|
|
Investigating critical mechanisms of oncogenesis using cell model systems
Hušková, Hana ; Stopka, Tomáš (vedoucí práce) ; Macůrek, Libor (oponent) ; Vojtěšek, Bořivoj (oponent)
(CZ) Lidé jsou v průběhu života vystaveni různým faktorům způsobujícím poškození DNA, vedoucí ke změnám v buněčné fyziologii a potenciálně k expanzi imortalizovaného buněčného klonu a vzniku nádoru. Mutace v DNA jsou jak záznamem o působení mutagenních procesů, tak klíčem k biologii a patofyziologii nádorů. Masivně paralelní sekvenování umožňuje sekvenování všech kódujících sekvencí či dokonce celých genomů lidských nádorů. Z těchto dat je možné získat vzorce mutací typické pro jednotlivé mutagenní procesy, stejně jako poukázat na mutace a geny hrající roli při vzniku a vývoji nádoru. Řada popsaných vzorců mutací však nemá známou příčinu a řada známých karcinogenů nemá dosud přiřazen mutační vzorec. Stejně tak se předpokládá, že dosud není známa řada mutací a genů s vlivem na vznik nádoru. Tato disertační práce charakterizuje experimentální systém založený na imortalizaci myších embryonálních fibroblastů (MEF) za působení mutagenu, umožňující určení vzorců mutací daných mutagenů a určení mutovaných genů důležitých pro vznik nádoru. Kultivace buněk MEF vede k jejich senescenci, která může být překonána mutacemi ve funkčně důležitých genech, analogicky ke stádiím vzniku lidských nádorů. Sekvenování kódujících sekvencí 25 imortalizovaných buněčných linií, které vznikly za působení rozličných mutagenů...
|
host ::
RSS.