|
|
Molecular biology of soil fungi participating in litter decomposition in forest ecosystems
Voříšková, Jana ; Baldrian, Petr (advisor) ; Gryndler, Milan (referee) ; Koukol, Ondřej (referee)
In forest ecosystems, substantial part of carbon enters soil in the form of plant litter. The decomposition of litter and soil organic matter represents an important process affecting nutrient cycling and carbon balance in soils. Fungi are considered the primary decomposers in terrestrial ecosystems due to the production of wide range of extracellular enzymes that allow them to attack the lignocellulose matrix in litter. Even if fungi represent key players in organic matter decomposition, the information about the structure and diversity of their communities is still limited and the roles of individual fungal taxa in forest soils remain unclear. This Ph.D. thesis focused on the characterization of fungal communities in forest soils and their potential to decompose plant litter. The method for in-depth analysis of complex microbial communities from environmental samples was established and used. In addition, single eukaryotic functional gene was analysed in soil for the first time at a depth that allowed reliable estimation of diversity. It was demonstrated that microbial community composition differs among horizons of forest soil profile. Despite similar diversity, significant differences in microbial community composition were observed between the DNA and RNA. Several microbial groups highly...
|
|
|
Ecological roles of bacteria associated with plant litter
Tláskal, Vojtěch ; Baldrian, Petr (advisor) ; Seydlová, Gabriela (referee)
Leaf litter in temperate forests represents an important input of carbon into the soil. Main players in the decomposition of leaf litter are fungi and bacteria. While the role of fungi in litter decomposition was repeatedly addressed, there are just a few field studies where litter-associated bacteria were also considered. The aim of this work was to summarize available literature studying the structure and function of bacterial community during litter degradation. The nature of different possible substrates is discussed. Genetic approach is briefly outlined. Factors such as diversity, spatially distribution and abiotic factors that can influence community are also considered. It can be supposed that community composition changes with the change of litter chemistry and nutrient availability. The development of bacterial community might be driven by the decreasing availability of nutrients in litter. Labile compounds are utilised at the beginning of decomposition, while recalcitrant substrates are utilised later by specialist taxa. Members of the phyla Actinobacteria, Acidobacteria, Bacteroidetes and Proteobacteria seem to be dominant during decomposition. Different types of relationships between fungi and bacteria also most likely influence the composition of community. This review shows that the bacterial...
|
|
|
Molecular biology of soil fungi participating in litter decomposition in forest ecosystems
Voříšková, Jana
In forest ecosystems, substantial part of carbon enters soil in the form of plant litter. The decomposition of litter and soil organic matter represents an important process affecting nutrient cycling and carbon balance in soils. Fungi are considered the primary decomposers in terrestrial ecosystems due to the production of wide range of extracellular enzymes that allow them to attack the lignocellulose matrix in litter. Even if fungi represent key players in organic matter decomposition, the information about the structure and diversity of their communities is still limited and the roles of individual fungal taxa in forest soils remain unclear. This Ph.D. thesis focused on the characterization of fungal communities in forest soils and their potential to decompose plant litter. The method for in-depth analysis of complex microbial communities from environmental samples was established and used. In addition, single eukaryotic functional gene was analysed in soil for the first time at a depth that allowed reliable estimation of diversity. It was demonstrated that microbial community composition differs among horizons of forest soil profile. Despite similar diversity, significant differences in microbial community composition were observed between the DNA and RNA. Several microbial groups highly...
|
|
|
Charakterizace společenstva hub, podílejícího se na rozkladu opadu v jehličnatých lesích Národního parku Šumava
Žifčáková, Lucia ; Baldrian, Petr (advisor) ; Schierová, Michaela (referee)
Understanding of carbon cycling in coniferous forests that represent a large carbon sink is crucial for our understanding of natural processes under global climate change. Recognition of fungi as fundamental decomposers can contribute to this understanding. Fungi are able to decompose numbers of substrates and possess a variety of enzymes to do so In this study I present litter decomposing fungi in mountain spruce forest from national park Šumava. The aim of my thesis was to follow succession and community changes of fungi from the early stages of decomposition of Picea abies needles until degradation of organic matter in the organic horizon of the soil. This aim was accomplished partly by recording the extracellular enzyme production of fungi in different stages of decomposition from needles attached to the twigs of a fallen tree to a litter material in later stages of decomposition on the soil surface. In addition to testing of fungi on their natural substrata - needle litter, enzyme activities were also measured in laboratory agar cultures, which allow comparison of diverse fungi with different origins. Enzyme activities were aimed at enzymes decomposing cellulose and compounds found in litter. Although ecology of endophytic and saprothrophic fungi suggest differences in enzyme production, these...
|
|
|
The current condition of soil organic matter in Stropnicko selected sites
BOROVKA, Jan
The main objective of this thesis was to determine the current status of soil organic matter (SOM) in the Stropnice River basin based on the collected soil samples. SOM is a major source of carbon in the soil. The amount of soil organic carbon (SOC) in the samples was measured using the FORMACSHT TOC / TN analyser, as well as the additional module PRIMACSMCS (fa Skalar - CARBON Instruments Ltd.). The values measured in 2014 were compared according to the land use (woodland, grassland, arable land) and the depth of sampling (A: 0-15 cm, B: 15 - 30 cm, C: 30 - 45 cm). Furthermore, these values were compared with values from 2001 and 2007. The highest SOC concentration was found in the upper layers of forest soils, grassland soils showed lower SOC content, whereas the arable land showed the lowest amount of SOC. Over the time, depletion of SOC is evident for all categories of land use.
|
|
| |
|
| |
|
|
Vliv hospodářských zásahů na změnu v biologické rozmanitosti ve zvláště chráněných územích: Zhodnocení vlivu hospodářských zásahů na diverzitu půdních biot ve vybraných zvláště chráněných územích
Ústav půdní biologie AV ČR, České Budějovice ; Tajovský, Karel ; Starý, Josef ; Nováková, Alena ; Lukešová, Alena ; Háněl, Ladislav ; Balík, Vladimír ; Pižl, Václav
Cílem dílčího projektu, jehož řešení je rozvrženo do čtyř let (2000-2003), je shromáždění základních poznatků o diverzitě modelových skupin půdních organismů na lokalitách Trojmezná a Smrčina, NPR Boubín a NPR Žákova hora, a vyhodnocení vlivu hospodářských zásahů na půdní biotu v těchto územích. Syntéza získaných poznatků slouží k navržení vhodného managementu porostů vedoucímu k zachování a ochraně biodiverzity. Tato zpráva je shrnutím výsledků v roce 2000 a 2001. Materiál a data z podzimních odběrů v roce 2001 jsou v případě některých skupin půdních biot ve fázi zpracování či následných analýz a nemohly být vzhledem k termínu odevzdání do této zprávy zahrnuty.
|
|
|
Vliv hospodářských zásahů na změnu v biologické rozmanitosti ve zvláště chráněných územích: Vliv hospodářských zásahů a dynamiky prostoru na stav půd a přízemní vegetace lesních ekosystémů ve zvláště chráněných územích
Česká zemědělská univerzita v Praze, Fakulta lesnická a environmentální, Katedra pěstování lesů, Praha ; Viewegh, Jiří ; Podrázský, Vilém
Tato zpráva dokumentuje aktivity pracoviště, LF ČZU v Praze, jako spoluřešitele výzkumného projektu. Zahrnuje literární rešerši k degradaci stanoviště vlivem odstranění humusové vrstvy, dále k vlivu výchovných zásahů na dynamiku půdní organické hmoty, ke vlivu změny druhové skladby na stav humusových forem a v závěru uvádí půdní charakteristiky významné z hlediska ekologické stability a managementu lesních ekosystémů. Vlastní šetření se zaměřilo na popis přízemní vegetace a na odběr půdních vzorků v určených oblastech, daných zadavatelem. K nim byly přiřazeny lokality: Žákova hora v oblasti Žďárských vrchů na Českomoravské vrchovině, dále pak oblast Smrčiny a tzv. Trojmezenského pralesa na Šumavě. Na těchto lokalitách byly provedeny fytocenologické zápisy a odebrány vzorky humusových forem na stanovištích s různým stavem lesních porostů a s různými hospodářskými zásahy, resp. s těžbou stromů (Šumava).
|
|
|
Společné memorandum projektů GS LČR a VaV620/1/02 ke způsobu hospodaření v lesích Jizerských hor
IFER - Ústav pro výzkum lesních ekosystémů‚ s.r.o., Strašice ; Černý, Martin
Zpracování návrhu "Memoranda" se opírá o výsledky a doporučení projektu VaV/620/1/02 "Formulace zásad lesnického hospodaření a péče o půdu s ohledem na dlouhodobou acidifikaci, nutriční degradaci a eutrofizaci lesních půd" a projektu financovaného Lesy České republiky s.p. "Lesnické hospodaření v Jizerských horách". Cílem projektu byla příprava společného memoranda projektů "Lesnické hospodaření v Jizerských horách - hlavní řešitel Výzkumný ústav lesního hospodářství a myslivosti Jíloviště - Strnady, VS Opočno), zadavatel Grantová agentura Lesů České republiky s.p. a "Formulace zásad lesnického hospodaření a péče o půdu s ohledem na dlouhodobou acidifikaci, nutriční degradaci a eutrofizaci lesních půd" - hlavní řešitel IFER - Ústav pro výzkum lesních ekosystémů, s.r.o., zadavatel Ministerstvo životního prostředí. Memorandum je rozděleno do částí: 1. Klimatické podmínky. 2. Imisní situace. 3. Stav půd. 4. Stav lesních porostů. 5. Doporučení pro lesnickou pěstební praxi (obnova lesních porostů, požadavky na sadební materiál a manipulaci od jeho vyzvednutí po výsadbu, přeměny lesních porostů nevhodné druhové skladby, výchova lesních porostů, biologická meliorace, chemická meliorace).
|
guest ::
