experimentami. Druhá časť práce sa zaoberá rešeršom elektronických článkov pre výber vhodnej akvizície. Na základe preštudovaných článkov boli vybrané parametre, ktoré sa vylepšia počas meraní na fantóme. V treťej časti sa na základe výsledného akvizičného protokolu vykonávajú merania a dáta sa spracujú v rôznych softvéroch.
|
|
|
Biometrie otisku prstu
Kubica, Roman ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Fedra, Petr (vedoucí práce)
Úvodní část práce je zaměřena na seznámení s principy biometrických metod zpracování otisku prstu. Obsahuje klasifikaci a popis jednotlivých typů analýz otisku prstu rozdělených dle algoritmu porovnávání identifikovaného vzoru s obrazy z databáze. V navazující části se práce věnuje jejich zhodnocení na základě úspěšnosti experimentálních výsledků a popisu dostupných databází. Hlavním cílem této práce je vytvoření programu porovnávajícího snímaný otisk prstu s odpovídajícím vzorem získaným z databáze v programovacím rozhraní MATLAB® . Realizovaný algoritmus identifikace je zaloţen na výpočtu Poincarého indexu, stanovení singulárních bodů a markantů - význačných prvků obrazu otisku. Výkonnost programu je testována na generované databázi a zhodnocena dle indexů výkonnosti FAR a FRR.
|
|
|
Analýza Arterial Spin Labeling MRI dat
Galanová, Zuzana ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Krátká, Lucie (vedoucí práce)
Táto bakalárska práca sa zameriava najmä na perfúzne zobrazovanie metódou arterial spin labeling. Opisuje základné fyzikálne princípy magnetickej rezonancie, rekonštrukciu obrazu z nazbieraných dát, bezkontrastné perfúzne zobrazovanie, princíp a rozdelenie arterial spin labeling techník, kde sa venuje primárne sekvencii FAIR, ktorá patrí medzi techniky impulzného arterial spin labeling. Jedna z častí práce je venovaná tvorbe perfúznej mapy v Matlabe. Výsledky sú vyhodnotené na základe porovnania dát s Matlabu s dátami z programu Paravision Version 5.1. a sú zdiskutované.
|
|
|
Automatické zpracování DCE-MRI dat
Karela, Jiří ; Mézl, Martin (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá problematikou automatického zpracování DCE-MRI dat. Popisuje některé důležité postupy a metody. Práce je rozdělena na teoretickou část, praktickou část a závěr. V teoretické části jsou zejména popsány některé metody, na základě kterých byla poté řešena část praktická. Je zde ale popsána i další teorie, která souvisí s tématem. V praktické části se poté navazuje na danou teorii a řešíme zde problém automatické detekce arteriálních voxelů a průběhy koncentrace kontrastní látky v arteriích. Algoritmy jsou otestovány na obrazových datech mozku potkanů získaných z DCE-MRI. Závěr slouží jako shrnutí a zhodnocení našich výsledků. Také slouží jako úvaha nad realizací našich metod.
|
|
|
Porovnání farmakokinetických modelů pro DCE-MRI
Bačovská, Kristýna ; Mézl, Martin (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato diplomová práce pojednává o perfúzní analýze pomocí DCE-MRI (Dynamic contrast-enhanced magnetic resonance imaging). Metoda DCE-MRI se využívá pro hodnocení mikrocirkulace především v onkologii a v posledních letech také v kardiologii. Teoretický přehled je zaměřen na problematiku farmakokinetického modelování a odhad perfúzncíh parametrů pomocí vybraných modelů. Praktická část práce obsahuje popis programu PerfLab, se kterým je tato práce spjata, a dále se věnuje realizaci programu pro generování syntetických dat. Simulace dat získaných za ideálních podmínek a v přítomnosti šumu je použita pro porovnání modelů z hlediska přesnosti a spolehlivosti perfúzní DCE-MRI analýzy.
|
|
|
Lícování ultrasonografických obrazových sekvencí
Kubica, Roman ; Mézl, Martin (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Výsledkem této práce, zabývající se lícováním medicínských obrazů, je automatický registrační algoritmus. Ten je konstruován a testován na práci s reálnými ultrazvukovými snímky, pořízenými pomocí perfusního zobrazování. Ve svém úvodu se práce věnuje metodám registrace, dále specifikuje jednotlivé druhy optimalizačních principů a jednotlivé kriteriální funkce sloužící k rozhodování o správné vzájemné poloze obrazů. Na základě teoretické části jsou realizovány tři optimalizační algoritmy užívající tři kriteriální funkce, sloužící k lícování dodaných ultrazvukových sekvencí. Tyto algoritmy jsou testovány a výsledky podrobeny analýze, na jejímž základě jsou hodnoceny výhody a nevýhody jednotlivých postupů.
|
|
|
Porovnání a optimalizace měření single-echo a multi-echo BOLD fMRI dat
Kovářová, Anežka ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Mikl, Michal (vedoucí práce)
Diplomová práce pojednává o funkční magnetické rezonanci a sledování vlivu metod akcelerace akvizice na kvalitu funkčních snímků a pozorovaný BOLD signál. Jsou zde stručně popsány základní principy zobrazování pomocí magnetické rezonance, dále vysvětlena specifika funkční magnetické rezonance a popsán vznik a snímání BOLD signálu. Následně je definován fMRI experiment a popsány sekvence používané pro fMRI se zaměřením na techniky urychlení akvizice. Poté je vysvětlen vliv parametrů sekvencí na kvalitu zobrazení a uvedeny metody zpracování dat. V praktické části jsou popsány parametry použitých sekvencí, postup měření a úkol pro měřený subjekt během akvizice. Byla nasnímána data od 26 zdravých dobrovolníků, která byla následně analyzována. Na základě toho byly vyhodnoceny rozdíly mezi různými variantami sekvencí a potvrzen počáteční předpoklad, že multi-echo akvizice přináší lepší výsledky při rychlejším měření než single-echo.
|
|
|
Měření rychlosti šíření ultrazvuku
Pouč, Petr ; Roleček, Jiří (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Práce se zabývá metodami měření rychlosti šíření ultrazvuku. Rychlost šíření ultrazvuku byla zjištěna na základě detekce doby letu ultrazvuku od vysílače k přijímači. Byly vyvinuty tři metody pro určení rychlosti šíření ultrazvuku v médiu. Vytvořené algoritmy byly následně vyzkoušeny v navrženém programu. Veškerý software byl vytvořen v programovém prostředí Agilent VEE Pro 8.5. Práce dále obsahuje návrh dvou laboratorních úloh měření šíření ultrazvuku použitelných při výuce na Ústavu biomedicínského inženýrství.
|
|
|
Zobrazování chrupavek na magnetické rezonanci
Němcová, Simona ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Krátká, Lucie (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá zobrazováním chrupavek pomocí magnetické rezonance. Nejprve je zmíněn fyzikální princip jevu magnetické rezonance a nejčastěji používané budící sekvence, následně je popsán 9.4 T MR přístroj Bruker BioSpec 94/30 USR, který byl využit při měření praktické části. Další část práce se věnuje stavbě chrupavky a popisuje také temporomandibulární kloub, neboť je vhodným objektem při zobrazování chrupavek. V praktické části práce byla naměřena série snímků temporomandibulárního kloubu s různými akvizičními parametry a pomocí programového prostředí MATLAB byl vytvořen program pro prohlížení těchto snímků, vyhodnocování jejich kontrastu a také ke zjišťování T1 relaxačních časů tkání pomocí T1 map.
|
host ::
RSS.