Original title:
Molekulárně-genetická analýza starokladrubských koní
Authors:
Velebová, Adéla Document type: Master’s theses
Year:
2014
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Diplomová práce se zabývá hodnocením genetické variability a diverzity u plemene starokladrubský kůň. Cílem je zhodnotit variabilitu a diverzitu uvnitř plemene a také mezi otcovskými liniemi a uvnitř těchto linií. Literární přehled obsahuje podrobné informace o plemeni starokladrubský kůň a historii jeho chovu, včetně regeneračního procesu. V další části jsou popsány základní ukazatele genetické variability. Genetická variabilita a diverzita byla hodnocena pomocí 17 mikrosatelitních markerů, následná statistická analýza byla provedena programy GENEPOP verze 4.2 a ARLEQUIN verze 3.5. Byly spočítány frekvence alel a genotypů, počet alel na lokus a populace byla podrobena testu Hardy -- Weinbergovy rovnováhy. Dále byl spočítán polymorfní informační obsah, pozorovaná i očekávaná heterozygotnost a fixační koeficienty. Výsledky poukazují na překvapivě vysoký stupeň genetické variability u starokladrubských koní, zvýšené patrně v důsledku introdukce jiných plemen v období regeneračního procesu.The genetic variability and diversity of the Old Kladruber horse breed is evaluated in this master thesis. The aim is to evaluate the variability and diversity in the breed, between the sire lines and inside these lines. The detailed information about the Old Kladruber horse breed is presented in the literary overview with the breed history including the regeneration process. Basic indexes of the genetic variability are presented in the next part. 17 microsatellite markers were used to evaluate the genetic variability and diversity with further statistical analyses performed in GENEPOP 4.2 and ARLEQUIN 3.5 programs. The allele and genotype frequencies were calculated together with the number of alleles per loci and Hardy -- Weinberg equilibrium was tested for the population. Polymorphic information content, observed and expected heterozygosity and fixation coefficients were calculated. The results show surprisingly high degree of genetic variability in the Old Kladruber horse, increased probably due to introduction of other breeds during the regeneration process.
Keywords:
genetická diverzita; genetická variabilita; mikrosatelit; starokladrubský kůň