|
|
Přesná segmentace obrazových dat
Svoboda, Jan ; Marcoň, Petr (oponent) ; Mikulka, Jan (vedoucí práce)
Práce pojednává o tvorbě rozšiřujícího modulu pro platformu 3D Slicer. Jádro modulu je implementací klasifikátoru Support Vector Machines, jenž je využíván k segmentaci obrazových dat. Obrazová data byla poskytnuta lékaři z Fakultní nemocnice Brno Bohunice. Jedná se obrazové sekvence páteře pořízené pomocí dvou modalit, tedy výpočetní tomografie a magnetické rezonance. Cílem práce bylo tato data zpracovat, konkrétněji pak provést převzorkování, prostorové srovnání a následnou registraci. Obrazy pořízené výpočetní tomografií pak díky svému dostatečnému kontrastu poskytují autorům možnost lépe odhadnout segmentaci kostní tkáně od okolního prostředí i pro obrazy pořízené pomocí magnetické rezonance dosahujících menšího kontrastu. Pro kontrastní obrazy pořízené pomocí výpočetní tomografie bylo dosaženo odpovídajících výsledků, u predikovaných masek méně kontrastních obrazů se tento nedostatek projevil hrubými nepřesnostmi.
|
|
|
Rozšiřující modul platformy 3D Slicer pro segmentaci tomografických obrazů
Chalupa, Daniel ; Jakubíček, Roman (oponent) ; Mikulka, Jan (vedoucí práce)
Tato práce pojednává o využití strojového učení při úlohách klasifikace medicínských obrazů. Obsahuje literární rešerši pojednávající o klasických a moderních metodách segmentace obrazů. Hlavním cílem práce je navržení a vytvoření rozšíření pro platformu 3D Slicer. Rozšíření využívá strojové učení ke klasifikaci obrazů dle zadaných parametrů. Testování rozšíření probíhá na reálných tomografických obrazech z nukleární magnetické rezonance a sleduje přesnost klasifikace a využitelnost v praxi.
|
|
|
Segmentace tomografických dat v prostředí 3D Slicer
Korčuška, Robert ; Dvořák, Pavel (oponent) ; Mikulka, Jan (vedoucí práce)
Táto práca obsahuje základný teoretický rozbor segmentácie obrazu pomocou techniky SVM, teóriu klasifikácie dát a popis programu 3D Slicer. Práca popisuje spracovanie medicínskych obrazov a demonštruje problematiku segmentácie týchto obrazov. Obsahuje návrh a implementáciu metódy SVM v programe 3D Slicer ako rozširovací modul programu. SVM metóda je porovnaná s jednoduchými segmentačnými metódami programu 3D Slicer. Experimentálne je overená kvalita segmentácie metódou SVM na reálnych subjektoch.
|
|
| |
|
|
Analýza využití programu 3D slicer pro výpočtové modelování v biomechanice
Kratochvílová, Hana ; Marcián, Petr (oponent) ; Vosynek, Petr (vedoucí práce)
Předkládaná bakalářská práce se zabývá freewarovým programem 3D Slicer a jeho využitím pro oblast biomechaniky. Úvodní část je věnována seznámení s programem, jeho možnostmi a funkcemi a stručnému vysvětlení pojmů výpočetní tomografie a magnetická rezonance. V následující kapitole je detailně předvedeno modelování konkrétního objektu z dodaných CT snímků pomocí tohoto softwaru, popsány funkce použitých nástrojů a porovnání modelů geometrií v závislosti na zvoleném rozsahu stupňů šedi v programu Gom Inspect. Poslední částí této práce je import 3D Slicerem vygenerovaných modelů geometrie kostí femur a pelvis do MKP platformy ANSYS Workbench, jejich preprocessing, následné zatížení femuru a vyhodnocení výsledků.
|
|
|
Podpůrné zpracování tomografických dat pro 3D Slicer
Dašek, Filip ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Čmiel, Vratislav (vedoucí práce)
Diplomová práce shrnuje dostupné programy pro vizualizaci a segmentaci biomedicínských dat. Hlavní zaměření je na open source software 3D Slicer, u kterého jsou popsány všechny hlavní moduly a dostupné nástroje pro zpracování a segmentaci 3D obrazů. Čtenář je také seznámen s možností vytváření nových modulů a funkcí ve Sliceru za použití programování v Pythnu. V praktické části je vytvořen modul pro rychlou a efektivní segmentaci srdce a jeho částí pomocí metody Watershed. Modul obsahuje nástroje pro předzpracování CT snímků a automatický post-processing vysegmentovaných čátí srdce. Grafické rozhraní bylo vytvořené pomocí QT designeru. V testovací části jsou prezentovány výsledky segmentací. Při stejných vstupech dosahuje segmentace pomocí vytvořeného modulu lepších výsledků, než nabízená možnost ve 3D sliceru.
|
|
|
Supervised Segmentation For 3D Slicer
Chalupa, Daniel
The purpose of this work is to introduce an extendable framework for training and usage of machine learning algorithms. This framework is bundled in an extension for 3D Slicer that is to be used for medical images segmentation. An example usage of the extension is also provided.
|
|
|
Přesná segmentace obrazových dat
Svoboda, Jan ; Marcoň, Petr (oponent) ; Mikulka, Jan (vedoucí práce)
Práce pojednává o tvorbě rozšiřujícího modulu pro platformu 3D Slicer. Jádro modulu je implementací klasifikátoru Support Vector Machines, jenž je využíván k segmentaci obrazových dat. Obrazová data byla poskytnuta lékaři z Fakultní nemocnice Brno Bohunice. Jedná se obrazové sekvence páteře pořízené pomocí dvou modalit, tedy výpočetní tomografie a magnetické rezonance. Cílem práce bylo tato data zpracovat, konkrétněji pak provést převzorkování, prostorové srovnání a následnou registraci. Obrazy pořízené výpočetní tomografií pak díky svému dostatečnému kontrastu poskytují autorům možnost lépe odhadnout segmentaci kostní tkáně od okolního prostředí i pro obrazy pořízené pomocí magnetické rezonance dosahujících menšího kontrastu. Pro kontrastní obrazy pořízené pomocí výpočetní tomografie bylo dosaženo odpovídajících výsledků, u predikovaných masek méně kontrastních obrazů se tento nedostatek projevil hrubými nepřesnostmi.
|
|
|
Analýza využití programu 3D slicer pro výpočtové modelování v biomechanice
Kratochvílová, Hana ; Marcián, Petr (oponent) ; Vosynek, Petr (vedoucí práce)
Předkládaná bakalářská práce se zabývá freewarovým programem 3D Slicer a jeho využitím pro oblast biomechaniky. Úvodní část je věnována seznámení s programem, jeho možnostmi a funkcemi a stručnému vysvětlení pojmů výpočetní tomografie a magnetická rezonance. V následující kapitole je detailně předvedeno modelování konkrétního objektu z dodaných CT snímků pomocí tohoto softwaru, popsány funkce použitých nástrojů a porovnání modelů geometrií v závislosti na zvoleném rozsahu stupňů šedi v programu Gom Inspect. Poslední částí této práce je import 3D Slicerem vygenerovaných modelů geometrie kostí femur a pelvis do MKP platformy ANSYS Workbench, jejich preprocessing, následné zatížení femuru a vyhodnocení výsledků.
|
|
|
Rozšiřující modul platformy 3D Slicer pro segmentaci tomografických obrazů
Chalupa, Daniel ; Jakubíček, Roman (oponent) ; Mikulka, Jan (vedoucí práce)
Tato práce pojednává o využití strojového učení při úlohách klasifikace medicínských obrazů. Obsahuje literární rešerši pojednávající o klasických a moderních metodách segmentace obrazů. Hlavním cílem práce je navržení a vytvoření rozšíření pro platformu 3D Slicer. Rozšíření využívá strojové učení ke klasifikaci obrazů dle zadaných parametrů. Testování rozšíření probíhá na reálných tomografických obrazech z nukleární magnetické rezonance a sleduje přesnost klasifikace a využitelnost v praxi.
|
host ::
RSS.