|
|
Stanovení relativní změny délky telomer pomocí qPCR: výhody a nevýhody metodiky a úskalí používaných referenčních markerů
Krajzingrová, Tereza ; Velová, Hana (vedoucí práce) ; Králová, Tereza (oponent)
Telomery, sestávající se z repetitivních sekvencí, chrání konce eukaryotických chromozomů před erozí. V běžných somatických buňkách se telomery zkracují s každým buněčným dělením. Délka telomer přímo odpovídá stárnutí na buněčné úrovni. Rychlost zkracování telomer, a tím rychlost stárnutí organismu, je individuální. Liší se nejen mezi druhy, ale i mezi jedinci, a může být ovlivněna mnoha faktory jako je stres, nemoci, reprodukce, či vliv vnějších podmínek. Ke stanovení délky telomer můžeme použít různé metody a každá z nich má své limitace, které je dobré znát a vyhnout se jejich negativnímu dopadu na získané výsledky. V současnosti patří mezi nejpoužívanější metody kvantitativní PCR (qPCR). Mezi nejdůležitější faktory, které mohou ovlivnit výsledky měření délky telomer pomocí qPCR, je množství vmezeřených (tzv. intersticiálních) telomerických sekvencí, správný výběr referenčního markeru, či následné navržení vysoce specifických primerů. I přesto je qPCR vhodná především pro poměrně rychlé a levné stanovení relativní délky telomer u velkého množství vzorků nemodelových organismů. V práci se věnuji i konkrétním výsledkům studií zabývajících se změnou délky telomer u ptáků a možným příčinám, které dynamiku v délce telomer ovlivňují a to z důvodu, že metoda qPCR je právě ve studiích prováděných na ptácích...
|
host ::
RSS.