|
|
Quantitative 3D characterization of biological structures by X-ray computed microtomography
Tesařová, Markéta ; Vaňhara,, Petr (referee) ; Oberta,, Peter (referee) ; Zikmund, Tomáš (advisor)
Moderní vývojová biologie využívá široké spektrum metod k analyzování studovaných struktur. Multioborové týmy v poslední době prosazují využívání 3D přístupu k porozumění biologickým procesům. Jedna z hlavních překážek při využívání 3D zobrazovacích technik v biologii je nedostatek metodologie pro kvantifikování pozorovaných jevů, které často bývají příčinou vývojových či genetických onemocnění. V posledních letech se v biologických výzkumech rozšířilo využití rentgenové počítačové mikrotomografie (mikroCT). Technika mikroCT dokáže poskytnout izotropní rozlišení až 1 µm a při správné přípravě vzorku širokou škálu tkáňové diferenciace. Biologické struktury jsou však rozmanitých velikostí a tvarů a každá struktura vyžaduje specifický přístup v oblasti zpracování dat. Tato práce se zabývá využitím mikroCT pro zobrazování, ale především 3D charakterizaci biologických struktur ex-vivo. Zvláštní důraz je kladen na analýzu měkkých tkání v hlavách myších embryí a zobrazování různých druhů mloků se zaměřením na jejich regenerační schopnosti. Tato práce popisuje relevantní informace pro uživatele mikroCT zabývajícími se biologickými projekty: To zahrnuje přípravu vzorku pro měření, výběr vhodných parametrů k samotnému měření, a především analýzu vzniklého 3D datasetu. Nejnovější technologické pokroky ve 3D zobrazovaní byly studovány a testovány na konkrétních projektech vývojové biologie, kde 3D informace získaná pomocí mikroCT hrála klíčovou roli.
|
|
|
Development of advanced in-vivo imaging methods for non-invasive study of tumour growth dynamic
Michalčíková, Tereza ; Procházka, Jan (advisor) ; Rohlena, Jakub (referee)
Non-invasive imaging techniques, such as micro-CT or optical imaging, provide valuable information about tumour microstructure, size, volume and growth dynamics. Although histology is an approach capable of describing several of these characteristics, the invasiveness of this analysis remains a disadvantage. The main aim of this work is the methodological development of non-invasive imaging of the dynamics of tumour growth and progression. The preparation of a dual-reporter lentiviral vector enables non-invasive study of tumour growth and dissemination of metastasis. The same dual reporter will also be a part of a second vector designed as a construct for targeting mouse embryonic stem cells with aim to produce corresponding transgenic reporter mouse line. This reporter mouse line can be beneficial for future projects by providing a novel approach for studying the dynamics of tumour growth under various genetic conditions. In addition to optical imaging, this project will also include the use of micro-CT technology which, as a non-invasive approach, has the potential to provide information about the microstructure of tumour tissue in 3D that histology is not able to report.
|
guest ::
