|
|
Analýza dat z difuzního zobrazování MR
Guzmická, Lea ; Mézl, Martin (oponent) ; Fabíková, Veronika (vedoucí práce)
Táto práca sa zaoberá problematikou difúzneho MRI zobrazovanie. Na túto problematiku nazerá od metód nasnímania až po metódy spracovania pričom sa sústreďuje na voľbu správneho výberu softvéru pre spracovanie difúznych dát. Práca je rozdelená do 7 kapitol. Zo začiatku sú riešené základné princípy MRI zobrazovania, meracie parametre, jav difúzie a jednotlivé metódy dMRI. Druhá časť práce sa venuje porovnaniu softvérov spracovania difúznych dát a samostatnej analýze pre konkrétnu štúdiu porovnania zdravých kontrol a pacientov postihnutých poruchou príjmu potravy.
|
|
|
Classification of glioma grading in brain MRI
Olešová, Kristína ; Mézl, Martin (oponent) ; Chmelík, Jiří (vedoucí práce)
This thesis deals with a classification of glioma grade in high and low aggressive tumours and overall survival prediction based on magnetic resonance imaging. Data used in this work is from BRATS challenge 2019 and each set contains information from 4 weighting sequences of MRI. Thesis is implemented in PYTHON programming language and Jupyter Notebooks environment. Software PyRadiomics is used for calculation of image features. Goal of this work is to determine best tumour region and weighting sequence for calculation of image features and consequently select set of features that are the best ones for classification of tumour grade and survival prediction. Part of thesis is dedicated to survival prediction using set of statistical tests, specifically Cox regression
|
|
|
Evoluční algoritmy pro řešení globálních optimalizačních problémů
Dragon, Ondřej ; Kozumplík, Jiří (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato práce je věnována evolučním algoritmům a řešením globálních optimalizačních problémů, a to hlavně problému obchodního cestujícího. Problém obchodního cestujícího je podrobně rozebrán stejně jako metody jeho řešení, kterými jsou: teorie grafů, heuristické metody a evoluční algoritmy. Hlavní optimalizační metodou této práce, je Inver - over operátor. V závěru jsou implementovány vybrané metody a je provedeno jejich testování a vyhodnocení na jednotlivých datových souborech.
|
|
|
Stresss and fatique detection in complex driver's data
Šimoňáková, Sabína ; Králík, Martin (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Main aim of our thesis is fatigue and stress detection from biological signals of a driver. Introduction contains information on published methods of detection and thoroughly informs readers about theoretical background necessary for our thesis. In the practical application we have firstly worked with a database of measured rides and subsequently chose their most relevant sections. Extraction and selection of features followed afterward. Five different classification models for tiredness and stress detection were used in the thesis and prediction was based on actual data. Lastly, the final section compares the best model of our thesis with the already published results.
|
|
|
Detekce a lokalizace mikrobiálních kolonií pomocí algoritmů hlubokého učení
Čičatka, Michal ; Vičar, Tomáš (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Díky masivnímu rozšíření hmotnostní spektrometrie a neustálému zdražování lidské práce se v současné době nabízí otázka optimalizace přípravy mikrobiálních vzorků. Tato diplomová práce se věnuje návrhu a implementaci algoritmu strojového učení pro segmentaci obrazů mikrobiálních kolonií kultivovaných na Petriho miskách. Algoritmus bude použit v ovládacím software přístroje MBT Pathfinder společnosti Bruker s. r. o., jehož úkolem je automatizace procesu roztěru mikrobiálních vzorků na MALDI destičky. V rámci práce bylo implementováno několik modelů segmentačních neuronových sítí na bázi architektur UNet, UNet++ a ENet. Na základě množství experimentů zkoumajících různé konfigurace sítí a předzpracování trénovacího datasetu byl pro použití v produkčním prostředí vybrán model ENet s čtyřnásobným množstvím filtrů a přidaným konvolučním blokem enkodéru trénovaný na datasetu obrazů misek s aplikovanou kruhovou maskou.
|
|
|
Epidemiologické modelování šíření nemoci Covid-19
Motlíčková, Klára ; Ředina, Richard (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá matematickým kompartmentovým modelováním pandemie COVID-19. Jsou zde přiblíženy základní epidemiologické modely a uvedeno šest studií, které se zabývají chováním viru SARS-CoV-2 za různých podmínek. Na modelu SIR je proveden odhad parametrů, výpočetně pro první a čtvrtou vlnu epidemie, dále pomocí algoritmu v prostředí MATLAB provedena optimalizace pro všechny vlny epidemie v ČR a také pro čtvrtou vlnu epidemie na modelu SEIR. Pro model SIR je také modelován vliv protiepidemických opatření.
|
|
|
Segmentace fibrotické srdeční tkáně v MRI datech
Sokol, Norbert ; Mézl, Martin (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Zobrazovanie pomocou kardiovaskulárnej magnetickej rezonancie s neskorým sýtením gadolíniom sa dá využiť pre zobrazenie preablačnej fibrózy alebo postablačnej jazvy myokardu. Môže to významne pomôcť pacientom trpiacich fibrózou myokardu pre určenie regiónu fibrózy a pre pooperačnú validáciu zákroku po rádiofrekvenčnej katétrovej ablácii. V tejto práci predstavím algoritmus pre úspešné rozpoznanie fibrózy na súbore dát pacientov s fibrózou myokardu nasmímaných vo Fakultnej nemocnici u sv. Anny.
|
|
|
Rozpoznání textu s využitím neuronových sítí
Peřinová, Barbora ; Hesko, Branislav (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá rozpoznáváním textu v obraze. V první části práce jsou popsány základní typy úloh rozpoznání textu a rozdělení algoritmu na jednotlivé fáze. Pro každou fázi jsou v následující části popsány nejpoužívanější metody. V rámci fáze rozpoznávání znaků je vysvětlena problematika umělých neuronových sítí a jejich využití v této fázi, konkrétně vícevrstvého perceptronu a konvolučních neuronových sítí. Druhá část se zabývá definicí požadavků na konkrétní aplikaci využitelnou jako zpětná vazba pro robotický systém. Je představena implementace algoritmu v .NET využívající konvoluční neuronové sítě a knihovnu CNTK pro hluboké učení. V neposlední řadě jsou diskutovány výsledky testování jednotlivých fází navrženého řešení a porovnány s volně dostupnou technikou Tesseract.
|
|
|
Implementace přenosového protokolu pro přenos dat mobilní cirkulační jednotky pro převoz plic
Trávníčková, Hana ; Mézl, Martin (oponent) ; Sekora, Jiří (vedoucí práce)
Cílem této práce je implementace přenosového protokolu pro přenos dat mobilní cirkulační jednotky pro převoz plic. Své primární uplatnění najde tento protokol při přenosu dat v rámci projektu AlveoPic. Úvodní část práce se zabývá popisem anatomie a fyziologie dýchací soustavy člověka. Dále seznamuje čtenáře s modulem mechanického plicního simulátoru a modulem pro transport plic. V práci jsou popsány možnosti standardů pro přenos medicínských dat a pozornost je věnována zejména standardu ISO/IEEE 11073. Navazující část práce řeší realizaci simulátoru modulu pro transport plic a design aplikace pro zobrazování sledovaných parametrů. Závěrečná část práce je věnována rozboru testovacích případů pro ověření správné funkčnosti aplikace a použitého protokolu.
|
|
|
Laboratorní úlohy pro výuku ultrazvukových zobrazovacích systémů
Jordánek, Tomáš ; Králík, Martin (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá ultrazvukovými zobrazovacími systémy. Nejdříve je popsáno ultrazvukové vlnění a fyzikální zákony, které s vlněním souvisí. Poté je zde velká kapitola, která se zabývá klinickým využitím. Jsou zde rozebrány jednotlivé módy zobrazení a používané sondy. Zmínka je zde i o dopplerovských systémech. Dále je zde uvedeno hodnocení ultrazvukového obrazu. V praktické části se zabývám hodnocením přístroje GE Vingmed Ultrasound System Five REM pomocí fantomu. Z této části vznikla jedna laboratorní úloha na seznámení práce s ultrazvukem. V druhém semestru jsem se věnoval ultrazvukovému přístroji od 3B Scientific. Pro tento přistroj bylo navrženo několik laboratorních úloh, které byly zároveň odzkoušeny v praxi. Dále byla sestavena jednoduchá konstrukce pro snímání scény v B-módu. Nakonec byl vytvořen vlastní fantom.
|
host ::
RSS.