|
|
Simulace šíření tepla v mozku s využitím vysokoúrovňových GPGPU technik
Krbila, Martin ; Kadlubiak, Kristián (oponent) ; Jaroš, Jiří (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá akcelerací simulace šíření tepla na grafické kartě. Je zde popsán postup akcelerace existující implementace v Matlabu, která je součástí balíku k-Wave. V práci jsou popsány různé vysokoúrovňové i nízkoúrovňové knihovny pro programovaní na grafických kartách a shrnuty jejich silné a slabé stránky. Byla vytvořena implementace simulace na GPU kompletně pokrývající funkcionalitu původní verze, která dosahuje přibližně stonásobného zrychlení oproti procesorové implementaci v Matlabu. Jako součást této práce byl také vytvořen modul umožňující výpočet diskrétních trigonometrických transformací na grafické kartě, který dosahuje přibližně desetinásobného zrychlení oproti nejlepší procesorové variantě a umožňuje akceleraci simulace s různými okrajovými podmínkami. Výstupem práce je také srovnání výkonu několika verzí základní simulace při využití různých GPGPU technik.
|
|
|
Akcelerace ultrazvukové neurostimulace pomocí vysokoúrovňových GPGPU knihoven
Mička, Richard ; Kadlubiak, Kristián (oponent) ; Jaroš, Jiří (vedoucí práce)
Táto práca sa zaoberá akceleráciou výpočtu simulácie šírenia akustických vĺn z balíku k-Wave pomocou GPGPU knižníc. Ako prvé, sú v práci preskúmané a ohodnotené dostupné vysokoúrovňové GPGPU knižnice. Následne je, po oboznámení sa so súčasným stavom riešenia akcelerácie simulácie v k-Wave, navrhnutý spôsob, ktorým je možné transformovať kód určený pre procesor, do podoby spustiteľnej aj na grafickej karte. Výsledkom tejto práce je aplikácia schopná akcelerovať výpočet simulácie na grafickej karte. V prípade neprítomnosti grafickej karty, je schopná bežať na procesore, s využitím vláknového a SIMD paralelizmu. Táto implementácia je následne ohodnotená z hľadiska výkonnosti, náročnosti a užitočnosti.
|
|
|
Simulace šíření tepla v mozku pomocí knihovny OpenACC
Oškera, Josef ; Kadlubiak, Kristián (oponent) ; Jaroš, Jiří (vedoucí práce)
Cílem této práce je přepsat implementaci šíření tepla v mozkové tkáni naspanou v jazyce Matlab (dostupnou v balíku k-Wave) do jazyka C/C++, akcelerovat ji na GPU za pomoci knihovny OpenACC a CUDA, a následně tyto knihovny porovnat ve výkonnosti a náročnosti implementace. V řešení je popsáno jak programovat grafickou kartu, a jak tyto znalosti aplikovat. Vytvořený program je schopen simulovat šíření tepla na CPU i GPU.
|
|
|
Simulace šíření tepla v mozku s využitím vysokoúrovňových GPGPU technik
Krbila, Martin ; Kadlubiak, Kristián (oponent) ; Jaroš, Jiří (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá akcelerací simulace šíření tepla na grafické kartě. Je zde popsán postup akcelerace existující implementace v Matlabu, která je součástí balíku k-Wave. V práci jsou popsány různé vysokoúrovňové i nízkoúrovňové knihovny pro programovaní na grafických kartách a shrnuty jejich silné a slabé stránky. Byla vytvořena implementace simulace na GPU kompletně pokrývající funkcionalitu původní verze, která dosahuje přibližně stonásobného zrychlení oproti procesorové implementaci v Matlabu. Jako součást této práce byl také vytvořen modul umožňující výpočet diskrétních trigonometrických transformací na grafické kartě, který dosahuje přibližně desetinásobného zrychlení oproti nejlepší procesorové variantě a umožňuje akceleraci simulace s různými okrajovými podmínkami. Výstupem práce je také srovnání výkonu několika verzí základní simulace při využití různých GPGPU technik.
|
|
|
Akcelerace ultrazvukové neurostimulace pomocí vysokoúrovňových GPGPU knihoven
Mička, Richard ; Kadlubiak, Kristián (oponent) ; Jaroš, Jiří (vedoucí práce)
Táto práca sa zaoberá akceleráciou výpočtu simulácie šírenia akustických vĺn z balíku k-Wave pomocou GPGPU knižníc. Ako prvé, sú v práci preskúmané a ohodnotené dostupné vysokoúrovňové GPGPU knižnice. Následne je, po oboznámení sa so súčasným stavom riešenia akcelerácie simulácie v k-Wave, navrhnutý spôsob, ktorým je možné transformovať kód určený pre procesor, do podoby spustiteľnej aj na grafickej karte. Výsledkom tejto práce je aplikácia schopná akcelerovať výpočet simulácie na grafickej karte. V prípade neprítomnosti grafickej karty, je schopná bežať na procesore, s využitím vláknového a SIMD paralelizmu. Táto implementácia je následne ohodnotená z hľadiska výkonnosti, náročnosti a užitočnosti.
|
|
|
Simulace šíření tepla v mozku pomocí knihovny OpenACC
Oškera, Josef ; Kadlubiak, Kristián (oponent) ; Jaroš, Jiří (vedoucí práce)
Cílem této práce je přepsat implementaci šíření tepla v mozkové tkáni naspanou v jazyce Matlab (dostupnou v balíku k-Wave) do jazyka C/C++, akcelerovat ji na GPU za pomoci knihovny OpenACC a CUDA, a následně tyto knihovny porovnat ve výkonnosti a náročnosti implementace. V řešení je popsáno jak programovat grafickou kartu, a jak tyto znalosti aplikovat. Vytvořený program je schopen simulovat šíření tepla na CPU i GPU.
|
host ::
RSS.