|
Aplikace shlukové analýzy při zpracování biomedicínských dat
Rozinek, Michal ; Gazárek, Jiří (oponent) ; Havlíček, Martin (vedoucí práce)
Cílem této práce je nastudovat postupy pro klasifikaci objektů v medicíně. Zjistit pomocí jakých metod lze takovou klasifikaci provádět. Po vytvoření algoritmů v prostředí MATLAB pro klasifikační metody zjistit jejich funkčnost a spolehlivost na datovém souboru z oblasti medicíny. Formou jednoduchých testů podrobit zkoušce jednotlivé metody a zjistit v čem vynikají a v čem zaostávají. Velmi důležitou roli zde hraje i volba vstupních datových parametrů, i ty budou podrobeny testu a popsány v závěrech.
|
|
Segmentace obrazů magnetické rezonance
Hanák, Pavel ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Havlíček, Martin (vedoucí práce)
The aim of the study was based on magnetic resonance images to create a program for detection of gray and white matter by using different segmentation algorithms. First, using a selection of basic techniques, then application of advanced methods. After trying these methods, the paper deals with the most advanced method, which include the level set method.
|
|
Analýza obrazových dat funkční magnetické rezonance (fMRI)
Štens, Radovan ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Havlíček, Martin (vedoucí práce)
Diplomová práce je zaměřená na zpracování fMRI dat mapujících mozkovou aktivitu sledováním změn hladiny kyslíku v krvi. Jsou představeny nutné techniky předzpracování obrazových dat, spolu s dvěma hlavními přístupy analýzy. Je vysvětlena problematika obecného lineárního modelu, spadajícího do kategorie jednorozměrných analýz a multi- faktorových přístupů metod hlavní a nezávislé analýzy komponent. Praktická aplikace popisovaných metod je realizována na bloku měřených fMRI dat. S tím související vý- sledky, spolu s možným návrhem jejich vzájemného porovnání jsou prezentovány.
|
| |
|
Řízení tepelných zdrojů se zaměřením na spalování biomasy
Havlíček, Martin ; Chlápek, Petr (oponent) ; Máša, Vítězslav (vedoucí práce)
Bakalářská práce se zabývá řízením tepelných zdrojů se zaměřením na spalování biomasy. Cílem této práce bylo představit vlastnosti biomasy jako paliva, uvádí popis technologie kotlů středních výkonů a jejich srovnání s jinými výkonovými kategoriemi. Zhodnocuje především současné řídicí systémy biomasových kotlů středních výkonů a nabízí přehled výrobců zařízení v ČR a základní informace o situaci v zahraničí.
|
|
Simultanneous EEG-FMRI Data Fusion with Generalized Spectral Patterns
Labounek, René ; Havlíček, Martin (oponent) ; Hlinka, Jaroslav (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Lots of different data fusion strategies have been developed during last 15 years of simultaneous EEG-fMRI research. The current doctoral thesis summarizes the actual state of the art in EEG-fMRI data fusion research and puts a goal to improve task-related network visualizations blindly directly from the acquired data. Two different models which should improve it have been proposed within the thesis (i.e. generalized spectral heuristic model and generalized spatiospectral heuristic model). Generalized spectral heuristic model utilizes relative EEG power fluctuations in distinct frequency bands averaged over electrodes of interest and compares the fluctuations with delayed BOLD signal fluctuations via general liner model. The obtained results shows that the model visualizes several different frequency dependent task-related EEG-fMRI networks. The model overcomes the absolute power fluctuation approach and classic heuristic approach too. The absolute power visualized a task-not-related broadband EEG-fMRI component and classic heuristic model was insensitive to visualize the task-related visual network which was observed for the relative -band pattern for visual oddball task data. For the semantic decision task EEG-fMRI data, the frequency dependence was not so evident in final results. Since all the bands visualized only visual network and any areas of speech network, the results were possibly corrupted by not-suppressed eye-blinking artifact in EEG data. Mutual information coefficients between different EEG-fMRI statistical parametric maps showed that the similarities over different frequency bands are similar over different tasks (i.e. visual oddball and semantic decision). More, the coefficients proved that averaging over different electrodes of interest does not bring any new information into the joint analysis, i.e. the signal on one single lead is very smoothed signal from the whole scalp. For that reasons, better incorporation of the channel information into the EEG-fMRI analysis started to be necessary and we have proposed more general spatiospectral heuristic model and designed how to estimate the model with spatiospectral Group Independent Component Analysis of EEG spectra relative power. The obtained results show that spatiospectral heuristic model visualizes the statistically most significant task-related networks (compared to absolute power spatiospectral pattern results and generalized spectral heuristic model results). The spatiospectral heuristic model was the only one, which observed task-related activations in a speech areas for semantic decision data. Beyond the fusion of EEG spatiospectral patterns with fMRI data, we have tested the stability of the spatiospectral pattern estimates over different paradigms (i.e. visual oddball, semantic decision and resting-state) with k-means clustering algorithm. We have got 14 stable patterns for the absolute EEG power and 12 stable patterns for the relative EEG power. Although ten of the patterns appear similar over the power types, the relative power spatiospectral patterns (i.e. spatiospectral heuristic model patterns) have higher evidence to tasks.
|
|
Hodnocení úrovně hrubé motoriky dětí ve věku 11 až 12 let testovou baterií MABC-2 na vybrané základní škole
HAVLÍČEK, Martin
Cílem práce bylo otestovat úroveň motorických schopností dětí ve věku 11 až 12 let na vybrané základní škole. Za pomoci rešerše literatury byl analyticko-syntetickou metodou vypracován teoretický podklad. Ve výzkumu bylo testovou baterií MABC-2 otestováno 45 dětí ve věku 11 až 12 let. Testování probíhalo v prostorech ZŠ Boženy Němcové v Dačicích po informovaném souhlasu zákonných zástupců dětí. Pro charakterizování souboru bylo realizováno šetření pomocí ankety. Na základě experimentu bylo zjištěno, že dívky dosáhly lepších výsledků než chlapci v komponentě rovnováha o 0,7 percentil a v komponentě míření & chytání o 6,2 percentil. Výsledky dále ukázaly na lepší výkony sportujících v porovnání s nesportujícími průměrně o 8,8 percentil v komponentě rovnováha a o 13,1 percentil v komponentě míření & chytání. Žádnému žákovi nebylo v komponentách diagnostikováno riziko motorických obtíží spadajících do 2. pásma ani motorické obtíže spadající do 3. pásma s doporučením pro specializované vyšetření. Celkově můžeme hodnotit úroveň hrubé motoriky testovaných dětí díky percentilovým ekvivalentům jako velmi dobrou.
|
|
Analýza obrazových dat funkční magnetické rezonance (fMRI)
Štens, Radovan ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Havlíček, Martin (vedoucí práce)
Diplomová práce je zaměřená na zpracování fMRI dat mapujících mozkovou aktivitu sledováním změn hladiny kyslíku v krvi. Jsou představeny nutné techniky předzpracování obrazových dat, spolu s dvěma hlavními přístupy analýzy. Je vysvětlena problematika obecného lineárního modelu, spadajícího do kategorie jednorozměrných analýz a multi- faktorových přístupů metod hlavní a nezávislé analýzy komponent. Praktická aplikace popisovaných metod je realizována na bloku měřených fMRI dat. S tím související vý- sledky, spolu s možným návrhem jejich vzájemného porovnání jsou prezentovány.
|
|
Simultanneous EEG-FMRI Data Fusion with Generalized Spectral Patterns
Labounek, René ; Havlíček, Martin (oponent) ; Hlinka, Jaroslav (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Lots of different data fusion strategies have been developed during last 15 years of simultaneous EEG-fMRI research. The current doctoral thesis summarizes the actual state of the art in EEG-fMRI data fusion research and puts a goal to improve task-related network visualizations blindly directly from the acquired data. Two different models which should improve it have been proposed within the thesis (i.e. generalized spectral heuristic model and generalized spatiospectral heuristic model). Generalized spectral heuristic model utilizes relative EEG power fluctuations in distinct frequency bands averaged over electrodes of interest and compares the fluctuations with delayed BOLD signal fluctuations via general liner model. The obtained results shows that the model visualizes several different frequency dependent task-related EEG-fMRI networks. The model overcomes the absolute power fluctuation approach and classic heuristic approach too. The absolute power visualized a task-not-related broadband EEG-fMRI component and classic heuristic model was insensitive to visualize the task-related visual network which was observed for the relative -band pattern for visual oddball task data. For the semantic decision task EEG-fMRI data, the frequency dependence was not so evident in final results. Since all the bands visualized only visual network and any areas of speech network, the results were possibly corrupted by not-suppressed eye-blinking artifact in EEG data. Mutual information coefficients between different EEG-fMRI statistical parametric maps showed that the similarities over different frequency bands are similar over different tasks (i.e. visual oddball and semantic decision). More, the coefficients proved that averaging over different electrodes of interest does not bring any new information into the joint analysis, i.e. the signal on one single lead is very smoothed signal from the whole scalp. For that reasons, better incorporation of the channel information into the EEG-fMRI analysis started to be necessary and we have proposed more general spatiospectral heuristic model and designed how to estimate the model with spatiospectral Group Independent Component Analysis of EEG spectra relative power. The obtained results show that spatiospectral heuristic model visualizes the statistically most significant task-related networks (compared to absolute power spatiospectral pattern results and generalized spectral heuristic model results). The spatiospectral heuristic model was the only one, which observed task-related activations in a speech areas for semantic decision data. Beyond the fusion of EEG spatiospectral patterns with fMRI data, we have tested the stability of the spatiospectral pattern estimates over different paradigms (i.e. visual oddball, semantic decision and resting-state) with k-means clustering algorithm. We have got 14 stable patterns for the absolute EEG power and 12 stable patterns for the relative EEG power. Although ten of the patterns appear similar over the power types, the relative power spatiospectral patterns (i.e. spatiospectral heuristic model patterns) have higher evidence to tasks.
|
|
Specifické a kondiční testování starších žáků HC Motor České Budějovice
HAVLÍČEK, Martin
Cílem práce je testování specifických a kondičních schopností starších žáků HC Motor České Budějovice. Pomocí rešerše literatury byla obsahovou analýzou vypracována teoretická část práce. V té jsme se zaměřili na vývojové zákonitosti, blíže jsme si objasnili období pubescence. Dále jsme se zabývali fyziologickými zákonitostmi v ledním hokeji, historií ledního hokeje, tréninkových principů a testování. Výzkumná část se zabývá aplikováním testové baterie na jednotlivé hráče HC Motor České Budějovice kategorie starších žáků. Naměřené hodnoty testů na ledě byly porovnány s motorickými testy mimo led. Díky tomu jsme zjistili vzájemnou souvislost mezi dynamickou sílou explozivní a výsledky testů na ledě. Rovněž jsou patrné lepší výsledky starší věkové kategorie oproti mladší. Výsledky jsou popsány a prezentovány pomocí grafů a tabulek.
|