|
Design, synthesis and evaluation of heterocyclic compounds with potential antimicrobial activity III
Rahi, Fahim - Joe ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Kučerová, Marta (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát: Fahim Joe Rahi Vedoucí: doc. PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Název diplomové práce: Návrh, syntéza a hodnocení heterocyklických sloučenin s potenciální antimikrobní aktivitou III Nadužívání antibiotik vedlo k alarmujícímu nárůstu rezistence. Akutní potřeba antibiotik s novým mechanismem účinku vedla náš výzkum k nalezení slibných nových sloučenin prostřednictvím studie HIT-SAR. Cílená struktura byla inspirována nedávnou publikací. Naše sloučeniny mají navíc methylenový můstek mezi heterocyklem a benzenovým kruhem. Tento methylenový můstek zvyšuje flexibilitu struktury, což může zlepšit interakční potenciál sloučenin. Obecně lze říci, že methylenový můstek nezlepšil antimikrobiální vlastnosti zamýšlených sloučenin. V některých případech byla antimikrobiální aktivita významně snížena ve srovnání s publikovanými sloučeninami. MIC nebyla dostatečná k provedení dalšího mikrobiologického testování.
|
|
Návrh, syntéza a hodnocení heterocyklických sloučenin s potenciální antimikrobní aktivitou I
Brányik, Michal ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Demuth, Jiří (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Název diplomové práce: Návrh, syntéza a hodnocení heterocyklických látek s potenciální antimikrobní aktivitou I Řešitel: Michal Brányik Vedoucí diplomové práce: doc. PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Konzultant: PharmDr. Martin Juhás, Ph.D. Antimikrobiální rezistence je stále rostoucím celosvětovým problémem. Mnoho bakteriálních kmenů vykazuje rezistenci vůči doposud účinným sloučeninám a právě proto je stěžejní pokračovat v hledání nových účinných látek. Tento problém se nevyhýbá ani původci tuberkulózy, Mycobacterium tuberculosis. Právě toto onemocnění je dle statistik WHO nejčastější příčinou úmrtí, jenž je způsobeno jedním patogenem, a proto je věnováno velké úsilí vývoji nových léčiv. Látky navržené a připravené jako součást této diplomové práce strukturně vycházejí ze sloučenin obsahujících fragment 2-aminooxazolu (2-aminothiazolu) a substituovaných pyridinkarboxamidů a pyrazinkarboxamidů. Struktura sloučenin byla charakterizována 1 H a 13 C NMR spektry, IR spektry a hmotnostní spektrometrií. Takto bylo připraveno a popsáno 13 nových látek. U všech těchto látek byla testována jejich antimikrobiální aktivita na čtyřech grampozitivních a čtyřech gramnegativních kmenech bakterií, následně také...
|
|
Xanthone-boronic acids: An insight into the synthesis of borylated xanthone derivates
Houngbedji, Priam-Amedeo ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Zitko, Jan (oponent)
CHARLES UNIVERSITY FACULTY OF PHARMACY IN HRADEC KRÁLOVÉ DEPARTMENT OF PHARMACEUTICAL CHEMISTRY AND PHARMACEUTICAL ANALYSIS DIPLOMA THESIS XANTHONE-BORONIC ACIDS: AN INSIGHT INTO THE SYNTHESIS OF BORYLATED XANTHONE DERIVATIVES Supervisor: prof. PharmDr. Martin Doležal, Ph.D. HRADEC KRÁLOVÉ 2021 PRIAM-AMEDEO HOUNGBEDJI Abstract - Czech Vývoj léčiva bortezomibu 5 a jeho zásadní význam pro léčbu mnohočetného myelomu odstartoval zvýšený zájem o syntézu a biologické hodnocení derivátů boronových kyselin, především k jejich protirakovinným, protimikrobiálním, popř. dalším aktivitám. Zároveň jsou xanthony a jejich deriváty důkladně studovány pro potenciál v protirakovinné terapii, a pro jejich antimikrobiální, protizanětlivé, protivirové a antikonvulzivní účinky. Logickým spojením těchto dvou skutečností je orientace na syntézu boronových derivátů xanthonů. 3,6-Dihydroxyxanthon 10 byl zvolen jako prekurzor pro vývoj borylační procedury xanthonů, zejména pro svou snadnou syntézu a dostupnost. Z 10 byl snadno připraven 3,6- ditrifylxanthon 11. Syntézy 3,6-bis(pinakolatoboron)xanthonu 8 z 11 bylo dosáhnuto použitím bis(pinakolatodiboronu) B2pin2 jako borylačního činidla, za katalýzy Pd(dppf)Cl2 komplexem s přísadou dppf ligandu a v přítomnosti KOAc zásady. Alternativní cesta byla realizována záměnou B2pin2 za...
|
|
Design, synthesis and evaluation of heterocyclic compounds with potential antimicrobial activity VI
Abdalrahman, Nechirwan Taimur ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Nováková, Veronika (oponent)
(In Czech) Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Autor: Nechirwan Abdalrahman Školitel: doc. PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Název: Návrh, syntéza a hodnocení heterocyklických sloučenin s potenciální antimikrobní aktivitou VI Navzdory existenci dobře zavedených léčebných režimů je tuberkulóza (TBC) nadále hlavní příčinou úmrtí jediného mikroorganismu, jak uvádí WHO. Jedním z důvodů selhání léčby při úplné eradikaci této infekce je léková rezistence. Nové 3-(fenylureido)pyrazin-2-karboxamidové deriváty, viz obrázek níže, byly syntetizovány reakcí 3-chlorpyrazin-2-karboxamidu s amoniakem za vzniku 3-aminopyrazin-2-karboxamidu jako meziproduktového stavebního bloku, následovanou reakcí s různé substituované fenylisokyanáty za použití mikrovlnného reaktoru. U syntetizovaných sloučenin byla hodnocena in vitro aktivita proti různým mykobakteriálním kmenům, přičemž nejaktivnější z nich vykazovaly střední až nízké aktivity; 4-terciární butyl (MIC 62,5 µg/ml), 4-NO2 (MIC 62,5 µg/ml), 4-brom (MIC 250 µg/ml), 4-Cl (MIC 250 µg/ml), 2-F (MIC 250 ug/ml) a nesubstituované (MIC 500 ug/ml). Jako doplňková studie in silico byly syntetizované sloučeniny a některé další virtuálně syntetizované sloučeniny studovány na mykobakteriální inhibici ProRS jako...
|
|
Design, synthesis and evaluation of heterocyclic compounds with potential antimicrobial activity IV
Fekri, Amir Hossein ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Miletín, Miroslav (oponent)
(Czech) Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Název: Návrh, syntéza a hodnocení heterocyklických sloučenin s potenciální antimikrobní aktivitou IV Kandidát: Amirhossein Fekri Školitel: doc. PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Konzultant: Mgr. Vinod S. K. Pallabothula Tuberkulóza zůstává celosvětově jednou z nejsmrtelnějších infekčních nemocí způsobených jediným infekčním agens, rychlý růst rezistence na antituberkulotika brání úspěšné kontrole a léčbě TBC po celém světě, což je výzvou pro vědeckou komunitu, aby vyvinula nová léčiva ke zlepšení v současnosti dostupné léčby. Tato diplomová práce představuje návrh, syntézu a biologické hodnocení dvou sérií sloučenin včetně cyklizovaných (pyrazin-oxazinon) a karboxamidových derivátů jako potenciálně aktivních antimykobakteriálních látek sdílejících společný strukturní fragment pyrazinového jádra, které by mohly potenciálně cílit na mykobakteriální aspartát dekarboxylázu (PanD) a prolyl-tRNA syntetázu (mtProRS). Syntézy finálních sloučenin bylo dosaženo prostřednictvím jednotlivých reakčních kroků zahrnujících acylaci methyl-3-aminopyrazin-2-karboxylátu pro přípravu běžného meziproduktu, který byl následně použit pro syntézu finálních sloučenin. Všechny konečné sloučeniny byly analyzovány...
|
|
Návrh, syntéza a hodnocení heterocyklických sloučenin s potenciální antimikrobní aktivitou I
Brányik, Michal ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Demuth, Jiří (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Název diplomové práce: Návrh, syntéza a hodnocení heterocyklických látek s potenciální antimikrobní aktivitou I Řešitel: Michal Brányik Vedoucí diplomové práce: doc. PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Konzultant: PharmDr. Martin Juhás, Ph.D. Antimikrobiální rezistence je stále rostoucím celosvětovým problémem. Mnoho bakteriálních kmenů vykazuje rezistenci vůči doposud účinným sloučeninám a právě proto je stěžejní pokračovat v hledání nových účinných látek. Tento problém se nevyhýbá ani původci tuberkulózy, Mycobacterium tuberculosis. Právě toto onemocnění je dle statistik WHO nejčastější příčinou úmrtí, jenž je způsobeno jedním patogenem, a proto je věnováno velké úsilí vývoji nových léčiv. Látky navržené a připravené jako součást této diplomové práce strukturně vycházejí ze sloučenin obsahujících fragment 2-aminooxazolu (2-aminothiazolu) a substituovaných pyridinkarboxamidů a pyrazinkarboxamidů. Struktura sloučenin byla charakterizována 1 H a 13 C NMR spektry, IR spektry a hmotnostní spektrometrií. Takto bylo připraveno a popsáno 13 nových látek. U všech těchto látek byla testována jejich antimikrobiální aktivita na čtyřech grampozitivních a čtyřech gramnegativních kmenech bakterií, následně také...
|
|
Amaryllidaceae alkaloids of montanine type and their derivatives as potential drugs.
Maafi, Negar ; Cahlíková, Lucie (vedoucí práce) ; Šmejkal, Karel (oponent) ; Havlík, Jaroslav (oponent)
Karlova Univerzita v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakognózie a farmaceutické botaniky Kandidát: Negar Maafi Školitel: Prof. Ing. Lucie Cahlíková, PhD. Název disertační práce: Amaryllidaceae alkaloidy montaninového typu a jejich deriváty jako potenciální léčiva. Na základě znalostí o biologické aktivitě alkaloidů montaninového typu Amaryllidaceae byly tyto alkaloidy vybrány pro přípravu jejich polosyntetických derivátů za účelem studia vztahu struktura vs. aktivita. Deriváty alkaloidů montaninového typu byly připraveny za využití haemanthaminu a montaninu jako výchozích látek. Montaninový alkaloid 3-O-methylpankracin byl připraven za využití intramolekulárního přesmyku z haemanthaminu. Montanin byl pro přípravu polosyntetických derivátů izolován z cibulí Hippeastrum x hybridum cv. Ferrari. Celkem bylo připraveno více než 80 alifatických a aromatických derivátů montaninu a 3-O-methylpankracinu. Všechny sloučeniny byly identifikovány za využití 1D- a 2D-NMR, MS, HRMS apod. Připravené deriváty byly screeningově testovány na celou řadu biologických aktivit (např. inhibiční potenciál vůči hAChE/hBuChE, antimykobakteriální, antibakteriální a antifugální aktivita, cytotoxicita a další). V rámci hAChE/hBuChE studie zajímavou selektivní hAChE inhibiční aktivitou disponoval derivát...
|
|
Xanthone-boronic acids: An insight into the synthesis of borylated xanthone derivates
Houngbedji, Priam-Amedeo ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Zitko, Jan (oponent)
CHARLES UNIVERSITY FACULTY OF PHARMACY IN HRADEC KRÁLOVÉ DEPARTMENT OF PHARMACEUTICAL CHEMISTRY AND PHARMACEUTICAL ANALYSIS DIPLOMA THESIS XANTHONE-BORONIC ACIDS: AN INSIGHT INTO THE SYNTHESIS OF BORYLATED XANTHONE DERIVATIVES Supervisor: prof. PharmDr. Martin Doležal, Ph.D. HRADEC KRÁLOVÉ 2021 PRIAM-AMEDEO HOUNGBEDJI Abstract - Czech Vývoj léčiva bortezomibu 5 a jeho zásadní význam pro léčbu mnohočetného myelomu odstartoval zvýšený zájem o syntézu a biologické hodnocení derivátů boronových kyselin, především k jejich protirakovinným, protimikrobiálním, popř. dalším aktivitám. Zároveň jsou xanthony a jejich deriváty důkladně studovány pro potenciál v protirakovinné terapii, a pro jejich antimikrobiální, protizanětlivé, protivirové a antikonvulzivní účinky. Logickým spojením těchto dvou skutečností je orientace na syntézu boronových derivátů xanthonů. 3,6-Dihydroxyxanthon 10 byl zvolen jako prekurzor pro vývoj borylační procedury xanthonů, zejména pro svou snadnou syntézu a dostupnost. Z 10 byl snadno připraven 3,6- ditrifylxanthon 11. Syntézy 3,6-bis(pinakolatoboron)xanthonu 8 z 11 bylo dosáhnuto použitím bis(pinakolatodiboronu) B2pin2 jako borylačního činidla, za katalýzy Pd(dppf)Cl2 komplexem s přísadou dppf ligandu a v přítomnosti KOAc zásady. Alternativní cesta byla realizována záměnou B2pin2 za...
|
|
Návrh, syntéza a hodnocení derivátů pyridinu jako potenciálních antimikrobních sloučenin
Bachtíková, Andrea ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Demuth, Jiří (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Název diplomové práce: Návrh, syntéza a hodnocení derivátů pyridinu jako potenciálních antimikrobních sloučenin Řešitel: Andrea Bachtíková Vedoucí diplomové práce: doc. PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Konzultant: PharmDr. Martin Juhás I v dnešní době je tuberkulóza celosvětovým problémem. Dle WHO se jedná o 2. nejčastější příčinu úmrtí na infekční onemocnění, přičemž u klasických antituberkulotik, která jsou v terapii využívána už desítky let, je čím dál častěji zaznamenáván výskyt rezistence. Tyto skutečnosti jsou hlavními důvody, proč je potřeba věnovat se výzkumu nových potenciálních léčiv. V této diplomové práci je prezentován design, syntéza a hodnocení antimikrobních vlastností série substituovaných N-oxazolyl a N-thiazolylkarboxamidů různých pyridinkarboxylových kyselin. Finální sloučeniny byly charakterizovány 1 H a 13 C-NMR spektroskopií, IČ spektry, teplotou tání a HRMS (hmotnostní spektrometrie s vysokým rozlišením). U získaných sloučenin byla testována aktivita in vitro proti M. tuberculosis H37Rv, M. tuberculosis H37Ra a čtyřem dalším, klinické méně významným mykobakteriálním kmenům. Dále byla u sloučenin testována antibakteriální aktivita na čtyřech kmenech G+ a čtyřech kmenech G-...
|
|
Synthesis of aerothionin analogs as potential antimycobacterial agents
Šimovičová, Martina ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Zimčík, Petr (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutickej chémie a farmeceutickej analýzy Riešiteľ: Martina Šimovičová Vedúci diplomovej práce: doc. PharmDr. Jan Zitko, PhD.; Adjunct Prof. Paula Kiuru, Ph.D Názov diplomovej práce: Syntéza analógov aerothionínu ako potenciálnych antimykobakteriálnych zlúčenín Kľúčové slová: antimykobakteriálny, tuberkulóza, syntéza, aerothionín, bromotyrozíny Liečivá súčasne používané na liečbu tuberkulózy sú výsledkom štúdií uskutočnených pred 50 alebo 60 rokmi. So stále narastajúcim problémom rezistencie baktérií na súčasne používané liečivá rastie i význam výskumu zaoberajúceho sa hľadaním nových antimykobakteriálne účinných látok. Morské prostredie má nepochybne obrovský potenciál pre objav nových vedúcich štruktúr pre vývoj antituberkulotických zlúčenín. Jednou z týchto vedúcich štruktúr je spirocyklická zlúčenina aerothionín (1), u ktorej bola zistená aktivita proti multirezistentným kmeňom Mycobacterium tuberculosis, spolu s troma netuberkulotickými mykobaktériami (Obrázok 1). Navyše, v posledných rokoch sa u viacerých spirocyklických zlúčenín zistilo, že pôsobia na M. tuberculosis, čo robí tento štruktúrny segment atraktívny pre antituberkulotický výskum. Obrázok 1: Aerothionín (1) a všeobecná štruktúra produktov. Nadväzujúc na tieto...
|