|
|
Interaktivní Java applet pro 3D vizualizaci optického disku oka
Šikl, Jaroslav ; Kolář, Radim (oponent) ; Peter, Roman (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá návrhem a realizací interaktivního Java appletu pro 3D vizualizaci topografie optického disku oka. Primárním účelem 3D vizualizace je oftalmologie a to především při diagnostice zeleného zákalu – glaukomu. Program může sekundárně sloužit i jako názorná pomůcka, pomocí níž je možné prakticky se seznamovat s transformací 2D obrazu na 3D model a s vlivem úprav a nastavování jednotlivých parametrů na vykreslování tohoto modelu ve 3D prostoru. V práci jsou navrženy dvě verze appletu, které byly vytvořeny ve vývojovém prostředí NetBeans verze 5.5, a jejich finální realizace je provedena jako aplikace typu .html, pracující v okně webového prohlížeče s vhodnou mírou uživatelské interaktivity. První verzí realizovaného appletu je jednoduchá intuitivní aplikace, v níž jsou přednastaveny některé parametry zobrazení tak, že po načtení obrázku je automaticky vykreslen 3D model. Applet následně dovoluje nastavovat u tohoto zobrazení velikost, 3D hloubku zobrazení, vyhlazení hran povrchu a možnost volby zobrazení šedotónového, nebo barevného obrázku. Druhá verze realizovaného appletu je rozšířením prvního appletu o možnost zobrazení os x, y, z ve 3D prostoru, vykreslování povrchu 3D modelu pomocí jednotlivých bodů v prostoru, čar nebo sítě, nebo osvětlení jeho povrchu. Software byl otestován na dostupných topografických datech pořízených přístrojem HRT a součástí jsou tedy i ukázky dosažených výsledků. Práce obsahuje také technickou a uživatelskou dokumentaci.
|
|
|
Internetová knihovna metod a algoritmů pro registraci medicínských obrazů
Koňařík, Jakub ; Fedra, Petr (oponent) ; Peter, Roman (vedoucí práce)
Registrace obrazů je postup vedoucí k nalezení geometrické transformace, která zajistí shodnou pozici, orientaci a velikost korespondujících objektů v obrazech. Jaké jsou tyto metody a jak fungují? Tyto metody a principy jsou vysvětleny v první části této práce. Druhá část práce je zaměřena na výklad teorie informačních systémů a praktickou tvorbu internetové databáze. Praktická část byla realizována v redakčním systému Drupal.
|
|
|
Automatická segmentace zájmových oblastí lidského obratle
Novosadová, Michaela ; Jan, Jiří (oponent) ; Peter, Roman (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce popisuje anatomii páteře a její nejčastější patologie se zaměřením na nádorová onemocnění, která v dnešní době postihují stále vyšší procento populace. Dále práce obsahuje teoretické pojednání o registraci obrazu. Cílem práce je vytvoření algoritmu, který bude schopen automaticky segmentovat lidský obratel na zájmové oblasti (tj. tělo a zadní elementy). Takto segmentovaný obratel by mohl v budoucnu usnadnit klasifikaci nádorových onemocnění páteře. Na základě teoretických znalostí bylo navrženo řešení využívající registrace segmentovaných modelů na originální data. Práce popisuje postup řešení daného problému. Popis postupu řešení a hodnocení výsledků jsou prezentovány pro názornost řadou tabulek, grafů a obrázků.
|
|
|
Image database system for glaucoma diagnosis support
Peter, Roman ; Roleček, Jiří (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
This master thesis describes a conception of standard and advanced eye examination methods used for glaucoma diagnosis in its early stage. According to the theoretical knowledge, a web based information system for ophthalmologists with three main aims is implemented. The first aim is the possibility to share medical data of a concrete patient without sending his personal data through the Internet. The second aim is to create a patient account based on a complete eye examination procedure. The last aim is to improve the HRT diagnostic method with an image registration algorithm for the fundus and intensity images and create an optic nerve head web based 3D visualization. This master thesis is a part of project based on DAAD co-operation between Department of Biomedical Engineering, Brno University of Technology, Eye Clinic in Erlangen and Department of Computer Science, Friedrich-Alexander University, Erlangen-Nurnberg.
|
|
|
Internetová knihovna metod a algoritmů pro registraci medicínských obrazů
Koňařík, Jakub ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Peter, Roman (vedoucí práce)
Registrace obrazů je postup vedoucí k nalezení geometrické transformace, která zajistí shodnou pozici, orientaci a velikost korespondujících objektů v obrazech. Jaké jsou tyto metody a jak fungují? Tyto metody a principy jsou vysvětleny v první části této práce. Druhá část práce je zaměřena na výklad teorie informačních systémů a praktickou tvorbu internetové databáze. Praktická část byla realizována v redakčním systému Drupal.
|
|
|
Internetová knihovna metod a algoritmů pro registraci medicínských obrazů
Koňařík, Jakub ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Peter, Roman (vedoucí práce)
Registrace obrazů je postup vedoucí k nalezení geometrické transformace, která zajistí shodnou pozici, orientaci a velikost korespondujících objektů v obrazech. Jaké jsou tyto metody a jak fungují? Tyto metody a principy jsou vysvětleny v první části této práce. Druhá část práce je zaměřena na výklad teorie informačních systémů a praktickou tvorbu internetové databáze. Praktická část byla realizována v redakčním systému Drupal.
|
|
|
Automatická segmentace zájmových oblastí lidského obratle
Novosadová, Michaela ; Jan, Jiří (oponent) ; Peter, Roman (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce popisuje anatomii páteře a její nejčastější patologie se zaměřením na nádorová onemocnění, která v dnešní době postihují stále vyšší procento populace. Dále práce obsahuje teoretické pojednání o registraci obrazu. Cílem práce je vytvoření algoritmu, který bude schopen automaticky segmentovat lidský obratel na zájmové oblasti (tj. tělo a zadní elementy). Takto segmentovaný obratel by mohl v budoucnu usnadnit klasifikaci nádorových onemocnění páteře. Na základě teoretických znalostí bylo navrženo řešení využívající registrace segmentovaných modelů na originální data. Práce popisuje postup řešení daného problému. Popis postupu řešení a hodnocení výsledků jsou prezentovány pro názornost řadou tabulek, grafů a obrázků.
|
|
|
Internetová knihovna metod a algoritmů pro registraci medicínských obrazů
Koňařík, Jakub ; Fedra, Petr (oponent) ; Peter, Roman (vedoucí práce)
Registrace obrazů je postup vedoucí k nalezení geometrické transformace, která zajistí shodnou pozici, orientaci a velikost korespondujících objektů v obrazech. Jaké jsou tyto metody a jak fungují? Tyto metody a principy jsou vysvětleny v první části této práce. Druhá část práce je zaměřena na výklad teorie informačních systémů a praktickou tvorbu internetové databáze. Praktická část byla realizována v redakčním systému Drupal.
|
|
|
Fusion and Analysis of Multidimensional Medical Image Data
Peter, Roman ; Flusser,, Jan (oponent) ; Kozubek,, Michal (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Analysis of medical images has been subject of basic research for many years. Many research papers have been published in the field related to image analysis and focused on partial aspects such as reconstruction, restoration, segmentation and classification, registration (spatial alignment) and fusion. Besides the introduction of related general concepts used in medical image processing, this thesis deals with two specific medical problems formulated in cooperation with Philips Netherland BV, Philips Healthcare division. The first topic is focused on subtraction angiography in patients’ lower legs utilizing image data from X-Ray computed tomography (CT). CT subtraction angiography (CTSA) is typically used for indication of the Peripheral Artery Occlusive Disease (PAOD) and for examination of acute injuries of lower legs such as acute fractures, etc. Current methods in clinical praxis are not sufficient regarding the pre-processing such as masking of patient desk, cover, splint, etc. The subtraction of blood vessels adjacent to neighboring bones in lower legs is of low accuracy due to the Partial Volume artifact. Masking of calcifications and detection of tiny blood vessels complementing necessary information about the alternative blood supply in lower legs in case of obstruction in main arteries is also not reliable for fully automated process presently. Therefore, the main aim regarding this topic was to develop an automated framework that could overcome current shortcomings in CTSA examination. The second topic is oriented on the identification and evaluation of pathologic changes in human spine, focusing on osteolytic and osteoblastic lesions in individual vertebrae in CT images. Such changes occur typically as a consequence of metastasizing process of cancerous disease. For the detection of pathologic changes, an identification and segmentation of individual vertebrae is necessary. Moreover, the analysis of individual lesions in vertebrae depends also on correct identification of vertebral body and posterior segments of each vertebra, and on segmentation of their trabecular centers. Patients are typically examined more than once during their therapy. Then, the evaluation of possible tumorous progression is based on accurate detection of pathologies in individual vertebrae in the base-line and corresponding follow-up images. Since the corresponding vertebrae are in mutually different positions in the follow-up images, their fusion leading to the analysis of the lesion progression is complicated. The main aim regarding this topic is to develop a complex framework for detection of pathologic lesions on spine, with the main focus on osteoblastic and osteolystic lesions. Such system has to provide not only reliable segmentation of individual vertebrae and detection of their main regions but also the masking of their cortical bone, detection of their pathologic changes and their evaluation. Although this dissertation thesis is primarily oriented at the experimental part of medical image processing considering both the above mentioned topics, it deals with all necessary processing steps, i.e. preprocessing, image registration, post-processing and evaluation of results, leading to the future use of both frameworks in clinical practice. Since both frameworks were developed in a team, there are some chapters referring to the dissertation thesis of Milos Malinsky.
|
|
|
Segmentace 3D obrazových dat na základě deformovatelných modelů
Klásek, Pavel ; Peter, Roman (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Tato práce řeší úlohu předzpracování a segmentace lidských obratlů ze 3D obrazových dat výpočetního tomografu. Práce popisuje teorii segmentace a lícování obrazu, kterou aplikuje v konkrétním postupu řešení automatické lokalizace průběhu spinálního kanálu a lokalizace středů těl jednotlivých obratlů. Práce popisuje vznik 3D deformovatelných modelů obratlů a seznamuje s vývojem a průběhem procesu segmentace obratlů na základě lícování těchto 3D modelů. Dílo předkládá hodnocení přesnosti a spolehlivosti výsledků lokalizace a segmentace.
|
host ::
RSS.