|
|
Precise Image Registration Used for Correction of Geometrical Image Distortion
Zemčíková, Petra ; Odstrčilík, Jan (referee) ; Mézl, Martin (advisor)
Cílem předkládané diplomové práce je pomocí lícování obrazů přesně popsat distorzní pole pro následné odstranění geometrické distorze. Snímky zkreslené geometrickou distorzí pochází z prozařovacího elektronového mikroskopu. První část práce se zabývá zejména teorií spojenou s elektronovou mikroskopií, vznikem geometrické distorze a samotnou obrazovou registrací s důrazem na intenzitní flexibilní metody lícování. Ve druhé části je pak představena vytvořená metoda pro modelování geometrické distorze a lícování obrazů postižených slabou geometrickou distorzí. Vyvinutá metoda je následně otestována na testovacích i reálných datech a srovnána s existujícími popsanými metodami pro obrazovou registraci (například open-source softwarem Elastix).
|
|
|
Criterial function for retinal image registration
Horáková, Pavla ; Kolář, Radim (referee) ; Harabiš, Vratislav (advisor)
This bachelor‘s thesis is focused on comparison criterial functions, which are usually used in registration of retinal images. Criterial functions reflect degree of images’ sameness thereby they influence proper registration considerably. The aim of this thesis is to discover criterial function, which is the best for image registration of retina. Registration of images is very difficult; it is important to get some informations such as an uniqueness or a shape of function.
|
|
|
Correction of image distortion of microscopic scene
Temelová, Kristýna ; Kolář, Radim (referee) ; Odstrčilík, Jan (advisor)
Tato diplomová práce popisuje metodu využití lícování obrazů pro korekci geometrické distorze obrazů pravidelných krystalických struktur získaných z transmisního elektronového mikroskopu (TEM). Cílem této práce je vytvořit algoritmus v Matlabu, který dokáže tyto vady eliminovat nalezením prostorové transformace, která nalícuje zkreslený obraz na jeho modelovou mřížku. Transformace je hledána s využitím optimalizačních metod, které optimalizují zvolenou kriteriální funkci.
|
|
|
Optimization based on genetic algorithms for image registration
Horáková, Pavla ; Mézl, Martin (referee) ; Harabiš, Vratislav (advisor)
Diploma thesis is focused on global optimization methods and their utilization for medical image registration. The main aim is creation of the genetic algorithm and test its functionality on synthetic data. Besides test functions and test figures algorithm was subjected to real medical images. For this purpose was created graphical user interface with choise of parameters according to actual requirement. After adding an iterative gradient method it became of hybrid genetic algorithm.
|
|
|
Affine registration of native and contrast-enhanced CT brain images
Chmelík, Jiří ; Mézl, Martin (referee) ; Walek, Petr (advisor)
This thesis is dealing with problem of brain images registration aquired by computed tomography. At the beginning is explanation of image geometrical transformation methods, notably affine transformation. Following part of text the is dealing with interpolation methods issues, calculation of similarity criterion and subsequent optimalization. All issues are handled especially for three-dimensional data. Second part of this work is practical sample of MatLab® program enviroment for registration of acquired frames by affine tranformation. In this program is algorithm for removement of stair-step artefact, under head pillow and patient’s desk, too. As an optimalization algorithm is used control random search (CRS) methode. Due to medical images type, which are distributed in DICOM format, is included process for their load and save at this work.
|
|
|
Precise Image Registration Used for Correction of Geometrical Image Distortion
Zemčíková, Petra ; Odstrčilík, Jan (referee) ; Mézl, Martin (advisor)
Cílem předkládané diplomové práce je pomocí lícování obrazů přesně popsat distorzní pole pro následné odstranění geometrické distorze. Snímky zkreslené geometrickou distorzí pochází z prozařovacího elektronového mikroskopu. První část práce se zabývá zejména teorií spojenou s elektronovou mikroskopií, vznikem geometrické distorze a samotnou obrazovou registrací s důrazem na intenzitní flexibilní metody lícování. Ve druhé části je pak představena vytvořená metoda pro modelování geometrické distorze a lícování obrazů postižených slabou geometrickou distorzí. Vyvinutá metoda je následně otestována na testovacích i reálných datech a srovnána s existujícími popsanými metodami pro obrazovou registraci (například open-source softwarem Elastix).
|
|
|
Correction of image distortion of microscopic scene
Temelová, Kristýna ; Kolář, Radim (referee) ; Odstrčilík, Jan (advisor)
Tato diplomová práce popisuje metodu využití lícování obrazů pro korekci geometrické distorze obrazů pravidelných krystalických struktur získaných z transmisního elektronového mikroskopu (TEM). Cílem této práce je vytvořit algoritmus v Matlabu, který dokáže tyto vady eliminovat nalezením prostorové transformace, která nalícuje zkreslený obraz na jeho modelovou mřížku. Transformace je hledána s využitím optimalizačních metod, které optimalizují zvolenou kriteriální funkci.
|
|
|
Advanced Algorithms for 3D Medical Image Data Fusion in Specific Medical Problems
Malínský, Miloš ; Flusser,, Jan (referee) ; Kozubek,, Michal (referee) ; Jan, Jiří (advisor)
Fúze obrazu je dnes jednou z nejběžnějších avšak stále velmi diskutovanou oblastí v lékařském zobrazování a hraje důležitou roli ve všech oblastech lékařské péče jako je diagnóza, léčba a chirurgie. V této dizertační práci jsou představeny tři projekty, které jsou velmi úzce spojeny s oblastí fúze medicínských dat. První projekt pojednává o 3D CT subtrakční angiografii dolních končetin. V práci je využito kombinace kontrastních a nekontrastních dat pro získání kompletního cévního stromu. Druhý projekt se zabývá fúzí DTI a T1 váhovaných MRI dat mozku. Cílem tohoto projektu je zkombinovat stukturální a funkční informace, které umožňují zlepšit znalosti konektivity v mozkové tkáni. Třetí projekt se zabývá metastázemi v CT časových datech páteře. Tento projekt je zaměřen na studium vývoje metastáz uvnitř obratlů ve fúzované časové řadě snímků. Tato dizertační práce představuje novou metodologii pro klasifikaci těchto metastáz. Všechny projekty zmíněné v této dizertační práci byly řešeny v rámci pracovní skupiny zabývající se analýzou lékařských dat, kterou vedl pan Prof. Jiří Jan. Tato dizertační práce obsahuje registrační část prvního a klasifikační část třetího projektu. Druhý projekt je představen kompletně. Další část prvního a třetího projektu, obsahující specifické předzpracování dat, jsou obsaženy v disertační práci mého kolegy Ing. Romana Petera.
|
|
|
Criterial function for retinal image registration
Horáková, Pavla ; Kolář, Radim (referee) ; Harabiš, Vratislav (advisor)
This bachelor‘s thesis is focused on comparison criterial functions, which are usually used in registration of retinal images. Criterial functions reflect degree of images’ sameness thereby they influence proper registration considerably. The aim of this thesis is to discover criterial function, which is the best for image registration of retina. Registration of images is very difficult; it is important to get some informations such as an uniqueness or a shape of function.
|
|
|
Segmentation of 3D image data based on deformable models
Klásek, Pavel ; Peter, Roman (referee) ; Jan, Jiří (advisor)
This document deals with the pre-processing and the segmentation of human vertebrae from computed tomography 3D image data. It describes image registration and segmentation methods concretely and commonly used in image data processing during the automated spine canal localization process and the localization of each vertebrae centroid. The 3D deformable model development is described in the work together with the introduction to the previous state of art and the progress of vertebrae segmentation using 3D deformable models registration. This work presents the evaluation of the accuracy and the reliability from the segmentation and localization results.
|
guest ::
