|
|
Effect of exposure to bisphenol A on gene expression in the testicular tissue in male mice
Dorosh, Andriy ; Elzeinová, Fatima ; Žatecká, Eva ; Kubátová, Alena ; Pěknicová, Jana
Laboratory of Reproductive Biology, Institute of Biotechnology, Academy of Sciences of the Czech Republic, v.v.i., Prague, Czech Republic Bisphenol A (BPA) is a synthetic, endocrine-disrupting compound able to directly bind estrogen receptors. Free BPA has been detected in human samples indicating that humans are internally exposed to BPA. The purpose of this study was to analyse the effect of BPA on the male reproductive system and testicular gene expression in germ cells. We studied the influence of long-term low concentration BPA exposition on male fertility in vivo in a two-generation study in C57BL/6 mouse strain. In this work, BPA was added with water at two environmentally relevant concentrations: 0, 4 and 4 µg/l. We measured the reproductive organs weight and sperm cells morphology and quality. Expression of genes involved in endocrine regulation and energy metabolism in testis was analysed after BPA exposure. Next, the epigenetic mechanisms of gene expression and regulation during the germ cell differentiation and effect of BPA will be analysed.
|
|
|
Reportéry genové exprese u \kur{Drosophila melanogaster}.
ŠTROS, Jiří
Drosophila melanogaster je široce používaný modelový organismus v genetice a v dalších disciplínách souvisejících s lékařsky a biotechnologicky významnými problémy. První část práce podává přehled některých základních genetických nástrojů a reportérů genové exprese používaných při práci s D.melanogaster s důrazem na reportérový gen GFP. Druhá část podává popis a výsledky experimentální práce zaměřené na reportérový konstrukt sestávající z genu adenosin deaminasy (ADGF-A) a značky GFP. Při práci s reportéry genové exprese, jako je GFP, je důležité vědět, zda přítomnost reportéru neovlivňuje studovaný proces. Experiment popsaný v této práci testoval, zda je fúzní protein sestávající z adenosin deaminasy a GFP plně funkčním enzymem, nebo zda je aktivita enzymu ovlivněna přítomností fluorescenční značky. Výsledky práce podporují vhodnost fúzního konstruktu jako reportéru genové exprese.
|
|
| |
|
| |
|
|
Patogeneze klíšťové encefalitidy a její ovlivnění genetickým pozadím hostitele
PALUS, Martin
Práce se zabývala vlivem genetického pozadí hostitele na patogenezi klíšťové encefalitidy. U rekombinantních kongenních kmenů myšířady CcS/Dem po intracerbrální a subkutánní inokululaci virem klíšťové encefalitidy byla sledována letalita, titr viru v různých orgánech a klinické projevy klíšťové encefalitidy. Důraz byl zejména kladen na produkci virus-neutralizačních protilátek a expresi imunologicky významných genů v centrální nervové soustavě.
|
|
|
Změny globální genové exprese v lidských neurálních buňkách po infekci virem klíšťové encefalitidy
TYKALOVÁ, Hana
Our study was focused on the effect of tick-borne encephalitis virus infection on global gene expression in two human neural cell lines (neuroblastoma and glioblastoma). Changes of gene expression were determined using microarray approach. We identified several genes with up-or down-regulated expression in neural cells following the infection. The changes in expression of some of them were similar in both cell lines,other exhibited different pattern.
|
|
| |
|
| |
|
|
Klastrování genů s podobným regulačním mechanismem během monocytární a garanulocytární diferenciace buněk HL-60
Koutná, I. ; Faltýsková, E. ; Krontorád, P. ; Svoboda, Z. ; Pavlík, T. ; Bártová, Eva ; Kozubek, Michal ; Kozubek, Stanislav
V předkládané studii byly pomocí vysokokapacitních cDNA čipu obsahujících 19,000 sekvencí, provedeny studie expresních profilů promyelotických leukemických buněk HL-60 diferencujících do monocytů (MD) a granulocytů (GD). Jako diferenciační činidlo pro monocytární diferenciaci bylo použito TPA (12-O-tetradecanoylphorbol-D-acetate) a pro granulocytární proces DMSO. Studiem expresních profilů bylo zjištěno že v průběhu MD signifikantně měnilo expresi 4625 genů a v průběhu GD 4760 genů. Geny obou diferenciací byly rozděleny do podle typu kinetiky s jakou se účastní diferenciace do tzv. R-skupin. Bylo zjištěno, že geny z jednotlivých R-skupin nejsou nenáhodně rozprostřeny na chromosomových teritorií, ale formují na chromosomech klastry. Skupiny genu s podobnou kinetikou regulace tedy můžeme najít na chromosomech blízko sebe.
|
|
|
Analýza genové exprese kolorektálního karcinomu detekované cDNA mikročipy pomocí kombinace různých vyhodnocovacích přístupů
Jansová, E. ; Krontorád, P. ; Svoboda, Z. ; Koutná, I. ; Pavlík, T. ; Kozubek, Michal ; Jarošová, M. ; Žaloudík, J. ; Kozubek, Stanislav
Tato práce je zaměřená na porovnání genové exprese kolorektálního karcinomu a zdravé epiteliální tkáně tlustého střeva pomocí Human 1.7K cDNA mikročipů a identifikace genů se změněnou expresí v nádorové tkáni. Tato studie byla provedena na 12 pacientech s nádorem tlustého střeva. Pro zajištění důvěryhodnosti dat byla analýza cDNA microarray provedena kombinací několika programů pro analýzu obrazu a statistických metod. Výsledkem této analýzy byla identifikace 22 genů se změněnou expresí v nádorové tkáni oproti zdravému epitelu. Pomocí hierarchického klastrování byla provedena klasifikace pacientů s kolorektálním karcinomem podle výskytu metastáz v lymfatických uzlinách a bylo detekováno 6 genů, které by mohly sloužit jako potenciální metastatické markery.
|
host ::
RSS.