|
|
Vyhodnocování nádorů pomocí analýz DCE-MRI snímků
Šilhán, Jiří ; Zitová, Barbara (vedoucí práce) ; Jiřík, Radovan (oponent)
Práce se věnuje zpracování dat DCE-MRI, z vyšetření, které pomocí magnetické rezonance zkoumá šíření kontrastní látky krevním řečištěm. Pacien- tovi je podána kontrastní látka a následně je sejmuta série snímků stejné oblasti. Výstupem vyšetření je soubor obrazových dat a perfuzních map. Práce za použití segmentace pomocí grafových řezů interaktivně hledá nádor, pro jeho hodnocení zjišťuje tvarové příznaky a za pomoci fůzí obrazu zjednodušuje studium celého balíku dat vyšetření.
|
|
| |
|
|
Srovnání preklinických DCE-MRI perfusních technik
Minsterová, Alžběta ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Macíček, Ondřej (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá metodou DCE-MRI (Dynamic Contrast-Enhanced Magnetic Resonance Imaging), tedy jednou z metod kontrastního zobrazování pomocí magnetické resonance. Je popsán princip konvenční kontinuální metody DCE-MRI, která využívá jednoho bolu kontrastní látky a následně se práce věnuje metodám využívajícím dva boly kontrastní látky se zaměřením na metodu prokládané akvizice. Bylo vytvořeno grafické prostředí pro zpracování dat z přístrojů Bruker. Na syntetických datech je zkoumán vliv vlastností této metody na kvalitu odhadu perfusních parametrů. Simulacemi bylo prokázáno, že ideálně by druhý bolus měl být co nejvzdálenější od prvního. Simulace přerušení akvizice nevedly k jednoznačnému závěru, ale byly formulovány dva body, jejichž splnění by mělo vést k co nejlepšímu odhadu perfusních parametrů.
|
|
|
Advanced signal processing methods in dynamic contrast enhanced magnetic resonance imaging
Bartoš, Michal ; Flusser,, Jan (oponent) ; Mlynárik,, Vladimír (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
This dissertation describes quantitative dynamic contrast enhanced magnetic resonance imaging (DCE-MRI), which is a powerful tool in diagnostics, mainly in oncology. After a time series of T1-weighted images recording contrast-agent distribution in the body has been acquired, data processing phase follows. It is presented step by step in this dissertation. The theoretical background in physiological and MRI-acquisition modeling is described together with the estimation process leading to parametric maps describing perfusion and microcirculation properties of the investigated tissue on a voxel-by-voxel basis. The dissertation is divided into this theoretical analysis and a set of publications representing particular contributions of the author to DCE-MRI.
|
|
|
Škálování arteriální vstupní funkce v DCE-MRI
Holeček, Tomáš ; Kolář, Radim (oponent) ; Kratochvíla, Jiří (vedoucí práce)
Perfusní zobrazování pomocí magnetické rezonance je moderní diagnostická metoda využívaná hlavně v onkologii. Při této metodě je pacientovi podávána kontrastní látka a poté je průběžně sledován průběh její koncentrace v postižené oblasti v čase. Velice důležité při perfusní analýze je správné stanovení arteriální vstupní funkce (AIF). V poslední době je snaha tuto funkci modelovat pomocí multikanálové slepé dekonvoluce, nicméně z její podstaty pramení nutnost takto odhadnutou AIF škálovat, aby perfusní parametry odpovídaly skutečnosti z hlediska kvantitativního hodnocení. Tato diplomová práce se zaměřuje na popis metod škálování AIF a jejich vliv na úspěšnost odhadu perfusních parametrů v různých tkáních v závislosti na použitém modelu AIF.
|
|
|
Modelování v perfusním MR zobrazování
Válková, Hana ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Kratochvíla, Jiří (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá perfuzní analýzou pomocí magnetické rezonance DCE-MRI. Práce v úvodu popisuje problematiku akvizice dat pro DCE-MRI, nutnost použití kontrastních látek a přibližuje základní principy perfuzní analýzy. Dynamické chování kontrastní látky během distribuce v cévním řečišti lze popsat arteriální vstupní funkcí (AIF). Podoba křivek co nejblíže oblasti zájmu je ovlivněna tzv. disperzními jevy (VTF) vlivem distribuce kontrastní látky k oblasti zájmu. V konečném důsledku je systémové chování tkáně popsáno reziduální funkcí tkáně (TRF). V praktické části diplomové práce byly realizovány modely křivek AIF, VTF a TRF. Dále byl vytvořen simulační program pro snadnou práci s modely, jenž umožňuje provádět odhady perfuzních parametrů na základě neslepé dekonvoluce. Metoda byla ověřena na syntetických datech a ilustrována na klinických datech pacienta s karcinomem ledvin.
|
|
|
Metody akvizice pro DCE-MRI
Kudlička, Petr ; Kratochvíla, Jiří (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
V této diplomové práci popisuji základy měření magnetickou resonancí. Zamě-řuji se především na metody DCE-MRI s T1 váhováním o¬brazu. Zmiňuji základní kon-trastní látky užívané v MRI zobrazování. Popisuji vybrané pulsní sekvence, se kterými dále pracuji v praktické části - experimentální měření koncentrace kontrastní látky ve vzorku. Sestavil jsem akviziční protokoly pro experiment. Praktické měření se bude provádět na 1,5 T silném magnetu na pracovišti Masarykova onkologického ústavu v Brně. Dále jsem rozšířil stávající software o funkce pro zpracování IR TurboFLASH dat a perfusní analýzu časových sekvencí a její vyhodnocení. V závěru provádím disku-si zpracovaných naměřených dat.
|
|
|
Škálování arteriální vstupní funkce v DCE-MRI
Holeček, Tomáš ; Kolář, Radim (oponent) ; Kratochvíla, Jiří (vedoucí práce)
Perfusní zobrazování pomocí magnetické rezonance je moderní diagnostická metoda využívaná hlavně v onkologii. Při této metodě je pacientovi podávána kontrastní látka a poté je průběžně sledován průběh její koncentrace v postižené oblasti v čase. Velice důležité při perfusní analýze je správné stanovení arteriální vstupní funkce (AIF). V poslední době je snaha tuto funkci modelovat pomocí multikanálové slepé dekonvoluce, nicméně z její podstaty pramení nutnost takto odhadnutou AIF škálovat, aby perfusní parametry odpovídaly skutečnosti z hlediska kvantitativního hodnocení. Tato diplomová práce se zaměřuje na popis metod škálování AIF a jejich vliv na úspěšnost odhadu perfusních parametrů v různých tkáních v závislosti na použitém modelu AIF.
|
|
| |
|
|
Komprimované snímání perfúzního zobrazování v MRI
Daňková, M. ; Rajmic, P. ; Jiřík, Radovan
Perfúzní zobrazování v MRI je lékařská diagnostická metoda, kdy pacientovi podáme kontrastní látku a poté průběžně sledujeme průběh její koncentrace v postižené oblasti. Tuto závislost můžeme přibližně matematicky popsat pomocí křivky hustoty lognormálního rozdělení. Standardní způsob měření je velmi pomalý a nevyhovuje dnešním náročným požadavkům. V tomto článku navrhujeme využít komprimované snímání, kdy naměříme výrazně méně koeficientů, ale přitom se nedopustíme velké chyby při rekonstrukci signálu. Vycházíme přitom ze skutečnosti, že data lze dobře aproximovat součtem matice s nízkou hodností a matice řídké ve spektru po řádcích.
|
host ::
RSS.