| |
|
Vliv fluoranthenu a flurochloridonu na růst, metabolismus a produkci rostlin hrachu (Pisum sativum L.)
Lónová, Kamila
U rostlin hrachu setého (Pisum sativum L.) kultivovaných v Richterově živném roztoku a ošetřených pěti mikromolárním roztokem fluorantenem (FLT) nebo roztokem flurochloridonem (FLU)o stejné koncentraci byly sledovány změny anatomie a morfologie kořenového systému, změny produkčních parametrů a poškození fotosyntetického aparátu, a to pomocí změn kvantového výtěžku elektronového transportu PS II a obsahu fotosyntetických pigmentů. Neméně podstatná byla analýza endogenní hladiny ABA. Hodnocen byl též habitus rostlin. Výrazný vliv na změnu utváření kořenového systému byl zjištěn u obou xenobiotik, výraznější změny však byly vyvolány působením FLU. Vlivem FLU bylo též dosaženo výrazného snížení produkční schopnosti rostlin, v případě působení FLT došlo pouze k jejímu mírnému zhoršení. Obě látky též působily negativně na obsah fotosyntetických pigmentů a fotosyntézu. S nízkým obsahem karotenoidů u experimentálních rostlin souviselo i snížení obsahu ABA v listech.
|
|
Konstrukce výnosové křivky
Antas, Vilém ; Stádník, Bohumil (vedoucí práce) ; Teplý, Petr (oponent)
Cílem této práce je analyzovat matematický aparát nejrozšířenějších metod používaných pro konstrukci výnosových křivek. Klade si za cíl představit nejen různé konstrukční modely, ale také popsat celý proces tvorby a také výhody a nevýhody jednotlivých metod. První kapitola se zaměřuje na obecnou teorii a využití časové struktury úrokových sazeb v praxi. Druhá část se zabývá samotným procesem konstrukce a popisuje nejčastěji používané metody. Poslední kapitola pak zobrazuje reálnou aplikaci vybraných metod na určený dataset a ocenění úrokového derivátu použitím zkonstruovaných křivek.
|
| |
|
Co-registration of chlorophyll fluorescence emission and 3D models of plants
Ryba, Tomáš ; Železný, Miloš
Chlorophyll fl uorescence is a powerful optical reporter signal yielding information about modulation of light use effi ciency. In standard imaging applications, fl uorescence transients are captured in 2 spatial dimensions and in time. Here, we demonstrate that it is possible to combine the information obtained in the 2D-t format with the 3D reconstruction of the entire plant using a process called co-registration. Two diff erent approaches to co-registration are presented here. Th e fi rst one is based on an image registration method, where the precise transformation parameters are iteratively estimated. Th is approach assumes that the initial position of a scanner is known and thus makes the method less general. To remove this assumption, a second approach can be used, which is based on analysis of a known calibration object. Th ere is no need to re-calibrate the system between individual measurements.
|
|
Diagnostika viru hepatitidy C pomocí molekulárně biologických metod
JAKUBCOVÁ, Markéta
Hepatitida C je zánět jater vyvolaný infekcí stejnojmenným virem, který ve 25% případů končí hepatocelulárním karcinomem. V současnosti se rozeznává na 6 různých genotypů s nejméně 50 odlišnými subtypy (3). Virus hepatitidy C rychle podléhá mutacím, výsledkem je, že každý infikovaný jedinec obsahuje směs lehce odlišných variant viru. Unikají kontrole imunitního systému hostitele a z tohoto důvodu často přechází do chronicity. Kvalitativní průkaz je důležitý při zjištění přítomnosti viru, stanovení kvantity viru HCV je důležité při zahájení léčby a hlavně sledování účinnosti léčby (20). Nejčastěji vyšetřujeme krevní sérum nebo plazmu, HCV virus lze diagnostikovat přímo nebo nepřímo. Průkaz anti-HCV protilátek (nepřímý průkaz) metodou Elisa se rutinně provádí ve většině laboratoří a je to základní screening. Detekovatelné anti-HCV protilátky vznikají tři týdny až tři měsíce po primoinfekci (u každého jednotlivce je protilátková odpověď různá), test bývá v časných fázích infekce negativní (21). K průkazu viru se používají mimo jiných i molekulárně biologické metody PCR ? polymerázová řetězová reakce. Pro detekci pomocí PCR je v první fázi třeba vyizolovat virovou RNA (ribonukleovou kyselinu) z biologického materiálu. Viry RNA lze izolovat izolačními přístroji (tzv. izolátory) nebo manuálně s pomocí izolačních kitů (1). Výsledkem může být různý stupeň výtěžnosti a čistoty RNA. Ve své práci jsem používala pouze ruční kolonkovou izolaci. Po získání virové RNA následuje kvalitativní průkaz. Byla použita in house metoda - pomocí RT PCR (PCR s reverzní transkripcí) a následnou PCR se amplifikují specifické úseky virové RNA, které jsou vizualizované gelovou elektroforézou, s použitím ethidium bromidu. Používá se dvoukroková PCR. V prvním kole reakce probíhá reverzní transkripce 30 minut při 50°C, za přítomnosti RNase inhibitoru a enzymu reverzní transkriptázy dojde k přepisu RNA na cDNA, následně k namnožení úseku se specifickými primery. Toto vše je součástí jedné PCR reakce, která probíhá v přístroji tzv. termocycler za přítomnosti specifických primerů, vody, pufru, nukleotidů a specifického enzymu. Pro druhé kolo PCR Nested (zahnízděná PCR) se používají další dvě jiné specifické sekvence primerů, tato PCR se používá pro zvýšení citlivosti a specificity metody. Produkty PCR jsou vizualizované na agarózovém gelu s použitím interkalačního činidla (nejčastěji ethidium bromid) (3). Kvantitativní průkaz pro zjištění hladiny virémie se provádí pomocí real time PCR. Detekce probíhá v reálném čase pomocí fluorescenčních barviv. Barviva jsou zpravidla vázaná na oligonukleotidové sondy, které se specificky vážou na PCR amplifikát. Detekce intenzity fluorescence v průběhu PCR v reálném čase umožňuje průkaz a kvantifikaci produktů. Zároveň je systém schopen identifikovat potenciální PCR inhibici přítomností interní kontroly. Pro kvantifikaci se dodávají externí pozitivní kontroly, s jejichž pomocí lze určit množství viru ve vzorku. Po přidání standard o známé koncentraci do reakce vznikne kalibrační křivka, podle níž lze kvantifikovat vyšetřované vzorky (19). Ve své práci jsem porovnávala 2 izolační soupravy: a) High Pure Viral RNA Kit (Roche) - kit určený k izolaci RNA viru z biologického materiálu (sérum, plazma). V první fázi dochází k lýze biologického materiálu, uchycení RNA na kolonce s membránou, několikanásobné promytí a poté k eluci RNA do vody ? k použití pro real time ? PCR (8). b) QIAamp Viral RNA mini Kit (Qiagen) ? kit je určený k izolaci virové RNA z lidské plazmy nebo séra. Nejprve dochází k lýze biologického materiálu, uchycení RNA na kolonce s membránou, promytí a eluci RNA do vody - k použití pro real time ? PCR (13). Pro zjištění rozdílů v izolaci byly použity vzorky, které byly kvantifikovány pomocí real time PCR. Prokázal se rozdíl ve výtěžcích RNA mezi výše uvedenými soupravami. Vzorky izolované soupravou QIAamp Viral RNA Kit (Qiagen) vykazovaly po kvantifikaci vyšší hodnoty naměřené virové RNA.
|
|
Metody konstrukce výnosové křivky státních dluhopisů na českém dluhopisovém trhu
Hladíková, Hana ; Radová, Jarmila (vedoucí práce) ; Pelikán, Jan (oponent) ; Onder, Štěpán (oponent)
Informace o časové struktuře úrokových sazeb jsou jedním ze základních nástrojů měnové analýzy, neboť poskytují informace o očekáváních trhu ohledně budoucí inflace a nominálních úrokových měr. Výnosové křivky bezkupónových dluhopisů nejsou pozorovatelné přímo na trhu. Pro aproximaci empirických dat pro vytvoření výnosové křivky je třeba vybrat vhodnou matematickou funkci. Zabýváme se metodami užívajícími kubických spline funkcí, lineární kombinaci Fourierových nebo exponenciálních bázových funkcí a parametrickým NelsonSiegelovým modelem. Shrnujeme matematický aparát, který se využívá k těmto aproximacím. Pro nalezení parametrů jednotlivých metod používáme minimalizaci odchylky mezi pozorovanými a spočtenými cenami pomocí nelineárních nejmenších čtverců. Metody jsou testovány na datech z českého dluhopisového trhu. Aplikace vhodné shlazovací funkce a vhodné váhy přiřazené jednotlivým dluhopisům jsou klíčové, pokud chceme vybrat nejlepší metodu podle daných kritérií. Nejvhodnějšími se jeví metody užívající shlazené kubické B-spliny.
|
|
High night temperature-induced accelerated maturation of rice panicles can be detected by chlorophyll fluorescence
Šebela, David ; Quiňones, C. ; Olejníčková, Julie ; Jagadish, K. S. V.
Rice panicle maturation is considered to be highly sensitive to environmental conditions. Since one of the factors accompanying global climate change is increases in minimum night temperatures more pronounced than those in maximum day temperatures, the effect of high night temperature (HNT) on rice panicle maturation was investigated. Two rice genotypes with contrasting HNT responses, N22 (highly tolerant) and Gharib (susceptible), were exposed to control temperatures (ca 23°C) and HNTs (ca 29°C) from flowering until maturity. Loss of photosynthetic activity and/or pigments during rice panicle maturation were evaluated temporally by measuring (i) effective quantum yield of photosystem II efficiency (ΦII), and (ii) steady-state chlorophyll fluorescence level (FS). To prove the accuracy of the new approach presented in this study, several vegetative indices were calculated from reflectance measurements and correlated with fluorescence parameters. It has been observed that ΦII tracks the accelerated maturation of rice panicles exposed to HNT better than does FS. Employing a newly identified chlorophyll fluorescence-based parameter could potentially enable larger genetic diversity scans and identification of novel genotypes with longer panicle maturation periods so as to increase rice yields directly under field conditions.
|
| |
|
Extrakce beta-sitosterolu z kořenů kopřivy superkritickým CO2
Sajfrtová, Marie ; Bártlová, Milena ; Sovová, Helena
Oddenky (tzv. kořeny) kopřivy obsahují řadu nepolárních i polárních biologicky aktivních látek. Z neutrálních lipidů kopřivy je nejvýznamnější beta-sitosterol, užívaný v rostlinných výtažcích proti nadměrnému vypadávání vlasů a při benigní hyperplasii (zvětšení) prostaty. Suché oddenky kopřivy jsme extrahovali superkritickým oxidem uhličitým, nepolárním rozpouštědlem s variabilními vlastnostmi, při tlaku 15-60 MPa a teplotě 40-80 °C. Soxhletovou extrakcí n-hexanem byl stanoven obsah beta-sitosterolu v oddencích 0,28 g/kg. Výtěžek beta-sitosterolu superkritickou extrakcí byl v průměru o 11 % nižší, ale vlivem vyšší selektivity metody se jeho koncentrace oproti hexanovému extraktu zvýšila průměrně o 13 % na 3,8 % hm. Odděleným odběrem extraktu ve vhodně zvoleném časovém rozmezí lze získat frakce s dvojnásobnou i vyšší koncentrací. Matematický model kinetiky extrakce beta-sitosterolu a celkového extraktu umožnil studium systému simulačními výpočty.
Plný tet: SKMBT_C22013110513041 -  PDF
Plný text: content.csg - PDF
|
host ::
