| |
|
Metodika detekce vnitřního genu hrachu setého lektinu pomocí PCR: metodika pro praxi
Vráblík, Aleš ; Hodek, Jan ; Ovesná, Jaroslava
Metodika popisuje detekci vnitřního genu hrachu setého lektinu pomocí PCR a real-time PCR s využitím nově vyvinutých specifických primerů. Podstatou zkoušky je zjistit ve vzorku přítomnost nukleotidové sekvence specifické pro lektin, vnitřní gen hrachu setého. Vzhledem k tomu, že v řadě matric je DNA poškozena výrobními postupy, využívá se amplifikace krátkého úseku DNA. Po amplifikaci cílové DNA metodou PCR následuje elektroforetická separace PCR produktů v agarózovém gelu. V transiluminátoru se poté v UV světle vizualizuje hledaný PCR produkt v podobě proužku svítícího na gelu v předem určené pozici. Nově vyvinuté primery byly rovněž verifikovány pro metodu real-time PCR s využitím SYBR® Green detekce. U dané metody byla ověřena specificita a rovněž byl stanoven detekční a kvantifikační limit.
Plný text: PDF
|
| |
|
Metodika identifikace původců fuzarióz klasu pomocí PCR
Sumíková, Taťána ; Gabrielová-Slezáková, Ludmila ; Žabka, Martin
Cílem navrhované metodiky je uvedení kompletních protokolů k detekci následujících druhů r. Fusarium - F. avenaceum, F. culmorum, F. poae, F. graminearum, F. pseudograminearum, F. sporotrichioides - pomocí multiplex PCR. Sekvence použitých druhově specifických primerů jsou převzaté z literatury a byly vybrány tak, aby bylo možné je vzájemně a libovolně kombinovat, což umožňuje detekci jednoho nebo až všech šesti výše uvedených druhů v jedné PCR reakci. Reakce jsou optimalizovány pro použití v běžné laboratoři molekulární biologie. V metodice je nově zavedena technika pěstování mikromycet ve formě povrchových kultur na celofánu. Tato technika je speciálně určena pro následnou izolaci DNA z houbového mycelia. Technika pěstování povrchových kultur na celofánu umožňuje optimální manipulaci s napěstovaným myceliem, které se z celofánu snadno odstraní pomocí skalpelu, přičemž nedochází k nežádoucí kontaminaci vzorku agarovým kultivačním médiem nebo nečistotami z přirozeného substrátu (z napadeného vzorku).
Plný text: PDF
|
| |
|
Možnosti využití technických prostředků kontroly narkotik v silničním provozu
ŠPALEK, Dušan
ABSTRAKT Téma diplomové práce nese název Možnosti využití technických prostředků kontroly narkotik v silničním provozu. Cílem práce bylo popsat, porovnat a zhodnotit vyhledávací metody, které se používají při silniční kontrole návykových látek veřejnými činiteli. Teoretická část je zaměřená na popis jednotlivých skupin návykových látek, jejich účinků a projevů na lidský organismus. Dále teoretická část obsahuje přehled nejčastěji používaných analytických metod. Praktická část řeší problematiku využití detekčních pomůcek u služby dopravní Policie ČR. Na základě použité metodiky, která zahrnovala průzkum domácích i zahraničních pramenů a cíleně zaměřený rozhovor, byly všechny získané poznatky důkladně vyhodnoceny a ilustrují podstatu tématu. Tato diplomová práce je strukturována tak, aby ji bylo možné využít pro činnost policejních složek a ostatních organizací, které se podílí na boji proti užívání návykových látek. Práce by také mohla být přínosem pro výuku jako studijní materiál. ?
|
| |
|
Metodika diagnostiky virů rodu Vitivirus v rostlinách révy vinné v ČR: Metodika pro útvary státní správy
Komínek, Petr
Metodika popisuje postup detekce dvou významných virů rodu Vitivirus napadajících révu vinnou. Jde o tyto dva viry: A virus révy vinné - Grapevine virus A - GVA a B virus révy vinné - Grapevine virus B - GVB. Tyto dva viry způsobují u révy vinné poruchy růstu, které se projevují nejvíce na srůstu podnože a naštěpované odrůdy. Tím dochází ke snižování toku živin a asimilátů mezi podzemní a nadzemní částí rostliny, snižování životaschopnosti keře a tím i k snižování výnosů. Extrémním případem je inkompatibilita podnože a naštěpované části, kdy naštěpovaná část přiroste jen málo a nadzemní část rostliny během tří let zcela odumírá. Příznaky virové infekce se na listech napadených rostlin většinou neprojevují. Přítomnost těchto virů v rostlinách révy vinné lze testovat snadno dostupnými metodami ELISA nebo RT-PCR. Test ELISA je levnější, ale méně citlivý. Ve většině případů však pro stanovení přítomnosti jmenovaných virů postačuje. Test RT-PCR je dražší, většinou však také citlivější. Používáme ho také pro potvrzení sporných výsledků testu ELISA.
Plný text: PDF
|
|
Metodika stanovení rozšíření virů révy vinné ve výsadbách v ČR: metodika pro útvary státní správy
Komínek, Petr
Metodika popisuje postup stanovení napadení výsadeb révy vinné viry. Pro detekci virů použijeme metodu ELISA, která je svojí cenou a možností testování velkého množství vzorků najednou k tomuto účelu zvláště vhodná. Požadavky na zdravotní stav množitelského materiálu jsou dány zákonem č. 219/2003 Sb. a navazující vyhláškou č. 332/2006Sb, které zapracovávají i příslušné předpisy Evropských společenství. Dle této platné legislativy je povinné testování množitelského materiálu révy na GFLV, ArMV, GLRaV-1, GLRaV-3 a u podnožové révy ještě GFkV.
Plný text: PDF
|
| |