|
|
Generalized Moran process
Svoboda, Jakub ; Šámal, Robert (vedoucí práce) ; Balko, Martin (oponent)
Moránův proces je model používaný k simulaci evolučních dynamik. Ve struk- turované populaci se objeví lépe přizpůsobený jedinec, mutant. Evoluce je simu- lována v krocích. V jednom kroku, jedinec je vybrán proporcionálně ke své fitness a rozšíří se na místo svého souseda. V této práci, vysvětlujeme Moránův proces, prezentujeme základní výsledky a definujeme vlastní variantu. Pracujeme v prostředí, kde každý jedinec má fitness v závislosti na svém typu a vrcholu, který obývá. V modifikovaném modelu dokážeme dvě věty o počtu kroků, který proces udělá než se dostane do stabilního stavu. Ukážeme, že na úplném grafu proces udělá polynomiálně mnoho kroků. Najdeme také graf, kde proces udělá expo- nenciálně mnoho kroků ale v normálním modelu jich udělá stejně jako v úplném grafu. 1
|
|
|
Evoluční dynamika rDNA klastrů u členovců s holocentrickými chromozomy
Tymich, Alexandr ; Šťáhlavský, František (vedoucí práce) ; Dalíková, Martina (oponent)
V současné době představují rDNA klastry zobrazené pomocí fluorescenční in situ hybridizace (FISH) jeden ze standardních cytogenetických markerů sloužící k identifikaci homologie chromozomů, což umožňuje stanovit mechanismy a případnou míru přestaveb během karyotypové evoluce studovaných skupin. Tato bakalářská práce předkládá souhrnný přehled variability rDNA klastrů u členovců s holocentrickými chromozomy. Většina doposud zkoumaných skupin (Odonata, Psocoptera, Hemiptera, Buthidae a rod Rhipicephalus) vykazuje poměrně konzervativní počet a pozici rDNA klastrů. Nicméně tento fakt může být způsoben omezeným počtem dostupných dat. Momentálně je nejlépe prozkoumaný řád Lepidoptera, u kterého byla zjištěna poměrně velká variabilita v počtu a pozici rDNA klastrů. Pravděpodobně je to důsledek chromozomové fúze/štěpení, chromozomových přestaveb nebo transpozice rDNA klastrů. Klíčová slova: rDNA klastry, holocentrické chromozomy, fluorescenční in situ hybridizace, členovci, evoluční dynamika, NOR
|
|
|
Generalized Moran process
Svoboda, Jakub ; Šámal, Robert (vedoucí práce) ; Balko, Martin (oponent)
Moránův proces je model používaný k simulaci evolučních dynamik. Ve struk- turované populaci se objeví lépe přizpůsobený jedinec, mutant. Evoluce je simu- lována v krocích. V jednom kroku, jedinec je vybrán proporcionálně ke své fitness a rozšíří se na místo svého souseda. V této práci, vysvětlujeme Moránův proces, prezentujeme základní výsledky a definujeme vlastní variantu. Pracujeme v prostředí, kde každý jedinec má fitness v závislosti na svém typu a vrcholu, který obývá. V modifikovaném modelu dokážeme dvě věty o počtu kroků, který proces udělá než se dostane do stabilního stavu. Ukážeme, že na úplném grafu proces udělá polynomiálně mnoho kroků. Najdeme také graf, kde proces udělá expo- nenciálně mnoho kroků ale v normálním modelu jich udělá stejně jako v úplném grafu. 1
|
host ::
RSS.