Home > Search Results: keywords:"Lempel-Ziv"
Search:
Search Tips :: Advanced Search
Search collections:
Sort by: Display results: Output format:
National Repository of Grey Literature 2 records found  Search took 0.01 seconds. 
Biological sequence classification utilizing lossless data compression algorithms
 Kruml, Ondřej ; Provazník, Ivo (referee) ; Škutková, Helena (advisor)
Tato diplomová práce se zabývá možností využití bezeztrátových kompresních algoritmů ke klasifikaci biologických sekvencí. Nejdříve je představena literární rešerše o bezeztrátových kompresních algoritmech, která byla využita k výběru slovníkového algoritmu vytvořeného A. Lempelem a J. Zivem v roce 1976 (LZ77). Tento algoritmus je běžně používán k datové kompresi a v předkládané práci byl modifikován tak, aby umožnil klasifikaci biologických sekvencí. K algoritmu byly navrženy další modifikace, které rozvíjí jeho klasifikační možnosti. V průběhu práce byla sestavena sada datasetů biologických sekvencí, která umožnila podrobné testování algoritmu. Algoritmus byl porovnán s klasickými zarovnávacími metodami: Jukes-Cantor, Tamura a Kimura. Bylo ukázáno, že algoritmus dosahuje srovnatelných výsledků v oblasti klasifikace biologických sekvencí a dokonce je u 20% datasetů překonává. Lepší výsledky dosahuje zejména u sekvencí, jež jsou si vzájemně vzdálené.
Detailed record
Biological sequence classification utilizing lossless data compression algorithms
 Kruml, Ondřej ; Provazník, Ivo (referee) ; Škutková, Helena (advisor)
Tato diplomová práce se zabývá možností využití bezeztrátových kompresních algoritmů ke klasifikaci biologických sekvencí. Nejdříve je představena literární rešerše o bezeztrátových kompresních algoritmech, která byla využita k výběru slovníkového algoritmu vytvořeného A. Lempelem a J. Zivem v roce 1976 (LZ77). Tento algoritmus je běžně používán k datové kompresi a v předkládané práci byl modifikován tak, aby umožnil klasifikaci biologických sekvencí. K algoritmu byly navrženy další modifikace, které rozvíjí jeho klasifikační možnosti. V průběhu práce byla sestavena sada datasetů biologických sekvencí, která umožnila podrobné testování algoritmu. Algoritmus byl porovnán s klasickými zarovnávacími metodami: Jukes-Cantor, Tamura a Kimura. Bylo ukázáno, že algoritmus dosahuje srovnatelných výsledků v oblasti klasifikace biologických sekvencí a dokonce je u 20% datasetů překonává. Lepší výsledky dosahuje zejména u sekvencí, jež jsou si vzájemně vzdálené.
Detailed record

Interested in being notified about new results for this query?
Subscribe to the RSS feed.
Digital Repository :: Search :: Submit :: Personalize :: Help
Powered by Invenio v1.1.2
Maintained by admin.invenio@techlib.cz
This site is also available in the following languages:
Česky  English