|
|
Comparison of Classification Methods
Dočekal, Martin ; Zendulka, Jaroslav (referee) ; Burgetová, Ivana (advisor)
This thesis deals with a comparison of classification methods. At first, these classification methods based on machine learning are described, then a classifier comparison system is designed and implemented. This thesis also describes some classification tasks and datasets on which the designed system will be tested. The evaluation of classification tasks is done according to standard metrics. In this thesis is presented design and implementation of a classifier that is based on the principle of evolutionary algorithms.
|
|
| |
|
|
Pilot proficiency classification from gaze
Ruta, Dominik ; Vlk, Jan (referee) ; Chudý, Peter (advisor)
Tato práce se zabývá klasifikací úrovně odbornosti pilota a leteckých manévrů z pohledu očí. Cílem je poskytnout další cenný nástroj pro hodnocení pilotáže leteckými instruktory~a~poskytnout tak zpětnou vazbu trénovaným pilotům. Tato myšlenka je založena na základě výsledků relevantních studií, které objevily korelaci mezi užíváním efektivních skenovacích vzorů a doménové výkonnosti. V této práci jsou uvažovány dvě třídy odbornosti --- piloti a nováčci. Tato práce využívá běžné metriky pro analýzu pohledu očí. Dále jsou v této práci využity klasifikační techniky strojového učení. Metoda podpůrných vektorů je využita pro klasifikaci úrovně způsobilosti, zatímco pro klasifikaci leteckých manévrů jsou využity skryté Markovovy modely. Výsledkem práce je vysoce přesná klasifikace úrovně odbornosti pilot a dobrá schopnost rozeznat individuální letecké manévry provedené piloty.
|
|
|
Mining of soluble enzymes from genomic databases
Hon, Jiří ; Brejová, Bronislava (referee) ; Šafránek, David (referee) ; Zendulka, Jaroslav (advisor)
Enzymy jsou proteiny urychlující chemické reakce s velkým potenciálem pro farmaceutický a obecně chemický průmysl. Enzymatická funkce je obvykle zajištěna několika nepostradatelnými aminokyselinami, které tvoří tzv. aktivní místo, kde se odehrává chemická reakce. V této práci jsou prezentovány dva integrované softwarové nástroje pro dolování a racionální výběr nových rozpustných enzymů - EnzymeMiner a SoluProt. EnzymeMiner slouží k hledání nových enzymů. Na vstupu vyžaduje jednu nebo více sekvencí zvoleného enzymu spolu se seznamem klíčových aminokyselin. Tento seznam slouží k zvýšení pravděpodobnosti, že nalezený enzym bude mít podobnou funkci jako vstupní enzym. Výstupem EnzymeMineru je množina anotovaných sekvencí nalezených v databázi. Za účelem ulehčení výběru několika málo kandidátů pro experimentální ověření v laboratoři integruje EnzymeMiner anotace z dostupných databází - informaci o zdrojovém organismu a prostředí, ve kterém se vyskytuje, a informaci o proteinových doménách, ze kterých se enzym skládá. Hlavním kritériem pro výběr kandidátů je rozpustnost predikovaná druhým prezentovaným nástrojem, SoluProtem. SoluProt je metoda založená na strojovém učení, která predikuje heterologní rozpustnou expresi proteinu v organismu Escherichia coli . Vstupem je sekvence a výstupem je pravděpodobnost, že protein bude exprimován v rozpustné formě. SoluProt využívá model gradient boosting machine a byl trénován na datové sadě odvozené od databáze TargetTrack. Při srovnání na vyvážené nezávislé datové sadě odvozené z databáze NESG dosáhl SoluProt přesnosti 58,5 % a hodnoty AUC 0,62, čímž lehce převyšuje ostatní existující nástroje. Nástroje EnzymeMiner i SoluProt jsou často využívány řadou uživatelů z oblasti proteinového inženýrství za účelem hledání nových rozpustných biokatalyzátorů chemických reakcí. Ty mají velký potenciál snížit energetickou náročnost a ekologickou zátěž mnoha průmyslových procesů.
|
|
|
Pilot proficiency classification from gaze
Ruta, Dominik ; Vlk, Jan (referee) ; Chudý, Peter (advisor)
Tato práce se zabývá klasifikací úrovně odbornosti pilota a leteckých manévrů z pohledu očí. Cílem je poskytnout další cenný nástroj pro hodnocení pilotáže leteckými instruktory~a~poskytnout tak zpětnou vazbu trénovaným pilotům. Tato myšlenka je založena na základě výsledků relevantních studií, které objevily korelaci mezi užíváním efektivních skenovacích vzorů a doménové výkonnosti. V této práci jsou uvažovány dvě třídy odbornosti --- piloti a nováčci. Tato práce využívá běžné metriky pro analýzu pohledu očí. Dále jsou v této práci využity klasifikační techniky strojového učení. Metoda podpůrných vektorů je využita pro klasifikaci úrovně způsobilosti, zatímco pro klasifikaci leteckých manévrů jsou využity skryté Markovovy modely. Výsledkem práce je vysoce přesná klasifikace úrovně odbornosti pilot a dobrá schopnost rozeznat individuální letecké manévry provedené piloty.
|
|
|
Comparison of Classification Methods
Dočekal, Martin ; Zendulka, Jaroslav (referee) ; Burgetová, Ivana (advisor)
This thesis deals with a comparison of classification methods. At first, these classification methods based on machine learning are described, then a classifier comparison system is designed and implemented. This thesis also describes some classification tasks and datasets on which the designed system will be tested. The evaluation of classification tasks is done according to standard metrics. In this thesis is presented design and implementation of a classifier that is based on the principle of evolutionary algorithms.
|
|
| |
|
|
ITAT 2014. Information Technologies - Applications and Theory. Part II
Kůrková, Věra ; Bajer, Lukáš ; Peška, L. ; Vojtáš, P. ; Holeňa, Martin ; Nehéz, M.
ITAT 2014. Information Technologies - Applications and Theory. Part II. Prague : Institute of Computer Science AS CR, 2014. 145 p. ISBN 978-80-87136-19-5. This volume is the second part of the two-volume proceedings of the 14th conference Information Technologies – Applications and Theory (ITAT 2014), which was held in Jasná, Demänovská Dolina, Slovakia, on September 25–29, 2014. ITAT is a computer science conference with the primary goal of exchanging information on recent research results. Overall, 51 papers were submitted to all conference tracks. This volume presents papers from the workshops and an extended abstract of a poster. Three specialized workshops were held as a part of the conference: Data Mining and Preference Learning on Web, Computational Intelligence and Data Mining, and Algorithmic Aspects of Complex Networks Analysis.
|
|
|
ITAT 2014. Information Technologies - Applications and Theory. Part I
Kůrková, Věra ; Bajer, Lukáš
ITAT 2014. Information Technologies - Applications and Theory. Part I. Prague : Institute of Computer Science AS CR, 2014. 101 p. ISBN 978-80-87136-18-8. This volume is the first part of the two-volume proceedings of the 14th conference Information Technologies – Applications and Theory (ITAT 2014). The conference was held in Jasná, Demänovská Dolina, Slovakia, on September 25–29, 2014. ITAT is a computer science conference with the primary goal of exchanging information on recent research results between Czech and Slovak scientific communities, and it presents a platform for young researchers and PhD students to start new collaborations. This year, it was held in parallel with two collocated conferences Datakon and Znalosti with which it shared some invited plenary talks and a poster session. Overall, 51 papers were submitted to all conference tracks. This volume presents 16 papers of the main track, which were selected by the program committee based on at least two reviews by the program committee members. Papers from the three workshops and extended abstracts of posters are included in the second volume.
|
guest ::
