|
|
Statistika směrových dat s využitím v krystalografii
Karafiátová, Iva ; Šedivý, Ondřej (vedoucí práce) ; Hlubinka, Daniel (oponent)
V této práci se nejprve seznámíme se základními krystalografickými pojmy včetně principu metody EBSD zkoumající mikrostrukturu látky. Následně před- stavíme šest nejčastěji užívaných popisů trojrozměrné orientace krystalické mřížky vzhledem k referenčnímu systému souřadnic a převody mezi nimi. Hlavním té- matem práce je odvození metod pro odhad střední hodnoty orientace zrna v po- lykrystalu. Tato charakteristika má velký význam v krystalografii, kde se často orientace zrna vyjadřuje jednou reprezentativní hodnotou bez ohledu na její va- riabilitu v rámci zrna. Odvozené metody aplikujeme na reálná data pocházející z výzkumu mikrostruktury slitiny hliníku. 1
|
|
|
Bioinformatic analysis of protein/DNA interactions
Božíková, Paulína ; Schneider, Bohdan (vedoucí práce) ; Hašek, Jindřich (oponent)
V této práci jsme analyzovali lokální strukturu DNA páteře v DNA vázané v kom- plexech s proteiny a volné DNA, a závislost lokální struktury na typu párování a na sekvenci. Za tím účelem jsme analyzovali přibližně 1400 krystalových struktur DNA v komplexech s proteiny a více než 400 krystalových struktur DNA nevázané v komplexech s proteiny. Lokální konformace DNA byly klasifikovány do 38 tříd dinukleotidových konformerů ntC popsaných dříve (Svozil et al. Nucleic Acids Res. 2008), které byly dále sdruženy do 16 klastrů strukturní abecedy ntA, aby- chom redukovali počet analyzovaných proměnných. Strukturní třídy ntA dinu- kleotidů tvořících páry bazí v dvoušroubovicích DNA byly uspořádány do tzv. Asociačních matic tak, že řádky a sloupce matic jsou označeny třídami ntA právě vázaných dinukleotidů. Analyzovali jsme tři základní matice. Dvě pro dinukleotidy vázané pouze do Watson-Crickových párů v protein/DNA komplexech, respektive v samotných DNA. Třetí matice byla sestrojena pro dinukleotidy vázané i jinými než Watson-Crickovými páry. Asociační matice jsme rovněž zkoumali v závislosti na sekvenci přispívajících dinukleotidů. Provedené analýzy ukazují rozdíly ve struk- turním chování různých...
|
|
|
Simulace rentgenové difrakce v krystalografii
Ondříček, Adam ; Frk, Martin (oponent) ; Rozsívalová, Zdenka (vedoucí práce)
Předkládaná práce se zabývá modelováním krystalografických struktur elektrotechnických materiálu a jejich další diagnostikou v softwarového produktu CrystalMaker. Dále jsou uvedeny možnosti popisu krystalografických struktur a ovládání programu CrystalMaker. Další část ukazuje práci s reálnými daty. Poslední částí je vytvořená laboratorní úloha.
|
|
|
Analýza rentgenových difraktogramů organických krystalických látek
Stejkora, Jakub ; Žídek, Jan (oponent) ; Salyk, Ota (vedoucí práce)
Deriváty diketopyrrolopyrrolu jsou barevné pigmenty potencionálně využitelné v oblasti organických polovodičových struktur. Jejich elektronické vlastnosti jako vodivost, fotovodivost a elektroluminescence souvisí s jejich krystalografickou strukturou, která určuje transportní cestu náboje látkou. Pro určení krystalografické struktury z RTG difrakto¬metrie je třeba vypěstovat měřitelný monokrystal. Pěstování monokrystalů derivátů diketopyrrolo-pyrrolu je díky jejich malé rozpustnosti ve všech rozpouštědlech velmi obtížné. Při testování řady metod bylo získáno několik relativně vhodných, pravděpodobně i měřitelných vzorků. Jeden z těchto vzorků byl následně proměřen pomocí RTG difraktometrie a na základě tohoto měření byla nalezena a spočtena jeho krystalografická struktura.
|
host ::
RSS.