|
|
Modelování dýchací soustavy
Matoušek, Josef ; Roleček, Jiří (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá simulací dýchací soustavy. Cílem studie je porozumění dýchací soustavy lidského organismu, společně s volbou vhodných algoritmů a jejich následnou implementací do matematického modelu. Modely jsou realizovány v rozhraní Simulink, které je součástí prostředí Matlab. Podobné modely jsou v praxi využívány pro výzkum lékařské techniky, především u umělé plicní ventilace. Praktické využití, zejména popsaného kombinovaného modelu v grafickém rozhraní GUIDE - rovněž implementovaného v prostředí Matlab, je vhodné pro názornou výuku a simulaci biologických procesů dýchací soustavy.
|
|
|
Fixace biologických vzorků
Brachtl, Martin ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Krátká, Lucie (vedoucí práce)
Cílem diplomové práce je seznámit se s možností fixace biologických vzorků. Vybrat a fixovat vhodnou tkáň pomocí formaldehydu a dalšího fixačního prostředku. V neposlední řadě provést měření pro zjištění vlivu formaldehydu a dalšího fixačního prostředku na relaxační vlastnosti daného biologického vzorku. Myší mozky byly vybrány jako vhodná tkáň pro fixaci. Měření vlivu formaldehydu a dalšího fixačního prostředku na relaxační vlastnosti tkáně probíhalo na Ústavu přístrojové techniky Akademie věd České republiky.
|
|
|
Kvantifikace T1 pro preklinické MRI
Dvořáková, Lenka ; Macíček, Ondřej (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Kvantifikace T1 mapy myokardu je důležité pro diagnostiku myokardické fibrózy. Kardiální magnetická rezonance malých zvířat je obtížná z důvodu vysoké srdeční a respirační frekvence. Pulsní sekvence navržené v této práci jsou typu IR FLASH a Intragate FLASH. Sekvence IR FLASH byla porovnána s referenční sekvencí RARE na statickém fantomu. Obě sekvence byly aplikovány během měření myokardu potkana. Pro kvantifikaci T1 byl vyvinut software v prostředí Matlab. Pomocí tohoto softwaru byly vyhodnoceny T1 mapy myokardu potkana.
|
|
|
Modelování v perfusním MR zobrazování
Válková, Hana ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Kratochvíla, Jiří (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá perfuzní analýzou pomocí magnetické rezonance DCE-MRI. Práce v úvodu popisuje problematiku akvizice dat pro DCE-MRI, nutnost použití kontrastních látek a přibližuje základní principy perfuzní analýzy. Dynamické chování kontrastní látky během distribuce v cévním řečišti lze popsat arteriální vstupní funkcí (AIF). Podoba křivek co nejblíže oblasti zájmu je ovlivněna tzv. disperzními jevy (VTF) vlivem distribuce kontrastní látky k oblasti zájmu. V konečném důsledku je systémové chování tkáně popsáno reziduální funkcí tkáně (TRF). V praktické části diplomové práce byly realizovány modely křivek AIF, VTF a TRF. Dále byl vytvořen simulační program pro snadnou práci s modely, jenž umožňuje provádět odhady perfuzních parametrů na základě neslepé dekonvoluce. Metoda byla ověřena na syntetických datech a ilustrována na klinických datech pacienta s karcinomem ledvin.
|
|
|
Měření difúsního koeficientu membrán dialyzačních filtrů
Kašák, Pavel ; Bartoš, Michal (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá měřením difusního koeficientu dialyzační membrány. V první části se zabývá možnostmi modelování membrán. Jsou zde popsány základní modely, jež nám umožňují za pomoci matematického aparátu stanovit základní vlastnosti dialyzačních membrán, jako jsou permeabilita, koeficient propustnosti a další. V další části jsou popsány základní typy membrán a jejich vlastnosti. Hlavní část je zaměřena na vytvoření experimentální aparatury, jejíž pomocí budeme simulovat prostup kontrastní látky, používané při DCE-MRI, přes dialyzační membránu. Poslední kapitola teoretické části práce se zabývá odvozením výpočetních vztahů pro určení difusního koeficientu dialyzační membrány. Následuje praktická část, v níž je za pomoci navržené aparatury stanovena hodnota difusního koeficientu u dvou kontrastních látek Gadovist® a Multihance®.
|
|
|
Metody akvizice pro DCE-MRI
Kudlička, Petr ; Kratochvíla, Jiří (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
V této diplomové práci popisuji základy měření magnetickou resonancí. Zamě-řuji se především na metody DCE-MRI s T1 váhováním o¬brazu. Zmiňuji základní kon-trastní látky užívané v MRI zobrazování. Popisuji vybrané pulsní sekvence, se kterými dále pracuji v praktické části - experimentální měření koncentrace kontrastní látky ve vzorku. Sestavil jsem akviziční protokoly pro experiment. Praktické měření se bude provádět na 1,5 T silném magnetu na pracovišti Masarykova onkologického ústavu v Brně. Dále jsem rozšířil stávající software o funkce pro zpracování IR TurboFLASH dat a perfusní analýzu časových sekvencí a její vyhodnocení. V závěru provádím disku-si zpracovaných naměřených dat.
|
|
|
Lícování ultrasonografických obrazových sekvencí
Kubica, Roman ; Mézl, Martin (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Výsledkem této práce, zabývající se lícováním medicínských obrazů, je automatický registrační algoritmus. Ten je konstruován a testován na práci s reálnými ultrazvukovými snímky, pořízenými pomocí perfusního zobrazování. Ve svém úvodu se práce věnuje metodám registrace, dále specifikuje jednotlivé druhy optimalizačních principů a jednotlivé kriteriální funkce sloužící k rozhodování o správné vzájemné poloze obrazů. Na základě teoretické části jsou realizovány tři optimalizační algoritmy užívající tři kriteriální funkce, sloužící k lícování dodaných ultrazvukových sekvencí. Tyto algoritmy jsou testovány a výsledky podrobeny analýze, na jejímž základě jsou hodnoceny výhody a nevýhody jednotlivých postupů.
|
|
|
Akvizice MRI obrazových sekvencí pro preklinické perfusní zobrazování
Krátká, Lucie ; Bartoš, Michal (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Úkolem diplomové práce je prostudovat akviziční metody pro perfusní zobrazování zaloţené na dynamickém MR zobrazování s T1 kontrastem. Jsou zde popsány metody měření relaxačního času T1 a moţnosti hodnocení výsledků. Dále jsou zde popsány fantomy a způsob jejich vyuţití. A je zde zmíněn akviziční protokol pro dynamické perfusní zobrazování. Dále je zde podrobně popsán vytvořený program pro automatické ovládání NMR systému. V experimentální části jsou provedena měření na statickém a dynamickém fantomu a jsou zde také vyhodnoceny perfusní parametry ze sekvence Flash.
|
|
|
Formáty obrazových dat
Wolanský, David ; Bartoš, Michal (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá podrobnou analýzou grafického formátu GIF. Dělí se na dvě základní části, teoretickou a praktickou. Teoretická část zahrnuje důkladný rozbor interní strukturu souboru, tj. popis jednotlivých typů bloků, ze kterých se soubor skládá. Charakteristika každého typu bloku představuje popis vlastností a detailní popis jeho jednotlivých položek. Součástí je i stručná charakteristika nejpoužívanějších kompresních metod aplikovaných v oblasti komprese obrazových dat. Praktická část zahrnuje návrh a realizaci výukové aplikace pro přehledné zobrazení interní struktury souboru vybraného obrázku typu GIF a jeho parametrů. Realizace aplikace spočívá v tvorbě algoritmů pro selekci jednotlivých typů bloků a v konstrukci grafického rozhraní aplikace.
|
|
|
Akvizice a předzpracování MRI obrazových sekvencí pro klinické perfusní zobrazování
Krchňavý, Jan ; Bartoš, Michal (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato diplomová práce popisuje teorii pro statické a dynamické magneto-rezonanční zobrazování s použitím kontrastní látky ovlivňující relaxační dobu T1. Jsou popsány dostupné akviziční metody v určeném nemocničním zařízení Masarykova onkologického ústavu v Brně. Jsou vybrány vhodné sekvence pro následné experimentální měření. Jsou popsány použití fantomy. Definován je akviziční protokol pro měření a navrhnut je způsob hodnocení naměřených dat. Pomocí odhadu relaxační doby T1, citlivosti a poměru signálu k šumu je vybrána nejvhodnější sekvence a metoda pro dynamické měření. Je provedena perfusní analýza a zjištěny perfusní parametry dynamického měření. Práce byla podpořena Evropským fondem pro regionální rozvoj a státním rozpočtem České republiky (OP VaVpI - RECAMO, CZ.1.05/2.1.00/03.0101)
|
host ::
RSS.