|
|
Charakterizace ABC-F proteinu Sco0636 u Streptomyces coelicolor
Pinďáková, Nikola ; Balíková Novotná, Gabriela (vedoucí práce) ; Mikušová, Gabriela (oponent)
Hlavním tématem této diplomové práce jsou ARE (rezistenční) proteiny z ABC-F rodiny druhé třídy ABC proteinů. ARE proteiny udílí rezistenci k antibiotikům, které se váží na velkou ribozomální podjednotku a inhibují tak proteosyntézu. Jedním z ARE proteinů je protein Lmr(C), který je součástí klastru pro biosyntézu linkomycinu u Streptomyces lincolnensis a dle nových výsledků se zdá, že Lmr(C) nemusí být striktně rezistenčním proteinem, ale může mít regulační funkci. Rozhodli jsme se pro studium Sco0636 nejbližšího homologu Lmr(C) u Streptomyces coelicolor, která je modelovým organismem při studiu sekundárního metabolismu. Díky produkci barevných pigmentů, lze sledovat vliv ARE proteinů na sekundární metabolismus přímo na plotnách. Připravila jsem deleční mutantu a kmen s konstitutivní expresí sco0636 a sledovala jsem vliv na fenotyp. Sledovala jsem produkce modrého aktinorodinu a stanovila jsem minimální inhibiční koncentrace k vybraným antibiotikům, které působí na úrovni ribozomu. Zjistila jsem, že Sco0636 udílí vysokou rezistenci k tiamulinu, a byl tak pojmenován jako TiaA. Delece genu zrychlila produkci aktinorodinu a konstitutivní exprese genu naopak produkci zpomalila. Klíčová slova: ABC proteiny, ABC-F proteiny, Lmr(C), translace, rezistence k antibiotikům, Streptomyces coelicolor, aktinorodin
|
|
|
Charakterizace ABC-F proteinu Sco0636 u Streptomyces coelicolor
Pinďáková, Nikola ; Balíková Novotná, Gabriela (vedoucí práce) ; Mikušová, Gabriela (oponent)
Hlavním tématem této diplomové práce jsou ARE (rezistenční) proteiny z ABC-F rodiny druhé třídy ABC proteinů. ARE proteiny udílí rezistenci k antibiotikům, které se váží na velkou ribozomální podjednotku a inhibují tak proteosyntézu. Jedním z ARE proteinů je protein Lmr(C), který je součástí klastru pro biosyntézu linkomycinu u Streptomyces lincolnensis a dle nových výsledků se zdá, že Lmr(C) nemusí být striktně rezistenčním proteinem, ale může mít regulační funkci. Rozhodli jsme se pro studium Sco0636 nejbližšího homologu Lmr(C) u Streptomyces coelicolor, která je modelovým organismem při studiu sekundárního metabolismu. Díky produkci barevných pigmentů, lze sledovat vliv ARE proteinů na sekundární metabolismus přímo na plotnách. Připravila jsem deleční mutantu a kmen s konstitutivní expresí sco0636 a sledovala jsem vliv na fenotyp. Sledovala jsem produkce modrého aktinorodinu a stanovila jsem minimální inhibiční koncentrace k vybraným antibiotikům, které působí na úrovni ribozomu. Zjistila jsem, že Sco0636 udílí vysokou rezistenci k tiamulinu, a byl tak pojmenován jako TiaA. Delece genu zrychlila produkci aktinorodinu a konstitutivní exprese genu naopak produkci zpomalila. Klíčová slova: ABC proteiny, ABC-F proteiny, Lmr(C), translace, rezistence k antibiotikům, Streptomyces coelicolor, aktinorodin
|
|
|
Záchyt Streptococcus agalactiae u těhotných žen a novorozenců
HÁLOVÁ, Eliška
S. agalactiae je běžným komenzálem v nosohltanu, pochvě a trávicím traktu. Právě trávicí trakt je považován za velmi pravděpodobný zdroj vaginální kolonizace. Osídlení touto bakterií je v mnoha případech asymptomatické. S. agalactiae způsobuje řadu infekčních onemocnění u novorozenců a je vedoucí příčinou neonatální morbidity a mortality. Přenos probíhá vertikálně z kolonizované matky na plod. Potenciálním zdrojem GBS infekcí může být také mateřské mléko. Tento druh přenosu je však velmi ojedinělý. S. agalactiae vyvolává infekce nejen u novorozenců, ale také u dospělých, především u osob starších a osob s probíhajícím jiným onemocněním. V teoretické části jsem se zaměřila na dosavadní poznatky o S. agalactiae, na novorozenecké GBS infekce a možnosti jejich prevence. Dále jsem zhodnotila současné možnosti identifikace a diagnostiky S. agalactiae, včetně stanovení citlivosti k antibiotikům. Nastínila jsem současnou situaci zvyšující se rezistence S. agalactiae k makrolidům a linkosamidům a popsala situaci v několika různých zemích. Praktickou část jsem prováděla na bakteriologickém oddělení Nemocnice České Budějovice, a.s., kde jsem se zabývala celým procesem identifikace a diagnostiky S. agalactiae. Nejprve jsem provedla kultivaci, popřípadě také přípravu preparátu pro mikroskopické hodnocení. Dále jsem identifikovala S. agalactiae pomocí CAMP testu, latexové aglutinace nebo metodou hmotnostní spektrometrie MALDI TOF. U kmenů identifikovaných jako S. agalactiae byla provedena citlivost k antibiotikům metodou diskového difuzního testu. Veškeré práce jsem prováděla pod odborným dohledem svého vedoucího bakalářské práce a pracovníků laboratoře podle standardních operačních postupů. Další část mé práce je věnována výsledkům. Jejich statistickým zpracováním jsem zjistila kolonizaci S. agalactiae v populaci těhotných žen. Zaměřila jsem se také na rozložení jednotlivých sérotypů této bakterie u novorozenců. U každého kmene izolovaného od těhotných žen i novorozenců jsem zhodnotila jeho citlivost k penicilinu, ampicilinu, erytromycinu a klindamycinu. Praxí v laboratoři se ukázalo, že nejčastěji užívanými metodami pro identifikaci S. agalactiae jsou CAMP test a hmotnostní spektrometrie MALDI TOF. Latexová aglutinace se dnes příliš často nevyužívá.
|
host ::
RSS.