Národní úložiště šedé literatury Nalezeno 2 záznamů.  Hledání trvalo 0.00 vteřin. 
Modelling of tick borne enecephalitis virus (TBEV) proteins and their complexes
HALBEISEN, Marco
In this bachelor thesis the focus was on the study of non-structural proteins of the tick-borne encephalitis virus involved in the replicatory process of the virus. Non-structural protein number 3 (NS3) and number 5 (NS5) contain a helicase and an RNA-dependent RNA polymerase domain, respectively, and play a crucial role in the life cycle of the virus. Therefore, they are of interest to develop a potential antiviral drug inhibiting the replication of the pathogen. It has been found that these two proteins form a dimer during the replication of the viral RNA. The aim of the thesis was to identify the exact interaction of the two proteins with existing hydrogen-deuterium mass spectroscopy data as well as modelling the RNA into the complexes. The research was conducted by using computational biology tools including homology modelling using MODELLER, manual modelling in PyMOL and Chimera as well as Molecular Dynamics Simulations in GROMACS.
Příprava a charakterizace vazebných proteinů mimikujících epitopy protilátek neutralizujících virus HIV-1
Šulc, Josef ; Malý, Petr (vedoucí práce) ; Novotný, Marian (oponent)
Tři dekády trvající pandemie viru HIV stála život již desítky milionu lidí, další desítky milionů se s touto nevyléčitelnou chorobou potýkají do dnešního dne. Současné neúspěchy ve vývoji ochranné vakcíny jsou způsobeny zejména extrémní mutační schopností viru, jeho velmi efektivním molekulárním štítem odrážejícím útoky imunitního systému a jeho nesmírnou variabilitou. Významným přelomem posledních let byl popis řady tzv. široce neutralizujících protilátek proti HIV-1, které nesou velmi účinnou a širokou neutralizační odezvu. Dosud se však nepodařilo nalézt cestu k navození vysoké produkce podobně účinných neutralizačních protilátek, které by ochránili imunizované jedince před infekcí a případným rozvojem syndromu AIDS. Tato práce popisuje výsledky výzkumu, který vedl k in vivo i in vitro prokázání funkčnosti konceptu tzv. proteinové mimetiky, tedy schopnosti kopírovat epitop virových povrchových proteinů, a tak vybudit účinnou imunitní odpověď ve formě produkce cílených široce neutralizujících protilátek. Účinek v tomto přístupu přináší rekombinantní vazebné proteiny na bázi proteinového scaffoldu Myomedin. Tato práce popisuje výběr a charakterizaci vazebných proteinů mimikujících epitopy nejúčinnější široce neutralizující protilátky 10E8. Ukazuje, že vazebné afinity vybraných Myomedinových...

Chcete být upozorněni, pokud se objeví nové záznamy odpovídající tomuto dotazu?
Přihlásit se k odběru RSS.