|
|
Chromera velia heme pathway localization
RICHTOVÁ, Jitka
Práce se zaměřuje na lokalizaci hemové dráhy u řasy Chromera velia, která je nejbližším známým fotosyntetizujícím příbuzným parazitů ze skupiny Apicomplexa. Hemová dráha je jednou z esenciálních biochemických drah většiny žijících organismů. Organismy používají pro syntézu hemu enzymu lišící se svým evolučním původem, který odráží jejich složitou evoluční historii. Základem této práce je kombinace in výpočetních a experimentálních lokalizací enzymů hemové dráhy řasy Chromera velia. Ukázali jsme, že lokalizace hemové dráhy v rámci buňky je řízena vícero faktory zahrnující poptávku po produktech dráhy, potřebu přísné regulace a v neposlední řadě i evolučním původem enzymů.
|
|
| |
|
|
In silico characterization of the plastid proteomes of \kur{Chromera Velia\kur{}} and \kur{Vitrella brassicaformis\kur{}}
FAITOVÁ, Tereza
This thesis is focused on identification of the plastid proteome in alveolate algae C. velia and V. brassicaformis. Plastids play an important role in wide scale of biochemical processes. Therefore, targeting of involved enzymes with plastid targeting pre-sequences provide us with better view what function plastid has in the metabolism of chromerids and possibly of their close relatives. The first part of the thesis summarizes the current knowledge about alveolates, chromerids, endosymbiosis, and the principles of protein targeting. The second part describes the in silico analyses done in order to predict the plastid proteomes of both chromerid algae, to compare their plastid metabolism, and to determine the phylogenetic origin of nuclear-encoded plastid proteins.
|
|
|
Study on the chromosome number in the alveolate alga \kur{Chromera velia} by TSA-FISH
VAZAČ, Jan
Tato diplomová práce se zabývá výzkumem počtu chromosomů u alveolátní řasy C. velia. Tento příbuzný kmene výtrusovci se ukázal jako unikátní modelový organismus pro studium tohoto kmene a organely apicoplastu, kterým disponují. Pro lepší porozumění shodných a rozdílných znaků mezi Chromerou a výtrusovci jsou však zapotřebí další studie. První část této práce shrnuje současné vědomosti týkající se ploidie, životního cyklu a organizace genomu u C. velia, a příbuznými kmeny výtrusovců a obrněnek. Druhá část poté popisuje naší snahu o odhalení ploidie a celkového počtu chromosomů u C. velia pomocí fluorescenční in situ hybridizace. S využitím této metody jsme úspěšně stanovili ploidii a také jsme dosáhli významného postupu v odhalení celkového počtu chromosomů.
|
|
|
Mechanism of photoprotection in photosynthetic proteins
KUTHANOVÁ, Eliška
Nefotochemické zhášení je důležitým ochranným mechanismem fotosyntetických proteinů při vysoké intenzitě ozáření. V této práci byla optimalizována izolace nativních světlosběrných antén z řasy Chromera velia za využití metod centrifugace na sacharózovém gradientu, izoelektrické fokusace, iontově výměnné chromatografie a gelové elektroforézy. Dále byla studována schopnost světlosběrných antén indukovat nefotochemické zhášení in vivo a in vitro.
|
|
| |
|
|
Cirkadiánní rytmy u sekundární řasy Chromera velia
JONÁKOVÁ, Martina
Životní cyklus mnoha známých řas je ovlivněn cirkadiánními hodinami. Zdá se pravděpodobné, že také Chromera velia, nejbližší známý fotosyntetický příbuzný apixomplexům, používá cirkadiánní oscilátor. Testovali jsme, zda kolísání abundance bičíkatých stádií (zoospor) je řízeno cirkadiánními hodinami. Tento rytmus je stabilnídokonce i v konstantních světelných podmínkách. Dále byly osekvenovány tři geny kryptochromů a následně byly fylogeneticky analyzovány. Dv ay nich byly klasifikovány jako CRY-DASH třetí jako CRY-DASH-like. Rytmičnost exprese CRY-DASH v C. velia byla také zkoumána. Hladina exprese byla rovněž testována v konstantních světelných podmínkách . Je možné, že exprese těchto genů je spojená s cirkadiánním oscilátorem. Toto je první studie cirkadiánních hodin v C. velia.
|
host ::
RSS.