|
|
Multiparametric segmentation of MR images
Chovanec, Ján ; Šmirg, Ondřej (oponent) ; Dvořák, Pavel (vedoucí práce)
The aim of the thesis was familiarity of segmentation methods for automatic segmentation of MR images, using multiparametrical display. The theoretical part focuses on the description of methods of segmentation techniques. In the practical part are implemented K-means and level-set method. The methods are tested on the images of the brain obtained by different sequences (T1, T1c, T2, FLAIR). Segmentation methods are implemented in the program MATLAB. Implemented segmentation accuracy is demonstrated on data which there are reports reference results. Evaluation methods is performed using different classifiers decision. The K-means method is tested different metrics and different combinations of the input image. Finally, both methods are compared with one another and visually evaluated against the reference image.
|
|
|
Metody akvizice pro DCE-MRI
Kudlička, Petr ; Kratochvíla, Jiří (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
V této diplomové práci popisuji základy měření magnetickou resonancí. Zamě-řuji se především na metody DCE-MRI s T1 váhováním o¬brazu. Zmiňuji základní kon-trastní látky užívané v MRI zobrazování. Popisuji vybrané pulsní sekvence, se kterými dále pracuji v praktické části - experimentální měření koncentrace kontrastní látky ve vzorku. Sestavil jsem akviziční protokoly pro experiment. Praktické měření se bude provádět na 1,5 T silném magnetu na pracovišti Masarykova onkologického ústavu v Brně. Dále jsem rozšířil stávající software o funkce pro zpracování IR TurboFLASH dat a perfusní analýzu časových sekvencí a její vyhodnocení. V závěru provádím disku-si zpracovaných naměřených dat.
|
|
|
Škálování arteriální vstupní funkce v DCE-MRI
Holeček, Tomáš ; Kolář, Radim (oponent) ; Kratochvíla, Jiří (vedoucí práce)
Perfusní zobrazování pomocí magnetické rezonance je moderní diagnostická metoda využívaná hlavně v onkologii. Při této metodě je pacientovi podávána kontrastní látka a poté je průběžně sledován průběh její koncentrace v postižené oblasti v čase. Velice důležité při perfusní analýze je správné stanovení arteriální vstupní funkce (AIF). V poslední době je snaha tuto funkci modelovat pomocí multikanálové slepé dekonvoluce, nicméně z její podstaty pramení nutnost takto odhadnutou AIF škálovat, aby perfusní parametry odpovídaly skutečnosti z hlediska kvantitativního hodnocení. Tato diplomová práce se zaměřuje na popis metod škálování AIF a jejich vliv na úspěšnost odhadu perfusních parametrů v různých tkáních v závislosti na použitém modelu AIF.
|
|
|
Segmentace ledvin z renální perfúzní MR sekvence obrazů
Jína, Miroslav ; Walek, Petr (oponent) ; Malínský, Miloš (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá problematikou segmentace ledvin v perfúzních MR obrazech. Segmentace ledvin se provádí různými metodami. Jedná se o regionově založené metody, deformovatelné modely, metody založené na modelech, hranově založené metody a další. Dosud není znám univerzální algoritmus, který by se dal použít pro segmentaci ledvin různých pacientů. Navrženou metodou této diplomové práce je aktivní kontura Snake, která je vytvořena v programovacím prostředí MatLab. Výsledné kontury jsou kvantitativně a vizuálně porovnány s manuální segmentací.
|
|
|
Měření difúzních koeficientů technikami magnetické resonance
Král, Jakub ; Gescheidtová, Eva (oponent) ; Bartušek, Karel (vedoucí práce)
Bakalářská práce se věnuje zobrazovacím technikám založeným na principu nukleární magnetické rezonance. Tyto techniky patří mezi jedny z nejmodernějších metod studia fyzikálních, chemických a biologických vlastností látek. Úvod práce je zaměřen především na fyzikální princip. V práci se dále pozornost věnuje metodě PFG-SE ale i modernějším multiintervalovým NMR metodám, které odstraní systematické chyby určení difúzních konstant heterogenních materiálů. Část práce je také věnována výpočtům b-faktoru pro různé druhy pulzních sekvencí. Závěr je věnován zpracování dat v programu Matlab a Marevisi. Vybraná metoda z teoretické části práce je pak použita ke změření a zpracování difúzí tkáňových kultur.
|
|
|
Akvizice a předzpracování MRI obrazových sekvencí pro klinické perfusní zobrazování
Krchňavý, Jan ; Bartoš, Michal (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Tato diplomová práce popisuje teorii pro statické a dynamické magneto-rezonanční zobrazování s použitím kontrastní látky ovlivňující relaxační dobu T1. Jsou popsány dostupné akviziční metody v určeném nemocničním zařízení Masarykova onkologického ústavu v Brně. Jsou vybrány vhodné sekvence pro následné experimentální měření. Jsou popsány použití fantomy. Definován je akviziční protokol pro měření a navrhnut je způsob hodnocení naměřených dat. Pomocí odhadu relaxační doby T1, citlivosti a poměru signálu k šumu je vybrána nejvhodnější sekvence a metoda pro dynamické měření. Je provedena perfusní analýza a zjištěny perfusní parametry dynamického měření. Práce byla podpořena Evropským fondem pro regionální rozvoj a státním rozpočtem České republiky (OP VaVpI - RECAMO, CZ.1.05/2.1.00/03.0101)
|
|
|
Specifika vyšetření pomocí CT a MR u dětí
NOSKOVÁ, Kateřina
Bakalářská práce se zabývá specifiky vyšetření pomocí CT a MR u dětí. Radiologické zobrazovací metody CT a MR mají nezastupitelnou roli pro přesnou diagnostiku nejrůznějších druhů onemocnění a jsou nedílnou součástí moderní pediatrické radiologie. Důležitá je nejenom kvalitní přístrojová technika a specifické postupy, ale i profesionální přístup zdravotnického personálu, který výkon provádí. Zejména u dětí může být bezproblémový průběh vyšetření velmi náročný. Jedním z nejdůležitějších aspektů je minimalizace radiační zátěže pro tělo malého pacienta. Proto je nutné indikace k vyšetření vždy důsledně zvažovat. Cílem práce je poskytnutí základních informací o metodách CT a MR se zaměřením na dětské pacienty a popsání průběhu zmíněných vyšetření u dětí. Dalším cílem je analyzovat specifika jednotlivých vyšetření. Tyto vyšetření jsou velmi náročné jak pro děti samotné a jejich rodiče, tak pro personál. Ten by měl vystupovat profesionálně, jelikož práce s dítětem vyžaduje obrovskou dávku trpělivosti a porozumění. Nezanedbatelnou věcí je i schopnost umět co nejjednodušeji a nejefektivněji vysvětlit rodiči a dítěti, jak bude vyšetření probíhat. Vyšetření musí být provedeno co nejrychleji a vybraná vyšetřovací metoda musí přinést dostatečně kvalitní výsledek. Během vyšetření je nutný úplný klid na lůžku. U malých pacientů toto bývá častým problémem. S dětmi je často velmi špatná, někdy i žádná spolupráce. Nesmíme opomenout ani funkční rozdíly těla dítěte tzn. zrychlený dech, nebo neschopnost dítěte zadržet dech na delší dobu. V mnohých případech je ale nutné aplikovat látky sloužící ke zklidnění pacienta. K celkové anestezii přistupujeme vždy u dětí mladších 5 let, nebo u klaustrofobických pacientů. Pokud dojde k podání uklidňujících látek, anestezie či kontrastních látek, je vždy nutné aby si rodič nebo zákonný zástupce důkladně přečetl a podepsal informovaný souhlas. Teoretická část je rozdělena do několika kapitol. V jednotlivých kapitolách jsou jednotlivé zobrazovací metody popsány a jsou uvedeny jejich výhody a nevýhody. Dále jsou uvedeny kontrastní látky, jejich rozdělení a možné nežádoucí účinky. Není opomenuta ani kapitola o dětské anesteziologii, která při vyšetřeních hraje nezanedbatelnou roli např. u dětí mladších 5 let, klaustrofobických pacientů či velmi neklidných dětí. Cílem praktické části práce bylo zhodnocení informovanosti rodičů o vyšetření, které bylo jejich dítěti indikováno (CT/MR). Za tímto účelem byl vytvořen dotazník, který byl k dispozici na oddělení dětské kliniky Fakultní nemocnice v Motole (Klinika zobrazovacích metod) a Fakultní nemocnice Brno (Klinika dětské radiologie) a obsahoval celkem 25 otázek. Odpovědi na otázky bylo možno zaškrtnout křížkem, jiné obsahovaly možnost odpovědi volné. Dále byla analyzována data o počtu vyšetřených dětí pomocí CT a MR na dětských klinikách v rámci nemocnic, která disponují speciálními dětskými radiodiagnostickými odděleními (FN v Motole - KZM a FN Brno - KDR) v rozmezí let 2010 - 6/2015. Analyzovaná data byla rozdělena do několika věkových kategorií, dle specifických potřeb dítěte. Při analyzování dat měly být zodpovězeny výzkumné otázky, jak dostatečně jsou rodiče informováni o průběhu vyšetření dítěte a jestli stoupá počet vyšetření dětí pomocí CT a MR. K zodpovězení výzkumných otázek byla využita data z dětských klinik, která disponují speciálními dětskými radiologickými odděleními (FN v Motole - KZM a FN Brno - KDR) a dále vyplněné dotazníky. Kapitola "Výsledky" ukazuje s pomocí grafů odpovědi na otázky z dotazníkového šetření a dále data získaná z FN v Motole (KZM) a FN Brno (KDR). V kapitole "Diskuze" jsou výsledky dotazníků a získaných dat vyhodnoceny. Práce a její výsledky mohou být využity jinými radiodiagnostickými odděleními, nebo sloužit jako informativní či doplňující materiál pro rodiče a studenty.
|
|
|
Významné kroky v MRI
Bartušek, Karel
MRI je jednou z předních lékařských diagnostických technik. Přednáška prezentuje základní důležité kroky ve vývoji MRI a jejich možné aplikace. Výzkum a vývoj pole MR v ISI Brno začal v roce 1960. Původně byly vyvinuty přístroje s vysokým rozlišením spektroskopie. V současné době se NMR skupina zaměřuje na vývoj metod a technologií měření pro biomedicínské i technické aplikace nukleární magnetické rezonance a uplatňování MR technik v preklinice, zejména translační výzkum využívající myši a krysy jako zvířecí modely pro neurologická, psychiatrická a onkologická onemocnění. MRI je jedním z předních lékařských diagnostických technik.Přednáška prezentuje základní důležité kroky ve vývoji MRI a jeho aplikace possibilities.Development pole MR v ISI Brno začal v roce 1960. Původně byly vyvinuty instrumentaci s vysokým rozlišením spektroskopie. V současné době NMR skupina se zaměřuje na vývoj metod a technologií měření pro biomedicínské i technické aplikace nukleární magnetické rezonance a uplatňování MR technik v preklinického, zejména translační výzkum využívající myši a krysy zvířecích modelech neurologické, psychiatrické a onkologických onemocnění.
|
|
|
SMV-2014-22: Vývoj metodologie pro výzkum Parkinsonovy choroby v animálním modelu pomocí magnetické rezonance
Starčuk jr., Zenon
Spolupráce na přípravě animálního modelu Parkinsonovy choroby, návrh a optimalizace vhodné sady MR měření, provedení měření dodaného vzorku (40 myší, anatomie+difúze), úprava dat pro předání. Práce byla soustředěna na ověření myšího transgenního modelu Parkinsonovy choroby a na vývoj optimálního protokolu pro anatomické MR zobrazení myšího mozku s důrazem na oblasti substantia nigra, hippocampus, striatum a na srovnání diagnostické hodnoty měření DTI a DKI v těchto oblastech. Experimentální data byla u jednotlivých myší individuálně analyzována a souhrnně statisticky vyhodnocena ve skupinách testovaných a kontrolních zvířat. Na základě zhodnocení patofyziologie byly navrženy další MR postupy pro výzkum patofyziologie a vývoj časné diagnostiky a monitorování terapie.
|
|
|
Vyšetřování uropoetického systému dospělých a malých pacientů z pohledu radiologického asistenta
TRAPLOVÁ, Lenka
V této práci se věnuji problematice vyšetřování uropoetického systému. Nejprve stručně popisuji anatomii a fyziologii vylučovacího systému, dále charakterizuji jednotlivé zobrazovací metody. Pacienti se stejnými diagnózami by měli podstoupit stejná vyšetření ve stejném, pokud možno optimálním, sledu. Rozhodla jsem se porovnat dostupná národní a mezinárodní doporučení s používanými algoritmy vyšetření v České republice. Pro tyto účely jsem shromáždila data 115 radiologicky vyšetřených pacientů v nemocnici České Budějovice a.s. Abstrahovala jsem použitý algoritmus indikovaných vyšetření pro diagnózy zastoupené ve zkoumaném vzorku pacientů a po porovnání určila odchýlení se od doporučených postupů. Navrhla jsem postupy, které se při porovnání českých a mezinárodních doporučení a dostupných studií zdály nejvhodnější. Zjistila jsem, že nemocnice České Budějovice se pečlivě drží norem stanovených odbornými společnostmi, a tudíž nahradit vyšetření využívající ionizující záření vyšetřeními bez jeho použití lze po zhodnocení všech hledisek pouze ve velmi malém procentu případů.
|
host ::
RSS.