|
|
Zkoumání jaderné funkce interleukinu-1alfa
Novák, Josef ; Pospíšek, Martin (vedoucí práce) ; Vondrejs, Vladimír (oponent)
Interleukin-1alfa (IL-1alfa) je dobře známý jako extracelulární prozánětlivá signální molekula. Množí se však i důkazy pro jeho nekanonickou jadernou funkci, která jej řadí mezi "cytokiny dvojí funkce". Tato funkce není závislá na oblasti aktivující receptor, ale na jeho evolučně konzervované N-terminální doméně, která po rozštěpení prekurzoru zůstává v buňce a přesouvá se do jádra. Je známo, že prekurzor lidského IL-1alfa dokáže interagovat s histonacetyltransferázovými (HAT) komplexy. Doposud ale nebyla určena bílkovina z těchto komplexů, která je za interakci s N-terminální doménou IL-1alfa zodpovědná. Pro studium interakce IL-1alfa s HAT byla N-terminální doména lidského IL-1alfa, respektive celý prekurzor IL-1alfa, produkovány v kvasinkách. Byla testována vhodnost takového uspořádání pro studium interakce IL-1alfa s eukaryontními komplexy. Bioinformatickou analýzou byly v rámci této práce charakterizovány predikované oblasti, kterými se IL-1alfa může vázat na koaktivátory transkripce. Jeden z proteinů, na který se IL-1alfa může těmito oblastmi vázat, je Ada2. Proteiny Ada2, prekurzor a maturovaný IL-1alfa byly v bakteriálním expresním systému produkovány ve fúzi s epitopy vhodnými pro afinitní purifikaci a přečištěny. Tato práce dále předkládá predikci terciární struktury N-terminální domény IL-1alfa....
|
|
|
Methylation profile in malignancy
Stojčeva, Nina ; Vodička, Pavel (vedoucí práce) ; Vondrejs, Vladimír (oponent)
Epigenetické změny reprezentují chemické modifikace DNA molekuly a histonových proteinů, které mohou ovlivňovat genovou expresi. Mezi ně patří i DNA metylace představující známý mechanismus umlčení tumor supresorových a DNA reparačních genů při karcinogenezi. Byl proveden velký počet studií za účelem identifikace metylačních profilů těchto genů v různých lidských nádorech. V naši studii, zahrnující 45 pacientů se sporadickým kolorektálním nádorem a 12 pacientů s nádorem hlavy a krku, jsme vyšetřili metylační profil promotorových oblastí osmi "mismatch" reparačních genů (MLH1, MSH2, MSH3, MLH3, PMS1, PMS2, MSH6 a EXO1). Metylace promotorů byla detekována v genech MLH1 a MLH3. Výsledky obou skupin pacientů byly shodné. Na závěr můžeme shrnout, že metylační profily promotorových oblastí genů MLH1 a MLH3 mohou být považovány za potenciální kandidáty epigenetických biomarkerů kolorektálního nádoru, případně i nádoru hlavy a krku. Domníváme se, že by měl být proveden další výzkum, který by potvrdil tuto představu.
|
|
|
Stanovení exprese vybraných proteinů apoptotické kaskády v lidském endometriu
Dolgovyazova, Anastassiya ; Švandová, Ivana (vedoucí práce) ; Vondrejs, Vladimír (oponent)
Apoptosa je programovan a bun e cn a smrt, kter a je vyvol ana nap r. z ava zn ymi mutacemi v DNA nebo bun e cn ym stresem. Hraje d ule zitou roli v udr zov an tk a nov e homeost azy pomoc eliminace star ych, nepot rebn ych nebo po skozen ych bun ek. U castn se j velk e mno zstv molekul, z nich z nejd ule zit ej s jsou z astupci protein u Bcl- 2 rodiny a v ykonn e proteiny apoptosy, kaspasy, zodpov edn e za vlastn proveden apoptosy. Selh an regulace apoptosy m u ze zp usobit radu malignit, v cetn e n adorov e transformace. Lidsk e endometrium je speci ck a tk a n, ve kter e se apoptosa vyskytuje cyklicky. P redlo zen a pr ace se zab yv a studiem exprese protein u Bcl-2, Bax, Bad. Bid, pro-kaspasy-3, kaspasy-3 a PARP v norm aln m, atro ck em, hyperplastick em a kancerozn m (stadia I a II dle FIGO) endometriu. V ysledky t eto studie nazna cuj , ze proteiny Bid a Bad mohou b yt jedn emi z potenci aln ch zlomov ych bod u v procesu n adorov e transformace bu nky, na co z poukazuje i opa cn y vzorec jejich exprese v hyperplastick em a kancerozn m endometriu.
|
|
|
The role of DNA damage in cellular senescence
Dušková, Pavlína ; Vondrejs, Vladimír (oponent) ; Hodný, Zdeněk (vedoucí práce)
Cells grown in vitro may be introduced into terminal growth arrest termed cellular senescence. In normal cells, it always arises when they reach the end of their proliferative capacity. However, this process may be also caused by various means anytime during the cultivation of both normal and at some circumstances also in immortal cells. Current view of cellular senescence places this phenomenon into direct relationship with DNA damage. The first aim of this study is to elucidate the role of DNA damage in chemically induced senescence. Until recently, DNA damage was not studied in this particular model. All chemicals used in this work are routinely used to unveil unstable parts of the human genome, so called fragile sites, which are inherently prone to DNA breakage. The second aim of this study is to asses the possibility that these sensitive regions of DNA might be also involved in senescent phenotype. Two of the three chemicals used in this study, 5-bromodeoxyuridine and distamycin A, were commonly used to accomplish senescence, and their effect on main senescence-associated changes in cellular proteome is thus relatively well defined. The changes caused by the third compound, thymidine, were so far poorly investigated. Therefore, the last aim of this work is to find out, if the changes of protein...
|
host ::
RSS.