|
|
Optimization of surface-enhanced Raman scattering spectroscopy for study of biologically important biomolecules and their interactions
Šmídová, Natália ; Procházka, Marek (vedoucí práce) ; Vlčková, Blanka (oponent) ; Michl, Martin (oponent)
Název práce: Optimalizace spektroskopie povrchem zesíleného Ramanova rozptylu ke studiu biologicky významných molekul a jejich interakcí Autor: Natália Šmídová Ústav: Fyzikální ústav UK Vedoucí doktorské práce: Doc. RNDr. Marek Procházka, PhD. Abstrakt: Hlavním cílem práce byla optimalizace spektroskopie povrchem zesíleného Ramanova rozptylu (SERS) pro studium významných biomolekul. K tomuto účelu byly vybrány povrchy na bázi zlatých koloidních nanočástic imobilizovaných na silanizované skleněné podložky. Stabilní, homogenní a reprodukovatelné povrchy vhodné pro SERS spektroskopii byly připraveny použitím aminopropyl- trimetoxysilanu a citrátem redukovaných zlatých koloidních nanočástic tepelně upravených po jejich imobilizaci. Na těchto površích byly studovány modelové biomolekuly 5,10,15,20-tetrakis(1-metyl-4-pyridyl)porfyrin (TMPyP) a 5,10,15,20- tetrakis(4-sulfonatofenyl)porfyrin (TSPP) pomocí klasického Ramanova spektrometru v makro-módu a konfokálního Ramanova mikrospektrometru. Podmínky pro SERS měření porfyrinů byly optimalizovány s ohledem na citlivost a reprodukovatelnost. SERS mikrospektroskopie ukázala řadu výhod oproti SERS měření v makro-módu: možnost spektrálního mapování povrchu, snadnější manipulace se vzorkem, kratší akumulační časy a absence silného Ramanova signálu ze skleněné...
|
|
|
Development and optimization of systems for SERS on single molecule level
Michlová, Magdalena ; Vlčková, Blanka (vedoucí práce) ; Pfleger, Jiří (oponent) ; Procházka, Marek (oponent)
AABBSSTTRRAAKKTT Byly připraveny dimery, malé agregáty a kompaktní agregáty Ag nanočástic (NP), navázané chemicky na povrch pevných podložek. Těmito podložkami byly buď Cu či Au TEM síťky s vrstvou SiO2 nebo sklíčka, obojí s povrchem funkcionalizovaným 3-aminopropyltrimethoxysilanem (APTMS). Kompaktní agregáty Ag NP obsahující protoporfyrin IX (PPIX) byly připraveny působením chloridů na Ag sol v přítomnosti PPIX. Dimery a malé agregáty Ag NP byly sestaveny s využitím vybraných molekulárních spojek: 4,4'- diaminoazobenzen (DAAB), 4,4'-diaminoterfenyl (DATP) a 5,10,15,20-tetrakis(4-aminofenyl)porfin (TAPP). Jako nejúčinnější postup jejich přípravy se ukázala třístupňová procedura sestávající (i) navázání izolovaných Ag NP na povrch podložky prostřednictvím NH2 skupin APTMS, (ii) adsorpce molekulární spojky přes jednu z jejích NH2 skupin a (iii) připojení dalších Ag NP ke zbývající volné NH2 skupině. Při této proceduře byla využita funkcionalizace Ag NP citrátovými anionty ke kontrole kolmé adsorpční geometrie molekulárních spojek, přičemž adsorbované citrátové ionty fungovaly jako účinná preorientační matrice. Vzdálenosti mezi jednotlivými dimery či malými agregáty byla určena dostatečnou vzdáleností mezi izolovanými Ag NP v prvním kroku výše zmíněné třístupňové procedury. Byla také vyvinuta strategie pro...
|
|
|
Application of Raman spectroscopy for study of nitrogen containing compounds for astrobiological purposes
Culka, Adam ; Jehlička, Jan (vedoucí práce) ; Vlčková, Blanka (oponent) ; Frank, Otakar (oponent)
V ABSTRAKT Předkládaná disertační práce se zaměřuje na vyhodnocení využití Ramanovy spektrometrie jako analytické metody pro výzkum vybraných dusík obsahujících látek v experimentech, které jsou důležité z hlediska astrobiologie. Výsledky experimentů poskytují cenné informace o výhodách a omezeních metody při řešení úkolů a problémů, které jsou očekávány v průběhu plánovaných výzkumných misí se zaměřením na astrobiologii, kde je Ramanova spekrometrie považována za jednu z velmi platných výzkumných metod. Ramanova spektrometrie byla testována v různorodých experimentálních úkolech: Při analýzách dusík obsahujících minerálů, díky svým vlastnostem, jako nedestruktivní analýza, malá velikost stopy laseru a možnost výběru zdroje excitačního záření, metoda umožnila získat kvalitní data; spektra některých zkoumaných minerálů byla interpretována a publikována vůbec poprvé. Analýzami uměle připravených vzorků směsí biomarkerů a minerálů byla zkoumána použitelnost metody pro analýzu složitějších směsí: ve směsi třech biomarkerů a dvou minerálů byly všechny složky jednoznačně detekovány. V případě detekce biomarkerů, například aminokyselin, ve směsi podobných sloučenin, s množstvím pásů, přenosný spektrometr byl schopen rozlišit až pět podobných sloučenin. Dále byly prováděny analýzy za účelem zjištění, jaké nejnižší...
|
|
|
Povrchem-zesílený resonanční Ramanův rozptyl Zn(II) porfyrinů v systémech s agregovanými a neagregovanými Ag nanočásticemi
Spáčil, Dušan ; Vlčková, Blanka (vedoucí práce) ; Procházka, Marek (oponent)
V této diplomové práci byla měřena a interpretována SERRS (Surface - enhanced resonance Raman Scattering) a SERS (Surface - enhanced Raman Scattering) spektra, spektra plasmonové extinkce (SPE) a TEM snímky systémů obsahujících kationtový zinkový porfyrin ZnTMPyP a nanočástice Ag (Ag NČ). Byly studovány jednak systémy s izolovanými nanočásticemi, jednak systémy s kompaktními agregáty Ag NČ. Systémy s izolovanýmí částicemi byly tvořeny přidáním ZnTMPyP k hydrosolu Ag NČ. K tomuto systému byl přidán chlorid sodný, čímž vznikl systém s kompaktními agregáty. SERRS a SERS spektra ZnTMPyP při λexc= 441,6 nm a 532 nm byla studována nejprve stacionárně v připravených systémech, a posléze v dynamickém vývoji systémů Ag NČ (hydrosol) → Ag NČ/ ZnTMPyP → Ag NČ/ ZnTMPyP/ NaCl po dobu 680 s. Časové vývoje SERRS a SERS spektra byly podrobeny faktorové analýze (FA) a doplněny studií časového vývoje SPE spekter systémů. FA ukázala především výrazný nárůst signálu ZnTMPyP spojený s přídavkem NaCl, tedy s konverzí systému s izolovanými nanočásticemi na systémy s kompaktními agregáty Ag NČ. V případě systémů s nejvyššími koncentracemi ZnTMPyP byl nárůst signálu následován jeho poklesem. FA byly rovněž určeny meze SERRS ( λexc= 441,6 nm) a SERS (λexc= 532 nm) spektrální detekce ZnTMPyP v obou typech systémů a porovnávány s...
|
|
|
Bipyridylove komplexy Ru(II) jako SERS spektralni sondy pro studium mechanismu povrchem modifikovanych optickych procesu
Kokošková, Markéta ; Vlčková, Blanka (vedoucí práce) ; Šmejkal, Petr (oponent)
SE(R)RS (povrchem zesílený Ramanův rozptyl) spektra kationu bis(2,2'-bipyridyl)-(4,4'- dikarboxy-2,2'-bipyridyl)ruthenatého /Ru(bpy)2(dcbpy)/ v systémech s nemodifikovanými a/nebo s chloridy modifikovanými Ag nanočásticemi (AgNČ) byla získána a porovnána s odpovídajícími spektry kationu tris(2,2'-bipyridyl)ruthenatého /Ru(bpy)3/. Štěpení několika pásů a přítomnost nového pásu 1367 cm-1 pozorované pouze v SE(R)RSu Ru(bpy)2(dcbpy) v systému s chloridy nemodifikovanými agregáty AgNČ bylo přisouzeno chemisorpci komplexu na povrch AgNČ prostřednictvím dvou karboxylových skupin. Bylo zjištěno, že získané SE(R)RS excitační profily spektrálních pásů odpovídajících Ru-dcbpy jednotce chemisorbovaného komplexu dosahují maxima při excitaci 488 nm, zatímco profily dvou Ru- bpy jednotek ho dosahují při 458 nm. Srovnání profilů s elektronovým absorpčním spektrem volného Ru(bpy)2(dcbpy) odhalilo, že chemisorpce komplexu zapříčiňuje posun pásu přenosu náboje přechodu Ru→(dcbpy) do červené oblasti. Pozorovaný pokles energie přenosu náboje přechodu Ru→(dcbpy) je vysvětlen nárůstem schopnosti dvou COO- skupin čerpat elektrony vlivem jejich adsorpce na povrch AgNČ. Koncentrační hodnoty meze SERRS spektrální detekce obou komplexů v systémech s unifikovanou morfologií AgNČ byly porovnány při exc = 441,6 nm. Pro...
|
|
|
Grafická podpora pro zadávání Unixové příkazové řádky
Podzimek, Andrej ; Vlčková, Blanka (oponent) ; Rindt, Eduard (vedoucí práce)
Předložená práce je podrobným popisem a dokumentací softwarového projektu GRUX. Hlavním účelem programu je poskytnout interaktivní obdobu manuálových stránek. Jeho vstupem je datová struktura popisující hierarchii gra ckých prvků a jejich vzájemné vztahy. Výstupem je kód v jazyce Java, který využívá knihovnu SWT (Standard Widget Toolkit) k zobrazení gra ckého dialogového okna. Tato práce podrobn popisuje návrh struktury vstupních a výstupních dat i implementaci generátoru dialogů. Dalším obsahem práce je veškerá dokumentace potřebná pro používání či další vývoj softwarového projektu.
|
|
|
Penzion
Vlčková, Bára ; Kučera, Radim (oponent) ; Pěnčík, Jan (vedoucí práce)
Tato diplomová práce je projekt novostavby pětipodlažního, částečně podsklepeného penzionu v Opavě. Tento penzion bude využíván pro účely ubytování, stravování a rekreace. Ubytovací kapacita penzionu je 21 osob. V suterénu se nachází technické zázemí. První nadzemní podlaží je určené pro celkový chod penzionu, zaměstnance, stravování a sportování. Ve druhém a třetím nadzemním podlaží se nachází pokoje pro hosty. Téměř každý pokoj je vybaven balkónem. Ve čtvrtém nadzemním podlaží je společenská místnost s přilehlou terasou. Stavba je zděná. Svislé nosné konstrukce jsou provedeny z keramických bloků. Obvodové zdivo je zatepleno vnějším kontaktním systémem. Stropy jsou z větší části keramicko-betonové a z menší části železobetonové monolitické. Penzion je zastřešen jednoplášťovou plochou střechou.
|
|
|
Testování komerčních přípravků do odlučovačů tuků
Vlčková, Bohumila ; Vítová, Eva (oponent) ; Omelková, Jiřina (vedoucí práce)
Diplomová práce byla zaměřena na testování pěti komerčních přípravků do odlučovačů tuků. Provedená studie měla dokázat, že v přípravcích jsou přítomny mikroorganismy, které produkují lipolytické enzymy, popř. v nich je i přídavek lipolytických enzymů. Přípravky byly kultivovány povrchově i submerzně a následně testovány jejich vlastnosti jako je lipolytická aktivita, množství uvolněných mastných kyselin atd. Pro povrchovou kultivaci byl použit Tributyrin Agar Base, kde se jako substrát používal Trbutyrin. Pro submerzní kultivaci bylo použito speciálně připravené médium, které obsahovalo olivový olej. Metody použité v této studii sloužily k detekci a kvantifikaci mikroorganismů, které produkují lipolytické enzymy v jednotlivých přípravcích. K detekci mikroorganismů, které produkují lipolytické enzymy byl použit Spirit Blue Agar. Zde se jako substrát používal tributyrin a Tween 80. Aktivita byla měřena spektrofotometricky a degradace lipidů byla měřena titračně. Provedená studie ukázala, že všechny testované přípravky mají schopnost rozkládat tuky.
|
|
|
RODINNÝ DŮM VE ŠTÍTINĚ
Vlčková, Bára ; Dohnal, Jakub (oponent) ; Pěnčík, Jan (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce je projekt dvoupodlažního podsklepeného rodinného domu ve Štítině. Dům je zděný a je navržen pro bydlení čtyřčlenné rodiny. V suterénu se nachází společenská místnost, sklad potravin, sušárna, WC, technická místnost a kolárna. V prvním nadzemním podlaží se nachází zádveří, obývací pokoj s kuchyní, koupelna, WC a pokoj pro hosty. K objektu je napojena garáž pro jeden osobní automobil. Garáž však není provozně spojena s obytnou částí. V druhém nadzemním podlaží najdeme dva dětské pokoje, ložnici, koupelnu, WC a pracovnu. Z jednoho dětského pokoje je přístup na balkón. Druhé nadzemní podlaží je zastřešeno sedlovou střechou. Nad garáží je plochá střecha. Projekt je zpracován v počítačovém programu AutoCAD.
|
|
|
Art commerce in Czech Republic
Vlčková, Barbora ; Drozen, František (vedoucí práce) ; Novák, Miloš (oponent)
Bakalářská práce popisuje obchod s uměním v České republice se zaměřením na výtvarné umění. Situaci na českém trhu porovnává se zahraničím a uvádí možná řešení jak ji vylepšit. Věnuje se také detailnějšímu popisu chodu aukčních síní a galerií, zákonům spojeným s obchodem s uměním a podpoře umění v České republice.
|
host ::
RSS.