|
|
On-the-fly compression in time-domain ultrasound simulations
Klepárník, Petr ; Fura, Łukasz (referee) ; Krupa, Petr (referee) ; Zemčík, Pavel (advisor)
Tato práce navrhuje novou kompresní metodu a její aplikaci v rámci ultrazvukových simulací v časové oblasti se specializací na cílený ultrazvuk o vysoké intenzitě (HIFU). Rozsáhlé numerické simulace HIFU, důležité pro plánování léčby založené na modelu, generují velké množství dat. Při simulaci je obvykle nutné ukládat stovky gigabajtů. Cílem použití této metody je významná úspora výpočetních prostředků při zachování dostatečné kvality simulačních výstupů. V jádru této práce jsou prezentovány experimentální simulace, které ukazují, že navržená kompresní metoda a její využití pro on-the-fly výpočet průměrné akustické intenzity během simulace přináší významné vylepšení. Hlavní výhodou je do značné míry (až 99 %) snížená spotřeba vzácného místa na disku a přibližně stejný nárok na operační paměť během simulace, což může výrazně snížit cenu výpočetní platformy. Komprese neovlivňuje nepříznivě celkovou dobu simulace. Přesnost nové metody byla vyhodnocena prostřednictvím tepelných simulací. Pomocí nové metody je dosaženo v podstatě stejných výsledků při stanovení ablatované tkáně jako u jiných přístupů.
|
|
|
Parallelisation of Ultrasound Simulations Using Local Fourier Decomposition
Dohnal, Matěj ; Hrbáček, Radek (referee) ; Jaroš, Jiří (advisor)
This document introduces a brand new method of the 1D, 2D and 3D decomposition with the use of local Fourier basis, its implementation and comparison with the currently used global 1D domain decomposition. The new method was designed, implemented and tested primarily for future use in the simulation software called The k-Wave toolbox, but it can be applied in many other spectral methods. Compared to the global 1D domain decomposition, the Local Fourier decomposition is up to 3 times faster and more efficient thanks to lower inter-process communication, however it is a little inaccurate. The final part of the thesis discusses the limitations of the new method and also introduces best practices to use 3D Local Fourier decomposition to achieve both more speed and accuracy.
|
|
|
Parallelisation of Ultrasound Simulations Using Local Fourier Decomposition
Dohnal, Matěj ; Hrbáček, Radek (referee) ; Jaroš, Jiří (advisor)
This document introduces a brand new method of the 1D, 2D and 3D decomposition with the use of local Fourier basis, its implementation and comparison with the currently used global 1D domain decomposition. The new method was designed, implemented and tested primarily for future use in the simulation software called The k-Wave toolbox, but it can be applied in many other spectral methods. Compared to the global 1D domain decomposition, the Local Fourier decomposition is up to 3 times faster and more efficient thanks to lower inter-process communication, however it is a little inaccurate. The final part of the thesis discusses the limitations of the new method and also introduces best practices to use 3D Local Fourier decomposition to achieve both more speed and accuracy.
|
guest ::
