|
Charakterizace samoorganizujících se molekul a jejich využití v kapilární elektroforéze
Hodek, Ondřej ; Křížek, Tomáš (vedoucí práce) ; Čabala, Radomír (oponent)
Tato diplomová práce se zabývá využitím nově syntetizovaných derivátů α-cyklodextrinu, 2I -O-cinnamyl-α-cyclodextrinu a 3I -O-cinnamyl-α-cyclodextrinu, v kapilární elektroforéze. Jejich unikátní vlastností je tvorba agregátů ve vodném prostředí. Tyto agregáty jsou tvořeny pomocí inkluze fenylové skupiny jedné molekuly cyklodextrinu do kavity cyklodextrinu následujícího. Během práce byl testován vliv přídavku 2I -O-cinnamyl-α-cyclodextrinu či 3I -O-cinnamyl-α- cyclodextrinu do základního elektrolytu (BGE) na elektroforetické mobility osmnácti analytů. Devět analytů bylo měřeno ve formě kationtů (anilin, antipyrin, L-histidin, D,L-tyrosin, D,L- fenylalanin, N-(1-naftyl)ethylendiamin, 4-nitroanilin, p-aminoacetofenon a tyramin) a devět bylo měřeno ve formě aniontů (N-acetyl-D,L-fenylalanin, N-acetyl-D,L-tryptofan, N-benzoyl-D,L- fenylalanin, N-boc-D,L-tryptofan, N-FMOC-D,L-valin, N-FMOC-alanin, N-FMOC-D,L-leucin, D,L-3-fenylmléčná kyselina a (R)-(-)-mandlová kyselina). Elektroforetické mobility kationtů byly měřeny v základním elektrolytu o pH 2,2, posléze o pH 2,3 a anionty v základním elektrolytu o pH 8,0. Experimenty byly prováděny při teplotě 25 a 50 řC. Z počátku bylo pH pufru obsahujícího 2,5 mM TRIS upraveno na hodnotu 2,2 kyselinou trihydrogenfosforečnou. Avšak výsledky naznačovaly, že anionty...
|
|
Applications of capillary electrophoresis in life sciences
Křížek, Tomáš
Tomáš Křížek: Využití kapilární elektroforézy ve vědách o životě (Disertační práce) ABSTRAKT Tato práce se zabývá využitím kapilární elektroforézy ve dvou významných oblastech "věd o životě", konkrétně v proteomice a stanovení aktivity enzymů. V první části jsou studovány vlastnosti polymeru Pluronic F-127 jako separačního média v kapilární gelové elektroforéze. Byl zkoumán vliv termoasociace Pluronicu F-127 na selektivitu separace peptidů a aminokyselin, přičemž při teplotách pod, uvnitř a nad oblastí termoasociace žádný rozdíl v selektivitě pozorován nebyl. Funkce Pluronicu F-127 v kapilární gelové elektroforéze byla porovnána s dextranem, jakožto běžně používanou gelovou matricí. Výsledky ukazují, že Pluronic F-127 je výhodnějším médiem pro separace nízkomolekulárních bílkovin, protože poskytuje větší separační sílu při zachování nižší viskozity základního elektrolytu. Tato nižší viskozita usnadňuje výměnu základního elektrolytu po každém měření, což vede k výrazně vyšší opakovatelnosti pokusů. Dextran je na druhé straně díky své vyšší viskozitě vhodnější pro separace peptidových štěpů bílkovin, při kterých je zásadním parametrem vysoká účinnost separace. Druhá část práce je zaměřena na elektroforetická stanovení aktivity enzymů. Byla vyvinuta nová metoda separace N,N',N''-triacetylchitotriosy,...
|
|
Stanovení limitních elektroforetických mobilit nabitých cyklodextrinů
Boublík, Milan ; Riesová, Martina (vedoucí práce) ; Křížek, Tomáš (oponent)
V rámci této práce byly změřeny závislosti efektivních elektroforetických mobilit na iontové síle základního elektrolytu pomocí kapilární zónové elektroforézy pro čtyři přesně definované, vícenásobně nabité, cyklodextriny. Závislost mobility těchto cyklodextrinů na iontové síle nelze popsat Onsagerovým zákonem, a proto je nutné vyšetřit tyto závislosti experimentálně a fitovat je empirickou funkcí. Získané hodnoty limitních elektroforetických mobilit a výsledná funkce popisující vliv iontové síly na mobilitu daného cyklodextrinu jsou nezbytné pro správné stanovení komplexačních konstant těchto cyklodextrinů s různými analyty.
|
|
Kazuistika fyzioterapeutické péče o pacienta s diagnózou popálení II. - III. stupně rukou a hlavy
Purchartová, Dana ; Pánek, David (vedoucí práce) ; Křížek, Tomáš (oponent)
Název: Kazuistika fyzioterapeutické péče o pacienta s diagnózou popálení II. - III. stupně rukou a hlavy Souhrn: Cílem této bakalářské práce je získat ucelený přehled o problematice popálenin a léčebně - rehabilitačním procesu u této diagnózy. Práce je rozdělena na část obecnou a speciální. Obecná část obsahuje anatomii a fyziologii kůže, definici a patologii popálenin, možnosti a způsoby léčby se zaměřením na využití fyzioterapeutické péče. Speciální část zahrnuje metodiku práce a formou kazuistiky je zde zpracována anamnéza, vstupní kineziologický rozbor, průběh terapeutických jednotek, výstupní kineziologický rozbor a zhodnocení efektu terapie u konkrétního pacienta. Klíčová slova: popáleniny, popálení, kůže, rehabilitace, fyzioterapie, kazuistika
|
| |
|
Kazuistika pacienta s diagnózou popálení II. - III. stupně na 40% těla
Šrámková, Šárka ; Vrbová, Martina (vedoucí práce) ; Křížek, Tomáš (oponent)
Autor: Šárka Šrámková Název: Kazuistika pacienta s diagnózou popálení II.- III. stupně na 40% těla Cíle: Hlavním cílem této práce je vypracování podrobné kazuistiky rehabilitační péče pacienta s danou diagnózou, zpracování literární rešerše k zadanému tématu, získání ucelených teoretických i praktických poznatků o této diagnóze. Metody: Při zpracování kazuistiky byly využity vyšetřovací metody a fyzioterapeutické postupy osvojené během bakalářského studia fyzioterapie na FTVS UK. Obecná část práce pojednává o anatomii a fyziologii kůže, o diagnostice hloubky a rozsahu popálenin, způsobu léčby, fyzické a psychické rehabilitaci. Speciální část obsahuje metodiku práce, anamnézu, vstupní kineziologický rozbor, průběh terapie, výstupní kineziologický rozbor a efekt terapie. Výsledky: Byla vypracována podrobná kazuistika pacienta s danou diagnózou spolu s literární rešerší k danému tématu. Hlavní přínos práce je v možnosti získání nových zkušeností a poznatků o této diagnóze.
|
|
Biopaliva z vodních řas
Vobecká, Kateřina ; Tesařová, Eva (vedoucí práce) ; Křížek, Tomáš (oponent)
Tato bakalářská práce je zaměřena na obnovitelné zdroje energie konkrétně na biopaliva vyrobená z vodních řas. V úvodu se zabývá legislativními opatřeními, která s biopalivy souvisí, ať už v rámci Evropské unie, nebo v České republice a dále popisuje řasy jako takové a technologii jejich kultivace v podlouhlých nádržích a fotobioreaktorech. Na kultivaci řas přímo navazuje výroba biopaliv jako například bionafty a bioethanolu, a dalších hodnotných produktů, která je diskutována v poslední části této práce.
|
|
Applications of capillary electrophoresis in life sciences
Křížek, Tomáš ; Coufal, Pavel (vedoucí práce) ; Pacáková, Věra (oponent) ; Tůma, Petr (oponent)
Tomáš Křížek: Využití kapilární elektroforézy ve vědách o životě (Disertační práce) ABSTRAKT Tato práce se zabývá využitím kapilární elektroforézy ve dvou významných oblastech "věd o životě", konkrétně v proteomice a stanovení aktivity enzymů. V první části jsou studovány vlastnosti polymeru Pluronic F-127 jako separačního média v kapilární gelové elektroforéze. Byl zkoumán vliv termoasociace Pluronicu F-127 na selektivitu separace peptidů a aminokyselin, přičemž při teplotách pod, uvnitř a nad oblastí termoasociace žádný rozdíl v selektivitě pozorován nebyl. Funkce Pluronicu F-127 v kapilární gelové elektroforéze byla porovnána s dextranem, jakožto běžně používanou gelovou matricí. Výsledky ukazují, že Pluronic F-127 je výhodnějším médiem pro separace nízkomolekulárních bílkovin, protože poskytuje větší separační sílu při zachování nižší viskozity základního elektrolytu. Tato nižší viskozita usnadňuje výměnu základního elektrolytu po každém měření, což vede k výrazně vyšší opakovatelnosti pokusů. Dextran je na druhé straně díky své vyšší viskozitě vhodnější pro separace peptidových štěpů bílkovin, při kterých je zásadním parametrem vysoká účinnost separace. Druhá část práce je zaměřena na elektroforetická stanovení aktivity enzymů. Byla vyvinuta nová metoda separace N,N',N''-triacetylchitotriosy,...
|
|
Separace a stanovení možných produktů enzymového štěpení 4-nitrofenyl-N,N'-diacetyl-β-D-chitobiosidu pomocí kapilární elektroforézy
Velvarská, Romana ; Křížek, Tomáš (vedoucí práce) ; Kalíková, Květa (oponent)
Tato práce se zabývá vývojem a optimalizací podmínek metody, kterou lze využít k porovnání aktivity enzymu β-N-acetylhexosaminidasy při hydrolýze jejího přirozeného substrátu a tvz. chromogenního substrátu, který se často využívá při studiu enzymové kinetiky. Jako substrát pro štěpení byl zvolen 4-nitrofenyl-N,N'-diacetyl-β- D-chitobiosid. Tento oligosacharid obsahuje vazbu, kterou enzym štěpí v přirozeném substrátu, a zároveň také vazbu, která se vyskytuje v substrátu chromogenním. Pro stanovení produktů, jež vznikají při enzymatické hydrolýze 4-nitrofenyl-N,N'-diacetyl- β-D-chitobiosidu byla využita kapilární zónová elektroforéza. Nejprve bylo nutno najít optimální složení základního elektrolytu, tedy jeho hodnotu pH a koncentraci. Optimálním základním elektrolytem byl roztok tetraboritanu sodného o koncentraci 25 mmol/l a hodnotě pH 10,25. Následně byla zjištěna opakovatelnost měření, kalibrační závislosti a linearita, limit detekce a limit kvantifikace. Opakovatelnost migračních časů se pohybovala do 0,6%, opakovatelnost plochy píků pak v rozmezí 2,5 až 6,3%. Limity detekce metody byly v rozmezí 0,005-0,120 mmol/l. Nakonec byla optimalizovaná metoda úspěšně použita ke sledování průběhu skutečného enzymového štěpení.
|
| |