|
| |
|
| |
|
| |
|
|
Molekulární simulace rozhraní voda - rutil
Hanke, Hynek ; Předota, Milan (vedoucí práce) ; Lísal, Martin (oponent)
Studium strukturních a zejména dynamických vlastností rozhraní vodního prostředí s grafitovým a rutilovým povrchem poukazuje na anomální chování molekul vody v blízkosti pevné fáze. Molekuly vody se zde řadí do hustotních vrstev, které vykazují výrazně jiné vlastnosti oproti homogennímu prostředí. Vyhodnocení statistických veličin, jako jsou translační i rotační difuzivita, rezidenční časy a autokorelační funkce vektorů orientace, ukazuje, že v závislosti na lokální hustotě, přítomných interakcích i geometrické struktuře povrchu může být translace a rotace molekul vlivem rozhraní nejen významně omezena, ale v některých případech i usnadněna. Námi rozvinutá metodika měření statistických rotačních veličin v blízkosti rozhraní pevná látka - kapalina překonává obtíže, které jsou s měřením dynamic kých veličin v silně nehomogenním prostředí spojeny, a to způsobem, který lze aplikovat i na další modelové systémy tohoto typu.
|
|
|
Linear semiflexible polyelectrolytes in solutions
Bačová, Petra ; Limpouchová, Zuzana (vedoucí práce) ; Lísal, Martin (oponent)
Název: Lineární semiflexibilní polyelektrolyty v roztocích Řešitel: Petra Bačová Ústav: Katedra fyzikální a makromolekulární chemie Školitel: Doc. Ing. Zuzana Limpouchová, CSc. E-mail školitele: zl@vivien.natur.cuni.cz Konzultant: Mgr. Peter Košovan, PhD. Abstrakt: V předložené diplomové práci jsem se zabývala využitím MD simulací při studiu chování nabitých polymerů (polyelektrolytů) v roztocích. Velká část polyelektrolytových řetězců je semiflexibilní a narozdíl od neutrálních polymerů můžeme jejich ohebnost ovlivňovat kvalitou rozpouštědla, například změnou iontové síly. Flexibilitu řetězce můžeme popsat pomocí persistentní délky. Diplomová práce ukazuje, jak je možné vyjádřit persistentní délku z orientační korelační funkce, jejíž hodnota pro studovaný systém klesá dvojexpo- nenciálně. To znamená, že ohebnost řetězce lze popsat dvěma příspěvky, přičemž v diplo- mové práci se zabývám zejména jedním znich, který lze vyjádřit pomocí elektrostatické persistentní délky. Vliv přidané soli na konformaci řetězce je studován v rámci Debye- Hückelovy aproximace. Výsledky MD simulací jsou porovnány s OSF teorií a s variačními výpočty podle Manghiho a Netze. Předložená práce popisuje...
|
|
| |
|
|
Scaling Laws for Polymers in Dissipative Particle Dynamics Revised
Posel, Z. ; Lísal, Martin
We present here a systematic study of dynamic behavior for polymer (PE) melt by means of Dissipative Particle Dynamics (DPD). We used DPD spring potential between adjacent segments. By changing various parameters related to spring potential like stiffness k, equilibrium distance r0 and parameters related to dynamic behavior like friction coefficient γ presented in dissipation force we tested their influence on scaling laws. We also compared these scaling laws obtained from our simulations with predictions from Rouse theory.
Plný text:  PDF
|
|
| |
|
| |
|
|
Nedávné pokroky v molekulárních simulacích termodynamického chování tekutých soustav.
Aim, Karel ; Lísal, Martin ; Nezbeda, Ivo ; Ungerer, P. ; Teuler, J.-M. ; Rousseau, B.
Je podán přehled o nedávných pokrocích ve vyvíjení metod molekulárních počítačových simulací pro výpočty fázových rovnovah a termodynamických vlastností tekutých systémů. Pozornost je věnována zvláště následujícícm metodologiím: (i) “reaction Gibbs ensemble Monte Carlo” (RGEMC), která dovoluje přesné předpovědi fázových rovnovah pro směsi s využitím experimentálních dat tlaku nasycených par ve výpočetním postupu, (ii) přímé simulace Monte Carlo joule-thomsonovských procesů, (iii) Monte Carlo simulace procesů za konstantní entropie a (iv) implementovaná verze Gibbs ensemble Monte Carlo (GEMC) s paralelizovaným vzorkováním, která obchází nutnost fyzického přenosu složitých molekul mezi boxy reprezentujícími rozdílné fáze výpočtem chemického potenciálu v souboru NVT (a je použitelná rovněž pro flexibilní molekuly). Prezentovány jsou příklady použití uvažovaných simulačních metod pro reálné tekuté soustavy.
|
host ::
RSS.