|
|
Assessment of the level of gross motor skills of children aged 11 to 12 with the MABC-2 test battery at a selected primary school
HAVLÍČEK, Martin
The aim of the graduation thesis was to test level of gross motor skills of children aged 11 to 12 at selected primary school. Theory of the thesis was made by the literature research. We tested 45 children in age 11 and 12 by the test battery MABC-2 in research. Testing was completed in area of primary school Dacice Bozeny Nemcove after informed agreement of children's legal representative. Characteristics of the group was realized by the survey. We found out that girls reached better results than boys due to experiment in component balance by 0,7 percentile and in component aiming & catching by 6,2 percentile. Results showed better performance of sports active children by 8,8 percentile in component balance and 13,1 percentile in component aiming & catching. No pupil belonged to second or third zone of motoric difficulties in motor components with possibility of motor difficulties or significant motor difficulties with recommendation for specialized examination. We can overall consider the very good level of gross motor skills of measured children during the test thanks to percentile equivalent.
|
|
|
Analysis of functional magnetic resonance image data
Štens, Radovan ; Harabiš, Vratislav (referee) ; Havlíček, Martin (advisor)
Master's thesis focuses on processing fMRI data, which are mapping blood oxygenation level dependence in a state of brain activity. Usable and necessarily preprocessing tech- niques of the data, together with two main analysis approaches are introduced. The area of univariate methods, especially general linear model and multivariate principal or independent component analysis is explained. Practical application of the methods involved on the real fMRI data set is implemented. Relevant results as well as theirs mutual possible comparison is presented.
|
|
|
Simultanneous EEG-FMRI Data Fusion with Generalized Spectral Patterns
Labounek, René ; Havlíček, Martin (referee) ; Hlinka, Jaroslav (referee) ; Jan, Jiří (advisor)
Mnoho rozdílných strategií fúze bylo vyvinuto během posledních 15 let výzkumu simultánního EEG-fMRI. Aktuální dizertační práce shrnuje aktuální současný stav v oblasti výzkumu fúze simultánních EEG-fMRI dat a pokládá si za cíl vylepšit vizualizaci úkolem evokovaných mozkových sítí slepou analýzou přímo z nasnímaných dat. Dva rozdílné modely, které by to měly vylepšit, byly navrhnuty v předložené práci (tj. zobecněný spektrální heuristický model a zobecněný prostorovo-frekvenční heuristický model). Zobecněný frekvenční heuristický model využívá fluktuace relativního EEG výkonu v určitých frekvenčních pásmech zprůměrovaných přes elektrody zájmu a srovnává je se zpožděnými fluktuacemi BOLD signálů pomocí obecného lineárního modelu. Získané výsledky ukazují, že model zobrazuje několik na frekvenci závislých rozdílných úkolem evokovaných EEG-fMRI sítí. Model překonává přístup fluktuací absolutního EEG výkonu i klasický (povodní) heuristický přístup. Absolutní výkon vizualizoval s úkolem nesouvisející širokospektrální EEG-fMRI komponentu a klasický heuristický přístup nebyl senzitivní k vizualizaci s úkolem spřažené vizuální sítě, která byla pozorována pro relativní pásmo pro data vizuálního oddball experimentu. Pro EEG-fMRI data s úkolem sémantického rozhodování, frekvenční závislost nebyla ve finálních výsledcích tak evidentní, neboť všechna pásma zobrazily vizuální síť a nezobrazily aktivace v řečových centrech. Tyto výsledky byly pravděpodobně poškozeny artefaktem mrkání v EEG datech. Koeficienty vzájemné informace mezi rozdílnými EEG-fMRI statistickými parametrickými mapami ukázaly, že podobnosti napříč různými frekvenčními pásmy jsou obdobné napříč různými úkoly (tj. vizuální oddball a sémantické rozhodování). Navíc, koeficienty prokázaly, že průměrování napříč různými elektrodami zájmu nepřináší žádnou novou informaci do společné analýzy, tj. signál na jednom svodu je velmi rozmazaný signál z celého skalpu. Z těchto důvodů začalo být třeba lépe zakomponovat informace ze svodů do EEG-fMRI analýzy, a proto jsme navrhli více obecný prostorovo-frekvenční heuristický model a také jak ho odhadnout za pomoci prostorovo-frekvenční skupinové analýzy nezávislých komponent relativního výkonu EEG spektra. Získané výsledky ukazují, že prostorovo-frekvenční heuristický model vizualizuje statisticky nejvíce signifikantní s úkolem spřažené mozkové sítě (srovnáno s výsledky prostorovo-frekvenčních vzorů absolutního výkonu a s výsledky zobecněného frekvenčního heuristického modelu). Prostorovo-frekvenční heuristický model byl jediný, který zaznamenal s úkolem spřažené aktivace v řečových centrech na datech sémantického rozhodování. Mimo fúzi prostorovo-frekvenčních vzorů s fMRI daty, jsme testovali stabilitu odhadů prostorovo-frekvenčních vzorů napříč různými paradigmaty (tj. vizuální oddball, semantické rozhodování a resting-state) za pomoci k-means shlukovacího algoritmu. Dostali jsme 14 stabilních vzorů pro absolutní EEG výkon a 12 stabilních vzorů pro relativní EEG výkon. Ačkoliv 10 z těchto vzorů vypadají podobně napříč výkonovými typy, prostorovo-frekvenční vzory relativního výkonu (tj. vzory prostorovo-frekvenčního heuristického modelu) mají vyšší evidenci k úkolům.
|
|
|
Specific and fitness testing of Peewee HC Motor Czech Budejovice\\
HAVLÍČEK, Martin
The aim of the bachelor thesis is to test specific and fitness abilities of peewees of HC Motor Czech Budejovice. Theoretical part of the thesis was made by the content analysis of literature research. Author focused on evolutionary legitimacy to further clarify period of pubescence. We were dealing with physiologic legitimacy of ice hockey along with history of ice hockey, training principles and testing in this part hereafter. Explorational part contains using of test battery, which we apply on each peewee player of HC Motor Czech Budejovice. Measured values of tests were compared and eveluated with motoric tests outside of ice hockey rink. We have found out mutual relationship between dynamic explosive power and results of tests on the ice thanks to that. Better performance by older category in comparison to younger one is apparent as well. The results are described by and presented by charts and tables.
|
|
|
Exploring Brain Network Connectivity through Hemodynamic Modeling
Havlíček, Martin ; Hluštík, Petr (referee) ; Šmídl,, Václav (referee) ; Jan, Jiří (advisor)
Zobrazení funkční magnetickou rezonancí (fMRI) využívající "blood-oxygen-level-dependent" efekt jako indikátor lokální aktivity je velmi užitečnou technikou k identifikaci oblastí mozku, které jsou aktivní během percepce, kognice, akce, ale také během klidového stavu. V poslední době také roste zájem o studium konektivity mezi těmito oblastmi, zejména v klidovém stavu. Tato práce předkládá nový a originální přístup k problému nepřímého vztahu mezi měřenou hemodynamickou odezvou a její příčinou, tj. neuronálním signálem. Zmíněný nepřímý vztah komplikuje odhad efektivní konektivity (kauzálního ovlivnění) mezi různými oblastmi mozku z dat fMRI. Novost prezentovaného přístupu spočívá v použití (zobecněné nelineární) techniky slepé dekonvoluce, což dovoluje odhad endogenních neuronálních signálů (tj. vstupů systému) z naměřených hemodynamických odezev (tj. výstupů systému). To znamená, že metoda umožňuje "data-driven" hodnocení efektivní konektivity na neuronální úrovni i v případě, že jsou měřeny pouze zašumělé hemodynamické odezvy. Řešení tohoto obtížného dekonvolučního (inverzního) problému je dosaženo za použití techniky nelineárního rekurzivního Bayesovského odhadu, který poskytuje společný odhad neznámých stavů a parametrů modelu. Práce je rozdělena do tří hlavních částí. První část navrhuje metodu k řešení výše uvedeného problému. Metoda využívá odmocninové formy nelineárního kubaturního Kalmanova filtru a kubaturního Rauch-Tung-Striebelova vyhlazovače, ovšem rozšířených pro účely řešení tzv. problému společného odhadu, který je definován jako simultánní odhad stavů a parametrů sekvenčním přístupem. Metoda je navržena především pro spojitě-diskrétní systémy a dosahuje přesného a stabilního řešení diskretizace modelu kombinací nelineárního (kubaturního) filtru s metodou lokální linearizace. Tato inverzní metoda je navíc doplněna adaptivním odhadem statistiky šumu měření a šumů procesu (tj. šumů neznámých stavů a parametrů). První část práce je zaměřena na inverzi modelu pouze jednoho časového průběhu; tj. na odhad neuronální aktivity z fMRI signálu. Druhá část generalizuje navrhovaný přístup a aplikuje jej na více časových průběhů za účelem umožnění odhadu parametrů propojení neuronálního modelu interakce; tj. odhadu efektivní konektivity. Tato metoda představuje inovační stochastické pojetí dynamického kauzálního modelování, což ji činí odlišnou od dříve představených přístupů. Druhá část se rovněž zabývá metodami Bayesovského výběru modelu a navrhuje techniku pro detekci irelevantních parametrů propojení za účelem dosažení zlepšeného odhadu parametrů. Konečně třetí část se věnuje ověření navrhovaného přístupu s využitím jak simulovaných tak empirických fMRI dat, a je významných důkazem o velmi uspokojivých výsledcích navrhovaného přístupu.
|
|
|
Segmentation of magnetic resonance images
Hanák, Pavel ; Harabiš, Vratislav (referee) ; Havlíček, Martin (advisor)
Segmentation, magnetic resonance, grey matter, white matter, thresholding, region growing, splitting and merging, watershed, level set method.
|
|
|
Archived Data Management System
Havlíček, Martin ; Šeda, Miloš (referee) ; Máša, Vítězslav (advisor)
The goal of this work was to research the available database systems and propose a suitable database system for data archiving. Prepare the communication and processing of data between the database and delivered application Profisignal which processes the measured data from all sensors. Design architecture for the database, the storage of measured data and calculation reports on that data. At the end design the web user interface. The result of my work demonstrate possible ways of archiving data in ORACLE database, examples of calculation the reports and sample of web application, that presented the measured data.
|
|
| |
|
|
Deconvolution of hemodynamic response from fMRI data
Bartoň, Marek ; Kolář, Radim (referee) ; Havlíček, Martin (advisor)
This paper deals with the variability of HRF, which may have crucial impact on outcomes of fMRI neuronal activation detection in some cases. There are three methods described - averaging, regression deconvolution and biconjugate gradient method - which provide HRF shape estimation. In frame of simulations regression method, which uses B-spline curves of 4-th order for window length of 30 s, was chosen as the most robust method. Deconvolution estimates was used as HRF models for classic analyse of fMRI data, concretely visual oddball paradigm, via general linear model. Enlargement of localizated areas was observed and after expert consultation with scientific employees from neurology clinic, outcomes was evaluated as relevant. Furthermore Matlab application, which provides confortable observation of HRF variability among brain areas, was made.
|
|
|
Application of clustering methods for processing of biomedical data
Rozinek, Michal ; Gazárek, Jiří (referee) ; Havlíček, Martin (advisor)
The goal of this study is to learn about methods in object classification in medicine and find out what are these methods about. Focusing on functionality and reliability of these methods whith datafile from the medicine compartment after making the algorithm in MATLAB. In form of siple tests, put the touch everyone of classification procedure and find out in which they excel and in which they lags. The choice of input data parametres is very important, this will be tested and noted in conclusions.
|
guest ::
RSS feed.