|
Molekulární diagnostika septických stavů
Nekudová, Pavlína
Sepse je život ohrožující stav, ke kterému dochází v důsledku imunitní odpovědi hostitelského organismu na infekci. Včasné a správné určení původce sepse je klíčové pro přežití septických pacientů, aby byla co nejdříve zahájena cílená terapie. I přes pokrok molekulárně biologických metod používaných pro detekci patogenů, doporučeným standardem pro identifikaci původce sepse zůstávají hemokultury. Tato metoda je však časově náročná, proto neumožňuje významné ovlivnění iniciální terapie sepse. V rámci této bakalářské práce byla sepsána rešerše na téma problematiky sepse a detekčních metod umožňujících identifikaci původců sepse. Důraz byl kladen na molekulárně biologické metody využívající polymerázovou řetězovou reakci. V experimentální části byly zkoumány možnosti pre-analytického zpracování krve, která je primárním materiálem pro detekci původců sepse. Byly testovány přístupy, které by mohli vést ke zvýšení citlivosti detekce, případně usnadnění manipulace se vzorkem v diagnostické laboratoři při používání metody založené na PCR. Použití komerčního kitu MolYsis™ Basic5 určeného k obohacení mikrobiální DNA vedlo pouze k mírnému zlepšení citlivosti detekce. Použití plazmy jako klinického materiálu místo krve se ukázalo jako relevantní. Na rozdíl od krve je možné plazmu zamrazit a skladovat a obsahuje menší množství inhibitorů PCR. Časová a finanční náročnost testovaného pre-analytického přístupu společně s vyššími požadavky na vybavení laboratoře, nejsou vyváženy přínosem v podobě adekvátně zvýšené citlivosti detekce. Použití tohoto pre-analytického přístupu tedy nebude dále zvažováno při vývoji systému zaměřeného na rychlou molekulární diagnostiku sepsí. Použití plazmy však vykazovalo srovnatelnou citlivost s krví a je doporučeno pro další testování spojené s diagnostikou sepsí.
|
|
Problematika odběru hemokultur na standardním oddělení
FÍKOVÁ, Markéta
Odběr hemokultur se řadí mezi jedno z klíčových vyšetření krve a umožňuje identifikaci mikroorganismů, rozpoznání infekce a dále nasazení správné antibiotické léčby. Odběr krve na hemokultury musí být proveden přísně asepticky a je důležité při něm dodržovat všechny stanovené standardy a specifika. Krev odebraná od pacienta se musí v hemokultivačním systému v co nejkratším čase dostat na mikrobiologické oddělení, kde je dále kultivována. Při nedodržení všech daných standardů může dojít k falešným výsledkům hemokultur, nasazení nesprávné léčby a prodloužení doby léčení. Cílem této bakalářská práce bylo popsat problematiku odběru hemokultur na standardním oddělení, charakterizovat základní postupy při odběru jako důležitý způsob mikrobiologického vyšetření, ověřit správnost dodržování standardizovaných postupů u zdravotnického personálu, zjistit teoretické znalosti sester a zmapovat překážky a komplikace vyskytující se při odběru. Výzkumný soubor tvořilo celkem 9 sester pracujících na lůžkovém oddělení v nemocnici Jihočeského kraje. Technikami sběru dat byly polostrukturované rozhovory a skryté pozorování. Z výzkumného šetření vyplývá, že většina sester nedodržuje všechny dané standardy spojené s odběrem hemokultur. Sestry chybovaly v identifikaci pacienta, přípravě pomůcek, dodržování přísně aseptického postupu za použití bariérových pomůcek a v neposlední řadě nezacházely s infekčním a ostrým materiálem v souladu s BOZP. Z výsledků také vyplynulo, že sestry mají dobré teoretické znalosti, ale v praxi je nevyužívají, jak by měly.
|
|
Infekce krevního řečiště u pacientů v období pandemie COVID-19 ve Všeobecné fakultní nemocnici v Praze
BAUER, Kristýna
Infekce krevního řečiště se řadí k závažným stavům ohrožujícím život hospitalizovaných pacientů s koronavirovým onemocněním v průběhu pandemie COVID-19 v České republice. Jedná se o průnik mikroorganismů do krevního oběhu, který je doprovázen příznaky celkové infekce. Nejčastějším následkem je rozvoj sepse. Cílem laboratorního vyšetření je získání spolehlivého hemokultivačního výsledku. Takový výsledek může být dosažen jen v tom případě, kdy jsou dodrženy veškeré postupy od indikace lékařem až po proces odběru zdravotnickým personálem do lahviček k tomu přímo určených. Odběrem krevních kultur se potvrdí, nebo vyloučí přítomnost bakterií v krevním oběhu. Zlatým standardem pro diagnostiku infekcí krevního řečiště jsou krevní kultury. K hemokultivaci se využívá detekčního kultivačního systému BacT/Alert 3D, který je založen na kolorimetrické detekci CO2 produkovaného rostoucími mikroorganismy v hemokulturách.
|
|
Umělá inteligence pro predikování sepsí z klinických signálů
Šidlo, David ; Chmelík, Jiří (oponent) ; Vičar, Tomáš (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce řeší otázku predikování sepsí z klinických signálů pomocí metod umělé inteligence. V teoretické části je vypracována literární rešerše na zakladní principy a fungování různých metod umělé inteligence. Větší důraz byl kladen na rekurentní neuronové sítě. Cílem praktické části byla implementace vhodné metody ve zvoleném programovacím prostředí. Jako vhodná metoda byla vybrána LSTM síť a časová konvoluční síť TCN. Nejlepších výsledků normalizované hodnoty utility score dosáhla TCN, a to 0,377 a sedmi vrstvá LSTM 0,356.
|
|
Analýza těkavých organických látek produkovaných monocyty během sepse
Bártová, Adéla ; Řezáčová, Veronika (oponent) ; Mravcová, Ludmila (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá možností analýzy těkavých látek produkovaných monocyty v průběhu sepse. K tomuto účelu byla jako metoda zvolena komprehenzivní dvojdimenzionální plynová chromatografie s hmotnostně spektrometrickou detekcí. V první části práce byla optimalizována metoda dvojdimenzionální plynové chromatografie pro stanovení těkavých organických látek. V této části práce byly postupně upravovány parametry metody plynové chromatografie tak, aby bylo dosaženo co nejvyšší účinnosti. Dále byly optimalizovány podmínky přípravy vzorků. V druhé části práce byla optimalizovaná metoda využita k měření sady vzorků monocytů. Tyto vzorky byly podrobeny působení různých inhibitorů imunitního systému a stimulátorů simulujících bakteriální nebo kvasinkovou infekci. Na základě tohoto měření bylo identifikováno několik sloučenin, které jsou produkovány monocyty za podmínek simulujících infekci.
|
|
Septické stavy z pohledu klinické mikrobiologie
SZITAIOVÁ, Markéta
Tato práce se zaměřuje na problematiku infekcí krevního řečiště z pohledu klinické mikrobiologie. Diagnostika pomocí automatického hemokultivačního systému BACT/ALERT Virtuo. V teoretické části práce jsou zmínky o onemocnění krevního řečiště, původcích sepsí, způsob izolace. V praktické části práce jsou zpracována data, získaná ve Fakulní nemocnici Plzeň, zaměřená na nejčastější agens způsobující sepse.
|
|
Dodržování ošetřovatelských postupů při péči o cévní vstupy se zaměřením na prevenci katétrových infekcí
TŘEŠNIČKOVÁ, Nikola
Tato bakalářská práce na téma ,,Dodržování ošetřovatelských postupů při péči o cévní vstupy se zaměřením na prevenci katétrových infekcí" je tvořena teoretickou a výzkumnou částí. Teoretická část se nejprve zaměřuje na cévní vstupy obecně a na jednotlivé periferní a centrální katétry. Přináší informace o ošetřovatelské péči o cévní vstupy. Dále se práce věnuje infekcím spojených se zdravotní péčí. A v neposlední řadě práce informuje o katétrových infekcích, sepsi a septickém šoku. Výzkumná část byla zpracována formou kvalitativního výzkumu. Cílem bylo zjistit, jak sestry dodržují ošetřovatelské postupy při péči o cévní vstupy se zaměřením na prevenci katétrových infekcí. Pro tento cíl bylo stanoveno pět výzkumných otázek. Kvalitativní sběr dat probíhal pomocí polostrukturovaných rozhovorů a skrytého pozorování. Výzkumný soubor byl tvořen deseti sestrami pracujících na odděleních interního typu. Výběr informantů byl záměrný a probíhal metodou sněhové koule. Z výsledků je patrné, že sestry mají zkušenosti spíše s ošetřovatelskou péčí o periferní žilní katétry než o centrální žilní katétry. Z výsledků také vyplývá, že sestry mají teoretické znalosti o specifikách ošetřovatelské péče. Na základě pozorování bylo ale zjištěno, že některé sestry daná specifika ošetřovatelské péče nedodržují. Výsledky výzkumu bakalářské práce mohou být přínosné pro všechny sestry napříč všemi odděleními. Ale také mohou sloužit jako informační materiál pro studenty zdravotnických oborů.
|
|
Metody detekce snížené imunitní odpovědi u pacientů po kardiochirurgické operaci
Kormundová, Nikola ; Koláčková, Martina (vedoucí práce) ; Filipp, Dominik (oponent)
U pacientů po kardiochirurgické operaci dochází ke zvýšení hladiny molekul s prozánětlivým i protizánětlivým účinkem. Tento vzestup je ovlivněn klinickým stavem pacienta, ale také samotným charakterem operace, kdy je použitý konvenční mimotělní oběh. Tato technika vede k poškození krevních elementů přímým kontaktem se vzduchem a částmi mimotělního oběhu, a rovněž k ischemicko- reperfuznímu poškození. Specifika kardiochirurgické operace pak mají vliv na pooperační komplikace jako je multiorgánové selhání nebo septický šok. Diplomová práce je rozdělena na část teoretickou a praktickou. V teoretické části je popsán princip a vliv kardiopulmonálního bypassu na lidský organismus a komplikace, které jsou s jeho použitím spojovány. Dále je zde popsaný IFN-γ, jako potenciální marker septických stavů, který by mohl odrážet klinický pooperační stav pacientů. V praktické části diplomové práce byla sledována procentuální změna vybraných buněčných populací a produkce IFN-γ v periferní krvi pacientů před a po kardiochirurgické operaci. Dále byla zkoumána odpověď jednotlivých izolovaných populací zdravých dobrovolníků na vybrané stimulátory. Procento sledovaných buněčných populací i produkce IFN-γ u kardiochirurgických pacientů byly výrazně snížené v pooperačním období oproti stavu před operací. Tento pokles...
|
|
Determination of biochemical parameters and their diagnostic and prognostic value in sepsis
Jenčo, Jaroslav ; Dršata, Jaroslav (vedoucí práce) ; Boušová, Iva (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd Kandidát: Bc. Jaroslav Jenčo Školiteľ: prof. MUDr. Jaroslav Dršata, CSc. Konzultant: Ing. Jana Netriová, PhD. Názov diplomovej práce: Stanovenie vybraných biochemických parametrov a ich diagnostické a prognostické hodnoty u septických ochorení Septické stavy sú pomerne častou komplikáciou, ktorá sa môže podpísať na zvýšenej úmrtnosti pacientov. Postihujú všetky vekové kategórie bez ohľadu na pohlavie. Výskyt je častejší u polymorbídnych a imunosuprimovaných pacientov. Najefektívnejšia metóda na zabránenie rozvoja septických komplikácií je rýchla a presná diagnostika. V období od 1.6.2012 do 1.4.2014 sme pozorovali 697 pacientov, hospitalizovaných v dôsledku rozvoja septických komplikácií a štatisticky sme analyzovali sledované markery: presepsín, prokalcitonín, C - reaktívny proteín, interleukín - 6, laktát, D - diméry, fibrinogén a množstvo leukocytov, s cieľom určiť ich prediktívnu a diagnostickú hodnotu. Najväčšia závislosť nám vyšla v porovnaní presepsínu s prokalcitonínom a presepsínu s C - reaktívnym proteínom, ktoré odrážali rýchlo sa meniaci stav pacientov. Mierne závislosti sme pozorovali u laktátu, interleukínu - 6, D - dimérov a počtu leukocytov. Medzi rozvojom septického stavu a fibrinogénom sme...
|
|
Septické stavy novorozenců
Baláčková, Šárka ; Voxová, Barbora (vedoucí práce) ; Paterová, Pavla (oponent)
Autor: Šárka Baláčková Název: Septické stavy novorozenců Bakalářská práce Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Studijní obor: zdravotní laborant Cíl práce: Cílem práce bylo shromáždit informace o problematice septických stavů u novorozenců. Popsat laboratorní diagnostiku vyšetření novorozenecké sepse a zmapovat výskyt nejčastějších patogenů způsobujících toto onemocnění na oddělení klinické mikrobiologie Masarykovy nemocnice v Ústí nad Labem. Metoda: Sledování počtu odebraných hemokultur na novorozeneckém oddělení v období 2011-2015. Porovnání celkového počtu všech odebraných hemokultur k počtu pozitivních hemokultur a výskyt jednotlivých patogenů způsobujících novorozeneckou sepsi. Výsledky: Během sledovaného období bylo odebráno celkem 5271 hemokultur. Z tohoto celkového počtu bylo pozitivních 1047, což činní 20 %. V zastoupení jednotlivých patogenů jako vyvolavatelů novorozenecké sepse jsou na prvním místě jednoznačně koagulázanegativní stafylokoky s počtem 801 záchytů, což je až 76,5 %. Dále následují gramnegativní fakultativně anaerobní tyčky počtem 113 záchytů (10,8 %), anaerobní bakterie 48 záchyty (4,6 %), rod Enterococcus 31 záchyty (3,0 %), Staphylococcus aureus 26 záchyty (2,5 %), rod Streptococcus 21 záchyty (2,0 %) a nakonec kvasinky 7 záchyty (0,7 %)....
|