|
|
Fytoplazmy ovocných dřevin
Návratová, Marie
Tato bakalářská práce se zabývá obecnou problematikou fytoplazem ovocných dřevin. V podkapitolách jsou zpracovány nejnovější poznatky z okruhu detekce fytoplazem a ochraně vůči nim. Dále se práce zaměřuje na tři konkrétní onemocnění. Popisována je obecná charakteristika Pear decline phytoplasma, European stone fruit yellows phytoplasma a Apple proliferation phytoplasma.
|
|
|
Méně známé choroby révy vinné
Baťková, Romana
S rostoucí možností detekce patogenních organismů byly před nedávnem popsány nově objevené onemocnění u révy vinné. Bakalářská práce teoretického charakteru popisuje tyto méně známé choroby, které se objevují v různých pěstitelských oblastech světa. Choroby byly rozděleny podle typu původce na mykózy, bakteriózy, virózy a fytoplazmózy. Jednotlivé kapitoly jsou uvedeny obecným popisem těchto chorob, jejich výskytem, projevem a doporučenou ochranou. Závěrem je naznačeno potenciální nebezpečí těchto patogenů v podmínkách vinohradnictví České republiky.
|
|
|
Detekce fytoplazem pomocí DNA-mikročipu
MARKOVÁ, Jaroslava
Cílem práce bylo optimalizovat metodu detekce fytoplazem pomocí DNA-mikročipu. To zahrnovalo vhodnou metodu izolace genetického materiálu fytoplazmy, vývoj a optimalizaci PCR k namnožení různých skupin fytoplazem, optimalizaci detekce DNA na mikročipu a analýzu sekvencí fytoplazem k návrhu potenciálních lepších prób. PCR byla optimalizována pro sbírkové izoláty, poté i pro přírodní vzorky. Od všech zástupců 16Sr skupin sbírkových izolátů se podařilo získat sekvence a detekovat v nich fytoplazmu pomocí hybridizace. U přírodních vzorků se podařilo detekovat fytoplazmu ve vzorcích řepky olejky (Brassica napus), jetele lučního (Trifolium pretense), třapatky nachové (Echinacea purpurea) a jabloně domácí (Malus domestica). V DNA z hmyzích vektorů to bylo pouze u jediného vzorku s označením 202/6 ze skupiny 16Sr-XII. Sekvence jetele lučního a řepky olejky se shodují s databázovými vzorky skupiny 16Sr-I "Aster yellows".
|
|
| |
|
|
Studium genetické variability fytoplazem
ROHÁČKOVÁ, Helena
Fytoplazmy jsou bakteriální vnitrobuněční rostlinní parazité, způsobují závažné ztráty úrody po celém světě. Fytoplazmy byly zjisštěny v jeteli, vince, hrušních, jabloních a meruňkách. Sekvencován byl gen secA, gen 16S rDNA, mezerník a gen 23S rDNA u pěti izolátů fytoplazem.
|
|
|
Detekce fytoplazem pomocí PCR amplifikace vybraných fragmentů fytoplazmového genomu
MARKOVÁ, Jaroslava
Fytoplazmy jsou bakteriálními patogeny rostlin. Mohou způsobit zničující ztráty výnosu u různých plodin. Pro rychlé odhalení fytoplazmových nákaz je potřeba nalézt spolehlivou detekční techniku. Nejsnazší a nejlevnější technikou je PCR (polymerase chain reaction ? polymerázová řetězová reakce), která slouží k selektivní amplifikaci vybraných oblastí molekuly DNA. Cílem této práce bylo nalezení optimálních primerů k amplifikaci vybraných fragmentů fytoplazmového genomu v jednokrokové PCR a využití této techniky k detekci fytoplazem. Pro tuto studii bylo použito 37 vzorků fytoplazem ze sbírky od prof. Bertaccini. Pomocí optimalizovaných primerů bylo testováno 16 přírodních vzorků. Fytoplazmu se podařilo detekovat v kořenu jahodníku. Výzkum byl umožněn díky podpoře z grantu Grantové agentury ČR, číslo GP 522/09/P545.
|
|
|
Studium diverzity izolátů fytoplazmy proliferace jabloně v České republice.
STREJČKOVÁ, Monika
Fytoplazmy jsou prokaryontní organismy třídy Mollicutes. Dosud byly popsány na více než 800 rostlinných druzích. Mezi hospodářsky nejvýznamnější patří fytoplazma proliferace jabloně, která je řazena do ribozomální podskupiny 16Sr X-A (Apple proliferation, AP,´Candidatus Phytoplasma mali´). AP je považována za karanténní organismus v Evropě a v Severní Americe. Typické symptomy AP jsou: - výrazně zvětšené palisty, které mají morfologii pravého listu -řapík a čepel, okraj palistů je nepravidelně zoubkovaná - malé plody s méně semeny a horší chuťovou kvalitou - předčasné červenání listů, metlovitost, abnormální růst výhonů na podzim, opakované kvetení V předložené práci byla testována DNA vyizolovaná ze stromů podezřelých na přítomnost AP. Stromy pocházely z genofondu, z produkčních výsadeb i výsadeb drobných pěstitelů. Pro detekci fytoplazem byla použita polymerázová řetězová reakce (polymerase chain reaction, PCR) s následnou analýzou délkového polymorfizmu restrikčních fragmentů (restriction fragment length polymorphism, RFLP). Pro detekci a rozlišení subtypů fytoplazem AP se jeví jako uživatelsky nejvhodnější direct PCR s primery rpAP15f/ rpAP15r amplifikující DNA ribozomálních proteinů rpS3 a rpl 22 s následným restrikčním štěpením enzymem AluI.
|
|
|
Detekce a identifikace fytoplazem ve šlechtitelském materiálu hrušní
ROHÁČKOVÁ, Helena
Fytoplazmy jsou baktetriální vnitrobuněční rostlinné patogenní organismy, které způsobují značné ztráty úrody různých plodin po celém světě. Fytoplazmy hrušní byly detegovány s použitím molekulárních metod. RFLP analýza testovaných vzorků odhalila přítomnost původců chřadnutí hrušně, proliferace jabloně, fylodie jetele, a stolburu, a to zvlášť, ale i ve směsných infekcích.
|
host ::
RSS.